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李晓蕾

作品数：5 被引量：3H指数：1
供职机构：辽宁师范大学化学化工学院更多>>
发文基金：国家自然科学基金辽宁省高等学校优秀人才支持计划更多>>
相关领域：理学更多>>

合作作者

文献类型

  • 4篇期刊文章
  • 1篇会议论文

领域

  • 5篇理学

主题

  • 3篇三体
  • 3篇偶极
  • 3篇分子
  • 2篇极化作用
  • 2篇分子间
  • 1篇水分子
  • 1篇氢键
  • 1篇氢键复合物
  • 1篇脱氧
  • 1篇脱氧核糖
  • 1篇极化
  • 1篇核糖
  • 1篇分子模拟
  • 1篇复合物
  • 1篇N
  • 1篇H

机构

  • 5篇辽宁师范大学

作者

  • 5篇王长生
  • 5篇李晓蕾
  • 1篇杨微

传媒

  • 2篇高等学校化学...
  • 1篇辽宁师范大学...
  • 1篇物理化学学报
  • 1篇第十三届全国...

年份

  • 1篇2021
  • 1篇2019
  • 2篇2017
  • 1篇2015
共 5 条 记 录，以下是 1-5
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排序方式：
醇及脱氧核糖与水分子间三体作用强度的快速准确计算
2021年
快速准确预测醇及脱氧核糖分子与水形成的氢键复合物的三体作用强度,对准确模拟水环境下蛋白质和DNA的结构和功能至关重要.基于对多体极化作用的理解,在可极化偶极-偶极作用模型(PBFF)基础上,将体系中的极性化学键视为化学键偶极,通过模拟键偶极的极化计算了醇及脱氧核糖与水分子形成的氢键复合物的三体作用能.通过拟合甲醇与水氢键复合物的三体作用能随分子间距离变化的能量曲线确定了所需的参数.将模型和所确定的参数应用于计算更多的甲醇、乙醇及脱氧核糖与水氢键复合物的三体作用能,检验了模型的准确性和参数的可转移性.计算结果表明,可极化偶极-偶极作用模型及所确定的参数能够较好地预测具有不同结构的氢键复合物的三体作用强度,其精度可与MP2方法的计算精度相当.
李晓蕾孙云娇唐颖王长生
关键词：氢键复合物极化作用
水团簇(H_2O)_n中多体作用强度与水分子间距的关系被引量：3
2015年
使用高精度从头算方法(含基组重叠误差校正)计算了水团簇(H_2O)_n(n=8,10,16,20,22,24)中的所有二体、三体和四体作用能,分析了水团簇中的多体效应.研究表明,二体作用对体系总作用能的贡献高达70%以上,三体作用对总作用能的贡献可高达25%,四体作用在总作用能中所占比例不超过3%,五体及以上多体作用能在总作用能中所占比例更小,不超过0.5%.本文研究还表明,两个水分子间距小于0.68 nm的二体作用、三个和四个水分子中最近的两个水分子间距小于0.31 nm的三体和四体作用对体系总作用能的贡献高达99.4%.因此,以生物体系为对象的分子模拟方法应该具备准确地模拟两个水分子间距小于0.68 nm的二体作用、三个和四个水分子中最近的两个分子间距小于0.31 nm的三体和四体作用的能力.
杨微李晓蕾王长生
可快速计算水团簇三体作用强度的新方法被引量：1
2019年
将水分子视为由2个O—H键偶极构成,再将水分子间的三体作用视为长程诱导作用和短程校正之和,使用Thole模型计算长程诱导作用,通过同时考虑不同水分子间的置换和同一个水分子中2个键偶极间的置换计算短程校正,从而提出了一个可快速计算水团簇三体作用强度的新方法.根据已报道的12347个水三聚体的结构和CCSD(T)三体作用能,确定了该方法所需参数.将该方法和所确定的参数应用于67个水团簇体系,计算这些体系的三体作用能,并与CCSD(T),MP2,M06-2X方法的计算结果进行比较.结果表明,相对于CCSD(T)方法的总三体作用能,本文方法的均方根偏差(RMSD)仅为3. 32 k J/mol,平均相对偏差(MRD)仅为2. 43%;对较大水团簇体系,该方法计算精度稍优于MP2方法,明显优于M06-2X方法,并且更快捷高效.
李晓蕾王长生
快速准确预测水团簇的三体作用能
准确描述水团簇的多体作用能对于正确理解许多化学、物理现象,正确解释生物化学反应具有重要的意义。常用的对势作用模型由于忽略了多体作用,无法被应用到复杂的环境和体系中。研究表明,在多体作用中,三体作用最为重要,四体及以上作用...
李晓蕾郝强王长生
文献传递
应用可极化偶极-偶极作用模型快速计算分子间非键作用强度
2017年
非键作用广泛存在于生物体系中,对生物分子的结构和性能有重要影响,快速准确预测这些非键作用强度具有重要科学意义.为了实现快速计算分子间非键作用强度,提出了可极化偶极-偶极作用模型.为了进一步测试可极化偶极-偶极作用模型的适用范围,将该模型应用于更多的含有有机和生物小分子的非键复合物体系.计算结果表明:可极化偶极-偶极作用模型的预测结果很好地重复了高精度从头计算计算结果,其预测能量时的计算精度至少与M06-2X和M06-2X-D3方法计算精度相当,优于AMBER99和AMOEBA方法.说明可极化偶极-偶极作用模型可望在生物分子体系的分子模拟领域得到应用.
王长生李晓蕾高希婵
关键词：极化作用分子模拟
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