陈学书 作品数:7 被引量:18 H指数:3 供职机构: 贵州医科大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 贵州省科技计划项目 贵阳市科学技术计划项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
幽门螺杆菌东、西方株CagA的序列差异及其对胃癌细胞生长与凋亡的影响 被引量:7 2018年 【背景】幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)是胃癌的主要致病因素,其分泌的细胞毒素相关基因A蛋白(Cytotoxin associated gene A,CagA)是目前已知唯一能被H.pylori注入胃上皮细胞并模拟细胞内蛋白发挥作用的癌蛋白,参与胃癌的发生发展。【目的】比较H.pylori东亚株和西方株CagA结构差异,初步探讨H.pylori-CagA对胃癌细胞增殖与凋亡的影响。【方法】对H.pylori东亚株和西方株CagA的核酸及氨基酸序列进行生物信息学分析,构建含东亚株和西方株cagA基因的真核表达载体,转染胃癌细胞AGS,用Western blot法检测CagA蛋白的表达,用CCK8法测定细胞的生长曲线,流式细胞术检测细胞凋亡。【结果】生物信息学分析发现H.pylori东亚、西方菌株CagA的核酸序列和氨基酸序列均存在特征性差异。构建了含东亚、西方菌株cagA基因的表达载体[命名为GZ7/cagA(东亚株)和26695/cagA(西方株)]。与空载体组比较,GZ7/cagA和26695/cagA转染组均表达CagA蛋白,两组比较表达量无显著性差异,GZ7/cagA转染组细胞生长显著增加,而26695/cagA转染组细胞生长显著降低(P<0.05)。GZ7/cagA转染组、26695/cagA转染组细胞的凋亡率分别为7.23±0.96及9.17±1.40,均高于空载体组(5.03±0.63),差异有统计学意义(P<0.05)。【结论】东亚株与西方株CagA之间有结构和功能的差异,东亚株CagA能促进细胞增殖,而西方株CagA却抑制细胞增殖,但两者均能促进细胞凋亡。 龙妮娅 熊林 熊林 赵艳 赵艳 袁航 袁航 李雅洁 李雅洁关键词:幽门螺杆菌 CAGA 胃癌 细胞增殖 幽门螺杆菌感染促进胃癌相关成纤维细胞的活化及其与胃癌细胞的互作研究 目的:探讨幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori或HP)感染在胃癌癌周正常成纤维细胞(Normal fibroblasts,NFs)活化成肿瘤相关成纤维细胞(Cancer-associate... 陈学书关键词:胃癌 幽门螺杆菌 IL-8 文献传递 DKK1对胃癌AGS细胞增殖、周期和凋亡的影响 被引量:4 2019年 目的:探讨沉默厚体1(DKK1)基因对胃癌AGS细胞增殖、周期和凋亡的影响及其作用机制。方法:构建DickkopfsiRNA(DKK1-siRNA)稳定转染细胞株,提取稳定转染细胞的RNA及总蛋白,qPCR和WB实验分别检测DKK1 mRNA及蛋白的表达水平。实验分为空白对照(Control)组、阴性对照(shNC)组及沉默DKK1(DKK1-shRNA)组,CCK-8实验检测各组培养0、24、48、72、96、120、144 h后AGS细胞的增殖情况,流式细胞术检测细胞周期和细胞凋亡水平。检索HPA数据库,分析DKK1与胃癌临床病理的关系。结果:成功建立了稳定沉默DKK1基因的胃癌细胞株AGS,证实DKK1-shRNA组细胞中DKK1 mRNA及蛋白表达水平分别比Control组和shNC组降低到72%和47%(均P<0.05)。细胞增殖曲线显示,与Control和shNC组比较,DKK1-shRNA组细胞培养72h后其增殖显著降低(P<0.05)。与shNC组比较,DKK1-shRNA组S期细胞从32.06%降低到25.87%,G2/M期细胞由8.49%上升到21.26%,细胞凋亡率从10.34%上升到20.65%,差异均有统计学意义(均P<0.05)。HPA数据库的分析显示,胃癌组织中DKK1 mRNA水平显著高于胃正常组织,DKK1 mRNA的高表达与胃癌患者生存率呈负相关(均P<0.05)。结论:沉默DKK1基因可抑制胃癌AGS细胞的增殖,阻滞细胞于G2/M期并促进细胞凋亡;DKK1在胃癌中发挥促癌作用。 骆梅 周建奖 王琴容 王琴容 陈学书 陈学书 谢渊 谢渊关键词:胃癌 AGS细胞 增殖 细胞周期 凋亡 幽门螺杆菌东、西方株CagA的结构差异及其基因表达研究 被引量:1 2018年 目的比较幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)东、西方株CagA蛋白的结构差异,探讨其致病性差异的原因。方法微需氧培养Hp东、西方株各3株,获取cagA全长序列,用DNA Star和MEGA6进行氨基酸序列和构成比对。PT-PCR和Western blot检测东、西方株中CagA和尿素酶及其基因的表达。RT-qPCR检测东、西方株中8个基因的表达并进行分析。结果成功培养并鉴定Hp临床株4株,3株为东方株,1株为西方株。序列比对分析东、西方株中CagA氨基酸全长序列有明显差异。丙氨酸、精氨酸和苏氨酸在东方株中显著高于西方株:分别为88和83(t=5.303,P=0.006)、32和25(t=3.528,P=0.025)、57和50(t=3.951,P=0.017);组氨酸、赖氨酸、蛋氨酸、谷氨酰胺和缬氨酸在东方株显著低于西方株:分别为13和17(t=8.485,P=0.001)、137和147(t=11.72,P=0.000)、12和20(t=9.449,P=0.001)、59和63(t=4.472,P=0.011)、59和63(t=6.5,P=0.003)。尿素酶α基因在6株Hp中均有表达,但有2株Hp不表达CagA和尿素酶β。定量PCR结果显示,东方株尿素酶α基因、LPS合成蛋白基因及鞭毛钩蛋白FlgE基因高表达,而西方株中尿素酶辅助蛋白Ureh基因、鞭毛合成蛋白FlhA基因及膜蛋白基因高表达(P<0.05)。结论 Hp东、西方株在CagA结构及基因表达存在差异性,推测可能是Hp东方株致病性更强的原因之一。 张晓怡 周建奖 李雅洁 赵艳 陈学书 龙妮娅 王琴容 谢渊关键词:幽门螺杆菌 CAGA 尿素酶 一种简便的幽门螺杆菌液体培养法的构建 被引量:3 2018年 目的:建立一种简便、有效的幽门螺杆菌(H.pylori)的液体培养法。方法:取脑心浸液9 m L、胎牛血清1 m L、H.pylori选择剂(万古霉素、头孢磺啶、甲氧氨苄嘧啶及两性霉素B)400μL制成H.pylori液体培养基,将H.pylori接种于H.pylori液体培养基,在厌氧罐中通过微需氧袋建立微需氧条件,于37℃振荡培养3 d,同时设立传统固体培养基培养的H.pylori作为对照;观察2种方法培养的H.pylori生长状况及H.pylori形态,比较2种方法培养的H.pylori的尿素酶、氧化酶及触酶试验结果。结果:固体培养到第3天时,H.pylori生长良好,哥伦比亚血琼脂平板上见透明、针尖样菌落形态;液体培养第3天时可见培养基明显浑浊,涂抹少量菌液于无抗生素的哥伦比亚血琼脂平板培养,肉眼未见污染菌生长,并有透明、针尖样的菌落长出;革兰染色后,固体培养基中的H.pylori为螺旋状、海鸥状、S状弯曲菌或短杆菌;液体培养基中的H.pylori则多为螺旋短杆状、亦见部分长丝状细菌,有的互相缠绕聚集成团,有的散在分布;取两种方法培养的H.pylori菌进行尿素酶、氧化酶及触酶试验,结果均为阳性。结论:成功建立一种简便、有效的H.pylori液体培养法,细菌生长良好,且H.pylori形态变长。 李雅洁 张晓怡 周建奖 赵艳 龙妮娅 陈学书 王琴容 程薇 谢渊关键词:幽门螺杆菌 革兰氏染色 幽门螺旋杆菌cagA基因失活突变株的构建 被引量:1 2015年 目的:通过同源重组基因失活方法,构建幽门螺旋杆菌(H.pylori)cag A基因失活突变株。方法:使用分子克隆方法构建包含cagA基因上、下游同源臂及氯霉素转乙酰基酶(CAT)的自杀型cag A基因靶向失活质粒pHG1,经PCR验证后将该质粒电转化入H.pylori 11639菌株中,通过氯霉素抗性筛选出cagA基因失活突变株。结果:pHG1质粒构建成功并转化进入H.pylori 11639菌株,氯霉素筛选获得cagA基因组区段发生重组的Δcag A突变株(Δcag A::gro EL-cat);PCR结果表明,cagA基因突变株构建成功。结论:使用自杀型同源重组质粒pHG1成功构建幽门螺旋杆菌(H.pylori)cag A基因失活突变株。 洪伟 陈学书 吴昌学 郜双林 赵艳 谢渊 陈峥宏 官志忠 周建奖关键词:幽门螺杆菌 质粒 胃癌组织中肿瘤相关成纤维细胞与正常成纤维细胞之间转录组学研究及验证 被引量:3 2018年 胃癌组织中肿瘤相关成纤维细胞(carcinoma associated fibroblasts,CAFs)是胃癌微环境的重要成分,主要来源于正常成纤维细胞(normal fibroblasts,NFs)的活化,对胃癌的发生发展有重要作用,但是两者之间的基因表达差异并不完全清楚。本研究选取从人胃癌组织中分离获得的CAFs及NFs各3组,进行转录组学研究,筛选出3组细胞中交集且差异倍数较大的基因12个,用Omicsbean在线工具对差异基因进行Gene Ontology(GO)功能及KEGG通路富集,构建蛋白质相互作用调控网络;最后用RT-qPCR验证CAFs和NFs中差异基因的表达。结果显示,筛选出的12个差异表达基因主要参与NF-κB信号、炎症、细胞黏附、细胞表面受体和细胞因子等功能,上述功能均与肿瘤的发生发展密切相关。RT-qPCR检测发现,与NFs相比,CAFs中BCL2A1、NKX3-2、CXCL12、TNFAIP3、FOS、CDH4及CLDN1表达上调;ATF3、CYFIP2、CCL11、KLF2及GDF15基因表达下调,差异均具有统计学意义(P<0.05)。结果提示,胃癌CAFs与NFs中存在肿瘤相关的差异表达基因,这些差异基因可能在胃癌微环境中发挥重要作用。 陈学书 陈学书 龙妮娅 李雅洁 李雅洁 李雅洁 谢渊 赵艳关键词:胃癌 肿瘤相关成纤维细胞 转录组学 生物信息学