- 甲状腺发育不全的先天性甲状腺功能减退患儿甲状腺激素受体β基因突变研究被引量:3
- 2015年
- 目的:研究山东地区甲状腺发育不全(TD)的先天性甲状腺功能减退(CH)患儿甲状腺激素受体β(TRβ)基因突变类型及特点,为基因诊断及产前诊断提供理论依据。方法通过山东省新生儿筛查系统选取山东省60例 TD 的 CH 病例,提取患儿外周静脉血白细胞全基因组 DNA,用8对序列特异性引物对 TRβ基因的第6-12外显子进行 PCR 扩增,扩增后运用一代测序法(Sanger 测序法)对 PCR 产物直接进行测序。测序结果用 DNA MAN 软件与 TRβ基因的参考序列[美国国立生物技术信息中心( NCBI)Reference Sequence:NC 000003.12]进行比对,结合比对结果分析是否存在基因突变。结果分析外显子测序结果,在60例患者中并未发现 TRβ基因突变,但在第9外显子和第6外显子区分别发现1个单核苷酸多态性( SNP)位点(rs3752874,c.735C ﹥ T;rs79220627,c.162G ﹥ A),经分析,这2个 SNP 位点均为同义突变( Phe→Phe;Ser→Ser),并未引起相应氨基酸发生改变。结论山东地区 TD 的 CH 患者中 TRβ基因突变率低,可能不是该地区TD 的 CH 患者的主要突变类型。
- 臧红伟董丽萍臧玉翠柴建阎胜利刘世国葛银林
- 关键词:先天性甲状腺功能减退甲状腺激素受体突变
- 有甲状腺大的先天性甲状腺功能减退症患儿双氧化酶成熟因子1基因突变研究被引量:2
- 2016年
- 目的对山东地区有甲状腺大的先天性甲状腺功能减退症(congenital hypothyroidism,CH)患儿双氧化酶成熟因子1(DUOXA1)基因进行突变筛查,阐明DUOXA1基因突变类型及特点,为CH的基因诊断及治疗提供理论依据。方法通过山东省新生儿筛查系统选取山东省52例有甲状腺大的CH患儿及100例健康对照者,抽取外周静脉血,提取白细胞全基因组DNA,采用8对序列特异性引物,运用PCR扩增与直接测序法对DUOXA1基因的全部编码序列(codingsequence,CDS)进行突变筛查。测序结果与DUOXA1基因的美国国立生物技术信息中心参考序列:NG_033105.1进行比对,并对发现的单核苷酸多态性(single nucleotide polymor—phisms,SNP)位点的基因频率进行,检验。结果在52例有甲状腺大的CH患儿及100例健康对照CDS区序列中均未发现突变,但在9例患儿及11例健康对照中的第7外显子发现1个SNP位点(rs75981505,c.398G〉T)为错义突变,导致密码子由CGC突变为CTC,相应133位氨基酸由精氨酸变为组氨酸(p.Arg133His)。2组SNP基因频率比较,差异无统计学意义(17.3%比11.0%,x^2=1.24,P〉0.05)。结论DUOXA1基因在山东地区有甲状腺大CH患儿突变率低,可能不是该地区伴甲状腺大CH患儿的主要病因。
- 董丽萍臧红伟韩文秀臧玉翠阎胜利刘世国葛银林
- 关键词:先天性甲状腺功能减退症突变
- 先天性甲状腺功能减退症患儿GLIS3基因突变研究被引量:9
- 2018年
- 目的 研究先天性甲状腺功能减退症(CH)患儿GLIS3基因突变的类型和特点,为CH患儿的早期诊断及治疗提供理论依据.方法 选取2007年2月至2016年11月山东地区50例CH患儿,并提取其外周血中白细胞全基因组DNA,用Primer5.0软件设计11对序列特异性引物对GLIS3基因第2~11外显子进行聚合酶链反应扩增,对扩增产物采用一代测序法(Sanger测序法)进行直接测序.采用DNA MAN软件与GLIS3基因的参考序列(美国国立生物技术信息中心Reference Sequence:NC_000009.12)进行序列比对分析,根据比对结果进行基因突变筛查.结果 50例确诊为CH的新生儿中,男22例,女28例,男女比例为1.0∶1.3;年龄(2.5±0.5)岁;甲状腺发育不良、缺如、异位的比例分别为12%(6/50例)、46%(23/50例)、42%(21/50例).在1例甲状腺缺如患儿第10外显子区发现GLIS3基因cDNA的2 507位点发生了C>A的突变(c.C2507A),导致第836密码子的脯氨酸变为谷氨酰胺(p.P836Q).此突变为杂合型的错义突变.在另1例甲状腺缺如患儿第2外显子区发现一个GLIS3突变体(rs780019691,c.C289T),该位点为无义突变,导致第97密码子的精氨酸变为终止密码子(p.R97X).结论 山东地区CH患儿中GLIS3基因突变率较低,且基因型与表型关系尚不明确,需进一步研究.
- 梁新萍蔡仁梅刘文淼杨成宇臧玉翠刘世国管洪在
- 关键词:先天性甲状腺功能减退症基因突变突变体
- 一例青少年型异染性脑白质营养不良患者的基因变异分析被引量:1
- 2022年
- 目的分析一例青少年型异染性脑白质营养不良病(metachromatic leukodystrophy,MLD)患儿的芳基硫酸酯酶A(arylsulfatase A,ARSA)基因的变异情况。方法收集先证者的临床资料,采集先证者及其他家系成员的外周静脉血样并提取基因组DNA。通过全外显子组测序确定可疑致病变异后,应用Sanger测序在该家系中进行验证。通过氨基酸多序列比对和蛋白三维模型预测对变异的致病性进行分析。结果患者携带ARSA基因c.257G>A(p.R86Q)和c.467del(p.G156Afs*6)复合杂合变异,其中c.467del(p.G156Afs*6)移码变异为尚未报道的致病变异。氨基酸多序列比对表明c.257G>A(p.R86Q)变异位点在各种属间高度保守。经蛋白三维结构建模分析发现变异体c.467del(p.G156Afs*6)蛋白构象发生变化导致原有功能的丧失。结论本研究发现新的基因变异位点,扩宽了MLD的变异谱,有助于进一步了解基因型与表型之间的关系,加深对于该病的认识。
- 张肖李苗苗马建华臧玉翠王敬丽徐瑛蕾沈露刘世国
- 关键词:异染性脑白质营养不良生物信息学分析
- 先天性甲状腺功能减退症患儿FOXE1基因突变研究被引量:2
- 2016年
- 目的研究山东地区先天性甲状腺功能减退症(CH)伴甲状腺发育不全患儿转录因子2(FOXE1)基因突变类型及特点,为CH的诊断及治疗提供理论依据。方法选取60例CH伴甲状腺发育不全患儿,提取外周静脉血基因组DNA,采用PCR扩增与直接测序技术,对FOXE1基因全部编码序列进行突变筛查。结果在60例先天性甲状腺功能减退症伴甲状腺发育不全患者外显子测序中未发现基因突变位点,在6例患者中发现1个单核苷酸多态性(SNP)位点(rs755282859,c.483G>A),变异频率为10%。结论 FOXE1基因突变率较低,可能不是山东地区CH伴甲状腺发育不全的主要原因。
- 陈倩卢洪涛臧玉翠刘璐郭明贞刘世国阎胜利
- 关键词:先天性甲状腺功能减退症突变单核苷酸多态
- 一个甲基丙二酸血症家庭的MUT基因突变研究
- 2016年
- 目的检测甲基丙二酸血症(MMA)病儿父母的甲基丙二酰辅酶A变位酶(MUT)基因突变类型。方法采用全基因组外显子测序技术(WES)对1例单纯性MMA病儿父母MUT基因进行检测。结果病儿父亲MUT基因发生了错义突变(c.1106G>A),导致p.Arg369His;病儿母亲MUT基因发生了框移突变(c.2075_2081),导致p.Leu692ArgfsX11。结论病儿父母均为MMA携带者。
- 刘畅王庆华臧玉翠李爱芹阎胜利刘世国
- 关键词:甲基丙二酸血症突变
- 先天性甲状腺功能减退症患儿双氧化酶1基因突变研究被引量:1
- 2016年
- 目的研究山东地区先天性甲状腺功能减退症(CH)伴甲状腺肿大患儿双氧化酶1(DUOX1)基因突变类型及特点,为CH的诊断及基因治疗提供理论依据。方法选取43例经新生儿筛查确诊为CH伴甲状腺肿大患儿及100例正常对照新生儿,提取CH患儿及正常新生儿外周血基因组DNA,采用聚合酶链式反应(PCR)扩增及一代测序法(Sanger测序法),对DUOX1基因全部外显子进行基因突变检测,结合测序结果及生物信息学数据,分析DUOX1基因是否存在突变,并对发现的单核苷酸多态性(SNP)位点的基因频率进行χ2检验。结果在43例CH伴甲状腺肿大患儿及100例正常对照新生儿中,均未发现DUOX1基因突变。但在外显子区发现了2个SNP位点(rs16939752,c.3076T>C;rs1706804,c.3228A>G),前者为错义突变(Cys→Arg),后者为同义突变(Thr→Thr);内含子区发现了1个SNP位点(rs2020216,IVS8+129C>T)。经统计,本文实验组患儿与正常对照组新生儿SNP的基因频率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论山东地区CH伴甲状腺肿大患儿中,DUOX1基因突变率低,可能不是该地区CH伴甲状腺肿大的主要病因。
- 韩文秀臧红伟臧玉翠衣明纪阎胜利刘世国葛银林
- 关键词:先天性甲状腺功能减退甲状腺肿大突变