胡晓天
- 作品数:2 被引量:1H指数:1
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- 发文基金:湖南省自然科学基金国家自然科学基金湖南省科技计划项目更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 基于全基因组序列和E距离信息的CoxA16病毒亲缘关系分析
- 2014年
- 柯萨奇病毒A组16型(CoxsackievirusA16,CoxA16)病毒是引起手足口病(Hand,footandmouthdisease,HFMD)的主要病原体。为了解不同地区CoxA16病毒株的系统进化关系,收集了NCBI数据库中注释有具体地区分布的23条CoxA16全基因组序列,分别采用Kimura2-parameter法和E距离法对病毒株进行亲缘关系分析。结果表明,基于E距离的系统进化树最大程度地吻合了Kimura 2-parameter遗传距离法构建的系统进化树,且E距离法普适性较强,颇具应用潜力,为更精确地判断病毒株之间的进化关系提供了一条新途径。
- 向妍徐西林张永生谭泗桥李柯胡晓天周玮
- 关键词:全基因组进化树
- 基于线粒体ATP6基因序列的作物系统发育研究被引量:1
- 2015年
- ATP6编码ATP合酶a亚基,对酶正常功能的实现作用重要。为探讨线粒体ATP6基因在作物系统发育分析上的应用,采用NJ法的Kimura 2-parameter模型、E距离模型,以及最大似然法对30种作物进行分子系统树构建,并结合植物形态学分类结果进行比较分析。结果表明,基于NJ法和最大似然法的ATP6系统发育树聚类结果一致,契合现有植物形态学分类,在分析作物物种分化起源上有巨大潜力。
- 胡晓天向妍张柯刘齐元范彦君周玮
- 关键词:ATP合酶作物系统发育