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我国集约化猪场新发猪丁型冠状病毒病的诊断被引量：20: 2015年; 猪丁型冠状病毒(PDCoV)是一种国外新发现的猪腹泻病原,我国广泛存在猪流行性腹泻,但至今未见猪丁型冠状病毒感染的正式报道。2015年7月,在存栏2 000头基础母猪的华南某集约化猪场5至15日龄乳猪发生传播迅速的严重腹泻,发病率90%、死淘率90%以上。经实验室PCR诊断为猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)和轮状病毒(RV)检测均为阴性。用特异性的PDCoV N基因引物经RT-PCR扩增显示为强阳性。在此基础上,对扩增产物进行了基因测序和遗传变异分析,显示该毒株在PDCoV新的遗传分支上,与其他PDCoV有显著区别。本研究首次报道我国出现了猪丁型冠状病毒病的新病例,毒株命名为PDCoV Ch-A。; 贺东生陈小芬王飞苏丹萍陈瑞爱尤刘阳; 关键词：N基因

一种PEDV S基因主要抗原表位串联的重组基因及其制备方法和应用: 本发明公开了一种PEDV S基因主要抗原表位串联的重组基因及其制备方法和应用，属于PEDV S蛋白主要中和表位区高效表达方法领域。本发明的PEDV S基因主要抗原表位串联的重组基因，将PEDV S基因3个主要抗原表位串联...; 贺东生王飞倪挺陈小芬焦臣鹏苏丹萍

2014—2015年我国部分省份猪流行性腹泻病毒S基因的遗传变异分析被引量：23: 2016年; 2010年以来,猪流行性腹泻肆虐我国的养猪业,给养猪业造成了严重的经济损失。为分析PEDV在我国最新的遗传变异情况,本试验对2014—2015年在7个省份分离的9株PEDV毒株的S基因进行克隆和测序,并将其分别与疫苗株、中国2010年前经典毒株、中国2010—2013年出现的毒株及韩国、美国近年来毒株进行S基因序列比对、分析。结果发现：9株PEDV S基因核苷酸同源性为98.4%~99.5%;与疫苗株和中国2010年前经典毒株相比核苷酸同源性为93.4%~96.2%;与中国、韩国、美国近年来暴发的毒株相比核苷酸同源性为97.4%~99.2%。遗传进化树显示：我国常用的疫苗毒株CV777处于G1组,这9株毒株S基因均位于G2组,说明我国当前流行毒株与疫苗株和早期经典毒株的亲缘性相去较远。序列比对表明现阶段PEDV S基因已发生较大变异,存在高度相似的缺失,插入和变异,且在中和表位区域存在多处变异,可能降低常规疫苗的免疫保护作用。; 王飞陈小芬苏丹萍宋亚兵焦臣鹏陈瑞爱贺东生; 关键词：猪流行性腹泻 S基因

一种区分PEDV变异株和经典株的套式RT-PCR检测方法: 本发明公开了一种区分PEDV变异株和经典株的套式RT?PCR检测方法，属于PEDV病毒的快速检测技术领域。本发明为了克服病毒分离鉴定、基因测序繁琐、成本高、耗时长的缺点，也为了解决传统RT?PCR特异性低、灵敏性差的问题...; 贺东生焦臣鹏王飞陈小芬苏丹萍罗华林; 文献传递

猪传染性胃肠炎病毒SY株的分离鉴定及S基因的序列分析被引量：8: 2016年; 取沈阳地区某猪场表现为腹泻症状的病死仔猪小肠病料,无菌处理后接种在PK-15细胞上分离病毒。通过无限稀释法进行病毒纯化、病毒中和试验和RT-PCR检测,证实其为传染性胃肠炎病毒（TGEV）,并命名为TGEV SY株。参照Gen Bank中TGEV序列设计引物,对SY株S基因进行RT-PCR扩增,克隆并测序,获得S基因组完全序列。将S基因序列和所编码的氨基酸序列与Gen Bank中登录的10个TGEV和1个PRCV S基因序列进行同源性和亲缘关系的比较分析。结果表明,SY株S基因核苷酸序列和编码的氨基酸序列与其他参考毒株的同源性分别为96.4%-99.2%和96.0%-97.9%;而与PRCV毒株的同源性分别为96.2%和96.6%。由系统进化树可知,SY株与国内的华毒株、TS株以及国外的Miller M60株位于进化树的同一分支,亲缘关系较近。总体来看,各毒株之间的S基因差异性不大,表明TGEV虽然处于不断遗传演化中,但不同毒株的S基因变异不是特别明显。; 尤刘阳苏丹萍宋亚兵王飞陈小芬贺东生; 关键词：猪传染性胃肠炎病毒

一种PEDV S基因主要抗原表位串联的重组基因及其制备方法和应用: 本发明公开了一种PEDV S基因主要抗原表位串联的重组基因及其制备方法和应用，属于PEDV S蛋白主要中和表位区高效表达方法领域。本发明的PEDV S基因主要抗原表位串联的重组基因，将PEDV S基因3个主要抗原表位串联...; 贺东生王飞倪挺陈小芬焦臣鹏苏丹萍; 文献传递

PEDV/TGEV/PDCoV快速检测方法的建立及PEDV COE基因和ORF3基因遗传变异研究: 猪流行性腹泻（porcine epidemic diarrhea，PED）和猪传染性胃肠炎（Transmissible Gastroenteritis，TGE）分别是由猪流行性腹泻病毒（porcine epidemic ...; 陈小芬; 关键词：猪传染性胃肠炎猪流行性腹泻病毒猪传染性胃肠炎病毒 ORF3基因

猪流行性腹泻病毒SC-2014株的分离鉴定及繁殖条件的优化被引量：2: 2016年; 从四川省某猪场疑似病毒性腹泻的发病猪采集部分小肠内容物样品,应用RT-PCR检测得到该病料呈PEDV阳性,命名为SC-2014株,将其在Vero细胞上进行连续盲传,传至第8代观察到CPE,传至30代基本能够在Vero细胞上稳定增殖。并通过分别不同胰酶浓度、不同吸附时间、不同PAPN浓度到培养体系中,将分离的病毒继续繁殖8代,然后分别测定不同条件下病毒的TCID50,结果表明:在胰酶浓度为15μg/mL,吸附时间为1.5 h,添加的PAPN浓度为5μg/mL时,PEDV SC-2014株的病毒滴度为10-5.22,达到最大值,使PEDV SC-2014株的繁殖条件得到一定程度的优化。; 王飞陈小芬焦臣鹏苏丹萍宋亚兵陈瑞爱贺东生; 关键词：猪流行性腹泻病毒分离繁殖条件

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陈小芬