杨黎
- 作品数:4 被引量:2H指数:1
- 供职机构:湖南农业大学更多>>
- 发文基金:国家教育部博士点基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 拟南芥花瓣发育分子网络拓展与新的多分类转换策略
- 支持向量机(Support Vector Machine,SVM)以统计学习理论为基础,遵循结构风险最小原则,可有效解决非线性、维数灾难、过学习、局部极小等问题,具有良好的泛化推广能力。蛋白互作在生物调控机理上发挥着至关...
- 杨黎
- 关键词:SVM
- 文献传递
- 基于MADS-box诱饵与蛋白质相互作用的拟南芥花瓣发育分子网络拓展被引量:1
- 2015年
- 阐明花器官发育调控机理具重要的进化、发育和生态学意义。该文以拟南芥(Arabidopsis thaliana)花瓣发育为例,整合蛋白质互作、亚细胞定位、基因芯片和基因功能注释等数据库,通过组建蛋白质互作可信预测模型,获得拟南芥花瓣蛋白质互作网络,以含有MADS-box结构域蛋白为诱饵在网络中进行一级拓展,得到含38个蛋白质和67对互作的拓展网络。基于拓展网络,DAVID基因功能注释表明,多数蛋白质涉及的生物学过程与花发育调控相关;提取到19个候选四元互作,涉及ABCDE模型基因之外的8个基因,其中含MADS-box结构域的AGL16可能是B类基因新成员或其冗余;SEU、LUH、CHR4、CHR11、CHR17和AT3G04960为拟南芥花瓣AP1-AP3-PI-SEP四聚体的候选靶标基因。研究结果为深入解析拟南芥花瓣发育分子调控网络奠定了基础。
- 杨黎孙丛苇代志军何淼袁哲明
- 关键词:拟南芥MADS-BOX蛋白质相互作用
- 一种多类别图像识别方法及系统
- 本发明公开了一种多类别图像识别方法及系统,对m类别图像识别问题C={C1,C2,…,Cw,…,Cm},将选自图像识别数据集的训练样本分解为m套样本子集;对每套样本子集经特征选择获得一套特征子集,共获得m套特征子集{Fea...
- 陈渊袁哲明杨晶晶谭泗桥杨黎
- 文献传递
- 酰胺类驱蚊剂的非线性定量构效关系被引量:1
- 2014年
- 驱蚊剂定量构效关系(QSAR)的研究对指导高效新驱蚊剂开发、阐明驱蚊剂的驱避机理有重要意义。以40种酰胺类化合物对埃及伊蚊Aedes aegypti的有效保护时间为驱避活性指标,借助PCLIENT(http:∥w w w.vcclab.org/lab/pclient/start.html)量子化学计算软件获得每个化合物的1 773个初始分子描述符,经二元矩阵重排过滤器、多轮末尾淘汰实施特征非线性筛选后,保留了8个物化意义明确的分子描述符,以支持向量回归SVR建立了高精度的非线性QSAR模型,F=8 465,R2=0.999 6。SVR可解释性体系分析结果表明,保留分子描述符对酰胺类驱蚊剂的驱避活性的非线性关系明显。其中,拓扑极性分子表面积TPSA(Tot)对驱避活性影响最为重要,其值越小,活性越高;负电性对驱避活性有较大影响,其值越大,驱避活性越高。
- 梁景华孙丛苇代志军杨黎袁哲明
- 关键词:酰胺类化合物驱蚊剂非线性定量构效关系