赵阿妮
- 作品数：3 被引量：0H指数：0
- 供职机构：中国医学科学院基础医学研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- PCBP2基因座位上长非编码RNA的筛选与鉴定
- 长非编码RNA(long noncoding RNA，lncRNA)是一类长度大于200 nt，以RNA形式发挥作用的转录产物。根据lncRNA与蛋白编码基因的相对位置，可分为:正义(sense)、反义(antisens...
- 赵阿妮
- 关键词：生物信息学表达谱分析基因筛选
- 文献传递
- 肠道病毒71型的全长cDNA感染性克隆的构建与鉴定
- 2013年
- 目的构建一株肠道病毒71型的全长cDNA克隆并验证感染性。方法用长片段高保真RT-PCR方法扩增肠道病毒71型87-2008 Xi'an株的cDNA,装入pBR322载体。将该克隆线性化,体外转录后转染RD细胞后,通过观察CPE及RT-PCR验证其感染性。随后利用空斑法测定拯救病毒的一步生长曲线。结果成功构建了肠道病毒71型87-2008 Xi'an株的全长cDNA克隆;体外转录及转染RD细胞60 h后可观察到明显的CPE现象;RT-PCR在转染RD细胞中检测到病毒的存在;成功利用空斑法测定了拯救病毒的一步生长曲线,最大滴度达到2×107pfu/mL。结论成功构建了肠道病毒71型87-2008 Xi'an株的全长cDNA克隆并验证了其感染性,同时测定了拯救病毒的一步生长曲线,与野生型病毒相近。
- 王冠洲叶飞赵阿妮韩为阴彬彭小忠
- 关键词：肠道病毒71型感染性克隆
- PCBP2基因座位上长非编码RNA的筛选与鉴定
- 2013年
- 目的从EST鉴定入手利用生物信息学方法筛选验证PCBP2基因内部UC.338基因座位附近的长非编码RNA。方法首先利用生物信息学方法筛选包含内含子转录区域的ESTs,经CPC分析和统计学比较,共筛选到4个(人、鼠各两个)可能的lncRNAs,用PCR方法进行鉴定,克隆到pGEM-T载体测序验证,并用PCR,real-time PCR的方法检测各ESTs在人源细胞系或小鼠不同组织,小鼠发育不同时间点大脑中的表达谱。结果筛选到4个ESTs中有3个ESTs均具有一定的非编码特征,并最终测序正确:1个人源,2个鼠源,并且其中有些lncRNAs具有一定的细胞、组织特异性,有些lncRNAs具有广谱表达模式。结论使用了一种新的寻找lncRNAs的方法,从EST鉴定入手,对现有数据库进行了挖掘。找到了可能在小鼠大脑发育过程中起作用的lncRNAs。
- 赵阿妮朱丽媛吴朝刘雪梅阴彬张靖
- 关键词：ESTS生物信息学分析LONG表达谱分析
