袁金红
- 作品数：6 被引量：23H指数：3
- 供职机构：河南师范大学生命科学学院更多>>
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- 相关领域：生物学更多>>
- 菠菜性别差异NUPTs序列的克隆及分析
- 2017年
- 质体DNA向核基因组转移能够形成核质体DNA,核质体DNA序列的插入是推动动植物基因组及染色体组演化的重要动力.但是核质体DNA的插入和植物性染色体起源及演化之间的关系仍不清楚.以雌雄异株植物菠菜为材料,利用基因组消减杂交技术筛选分离菠菜雌雄基因组差异的NUPTs序列,并进行验证和分析.结果表明,从构建的菠菜消减杂交文库中共得到39条长度为75~308 bp的雌雄差异序列,其平均长度约为154 bp.对获得的序列进行Blastn同源比对发现了12条序列为叶绿体基因组来源序列,这些序列与菠菜叶绿体基因组相似度在98%以上,说明所获得的差异片段为核质体DNA序列.将筛选出的核质体DNA序列进行进一步验证后获得了两个稳定的长度分别为146 bp和199 bp的雄性偏好核质体DNA序列,说明所获得的两个NUPTs序列在菠菜雄性基因组中有更多的累积.
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- 关键词：菠菜
- 葎草单染色体的显微分离及DOP-PCR技术体系建立
- 2016年
- 葎草是具有XX/XY1Y2性染色体系统的雌雄异株植物,是研究植物性染色体演化的模式材料之一.利用染色体显微分离技术从葎草根尖有丝分裂中期分裂相中将单条染色体进行了显微分离及DOP-PCR(Degenerate oligonucleotide primer-PCR)扩增,并构建了单染色体DOP-PCR扩增产物的荧光探针,对葎草根尖有丝分裂中期分裂相染色体进行了荧光原位杂交,其结果表明荧光信号分布在所有的染色体上,表明所建立的技术体系能够成功分离葎草单染色体并进行DNA扩增.本研究结果为进一步进行葎草X,Y染色体的细胞及分子生物学研究提供了技术支持.
- 秦瑞云李双双李书粉袁金红高武军邓传良
- 关键词：葎草单染色体显微分离DOP-PCR
- 基于全基因组重测序的SNP分析在作物基因定位中的研究进展被引量：14
- 2015年
- 在作物重要性状数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)定位和突变体研究中,利用传统的遗传标记对目标基因或QTL进行定位,往往工作量大、周期长,难以精确定位。近年来,全基因组重测序(whole genome resequencing,WGR)为从基因组水平开发单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphysim,SNP)标记提供了新的技术条件。利用基于WGR的SNP识别、验证和基因型分析与传统分子标记相结合的方法,能很快挖掘到候选基因和获得导致表型的SNP位点。目前,通过基于WGR的群体驯化和全基因组关联分析以及对杂交后代进行全基因组SNP基因型分析,已经成功定位了若干作物的QTL及突变基因。本文就利用基于WGR的SNP分析方法定位作物重要性状QTL和突变基因的研究概况进行综述,并就该方法在基因/QTL定位上的应用前景进行了探讨和分析。
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- 关键词：单核苷酸多态性基因定位数量性状位点
- 基于全基因组测序的MutMap方法在正向遗传学研究中的应用被引量：5
- 2017年
- 在传统的正向遗传学分析过程中,基因定位需要构建复杂的后代群体,并借助大量分子标记进行遗传连锁分析和区间定位,使得这一过程成本高且耗时长。MutMap是近年来发展的基于高通量第二代测序技术的一种新的正向遗传学分析方法。该方法的优点是遗传定位的周期短且效率高。在此基础上扩展的新方法也不断出现,如基于自交的MutMap+、用于识别基因组缺失区间变异的MutMap-Gap、以及用于定位数量性状基因座的分析思路与MutMap类似的QTL-seq方法等。这些方法不需要建立繁琐的定位群体,甚至不依赖于遗传杂交和任何连锁信息即可进行,加快了对感兴趣表型的变异位点所在基因组区域的识别过程。本文对MutMap及其扩展方法进行了介绍,并对它们未来的应用和发展前景进行了讨论,以期为基于第二代测序技术的正向遗传学基因定位和作物遗传改良研究提供参考。
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- 关键词：突变体数量性状位点
- 扫描电子显微镜叔丁醇冷冻干燥快速制样方法的探索被引量：3
- 2022年
- 该实验旨在利用扫描电子显微镜(SEM)进行植物叶片微观形态观察,探究一种叔丁醇快速制样新方法。实验以野生型拟南芥叶片为研究对象,通过预设实验步骤对其进行制样处理,结合实验过程及观察结果总结最佳实验处理条件作为新的SEM叔丁醇快速制样方法。实验结果显示,在不同的叔丁醇处理温度、时长,冰冻时间及喷金导电处理条件下,叶片表皮微观形态观察结果存在差异,其中以30℃下叔丁醇处理15 min、冰上冷冻10 min、喷金80 s效果最佳。本实验确定了一种拟南芥叶片SEM叔丁醇快速制样的新方法,且实验结果表明该方法在怀山药等其他物种也具有较好的观察效果。
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- 关键词：拟南芥叶片
- 石刁柏雄性偏向核质体DNA的克隆与分析被引量：1
- 2016年
- 该研究以雌雄异株植物石刁柏为材料,利用基因组消减杂交技术对石刁柏雌雄核基因组中的性别差异核质体DNA（nuclear plastid DNA,NUPTs）进行了分离和分析。结果表明：（1）通过构建消减杂交文库共获得了52个雄性偏向序列,序列长度分布在63-297bp之间,其中有19个差异序列属于叶绿体来源序列（命名为Ao1-Ao19）,且这些序列与石刁柏叶绿体基因组的相似性均大于84%,Ao19与石刁柏叶绿体基因组相似性为100%。（2）利用基因组半定量PCR对19个NUPTs序列的性别差异分析表明,有4条序列为稳定的雄性偏向NUPTs序列,分别为Ao1、Ao3、Ao10和Ao18。（3）序列比对表明,转移到核基因组的NUPTs主要来源于叶绿体基因组的反向重复区（包含IRa和IRb区）,说明石刁柏叶绿体基因组重复区序列更容易向核基因组进行转移形成雄性偏向的NUPTs序列。
- 李书粉李旭王冰肖袁金红邓传良高武军
- 关键词：石刁柏性别差异
