张薇
- 作品数：6 被引量：2H指数：1
- 供职机构：哈尔滨医科大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 肺腺癌基因及其转移相关基因表达谱的研究
- 目的:利用基因芯片技术研究肺腺癌组织、转移淋巴结组织、癌旁正常组织以及胚胎肺组织中的基因表达差异.方法:分别抽取肺腺癌组织、转移淋巴结组织、癌旁正常组织和胚胎肺组织的总RNA并纯化mRNA,用逆转录的方法,将各mRNA的...
- 张薇
- 关键词：肺腺癌转移淋巴结癌旁正常组织基因表达谱
- 文献传递
- 压缩感知理论在小样本量蛋白质组学变量筛选研究中的应用被引量：1
- 2019年
- 目的探索基于压缩感知理论变量筛选方法在小样本量蛋白质组学研究中应用的效果和特点,为小样本量的蛋白质组学的变量筛选提供更灵敏、可靠的方法。方法模拟实验比较基于CS理论的变量筛选方法与偏最小二乘(PLS)及随机森林(RF)筛选变量的能力,通过灵敏度、特异度及平衡准确度评价其变量筛选效果;利用CS变量筛选方法筛选非小细胞肺癌两亚型组(腺癌和鳞状细胞癌)的差异蛋白。结果模拟实验表明,CS理论的变量筛选方法在样本量较小时具有较好的变量筛选效果,灵敏度、特异度及平衡准确度均较高;利用基于CS理论的变量筛选方法筛选,获得肺腺癌和鳞状细胞癌间差异表达蛋白22种,被证明是肺腺癌和鳞状细胞癌间有差异的蛋白为:Cytokeratin 6A、Cytokeratin 6B、Cytokeratin 6C、PKP1、P63、MCT1。结论基于CS理论的变量筛选方法在样本量特别少时,筛选变量的效果优于PLS和RF,更适用于小样本蛋白质组学数据变量筛选研究。
- 张薇张秋菊王玉鹏谢彪孙琳高兵叶倩田伟侯小文刘美娜
- 关键词：压缩感知蛋白质组学小样本
- 基于WGCNA识别IgG介导的西红柿不耐受枢纽蛋白被引量：1
- 2021年
- 目的基于加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)方法识别IgG介导的西红柿不耐受相关蛋白质共表达模块及枢纽蛋白,为其发生机制研究提供依据。方法收集IgG介导的西红柿不耐受患者及健康对照血清样本,使用DIA全扫描蛋白质组学定性定量技术获得蛋白质表达数据;利用WGCNA方法构建共表达网络,识别与IgG介导的西红柿不耐受相关的模块,并进行模块GO功能注释及KEGG通路富集分析;利用Cytoscape获得IgG介导的西红柿不耐受相关模块的枢纽蛋白。结果获得IgG介导的西红柿不耐受相关的蛋白质模块两个,分别为blue模块和turquoise模块。blue模块与IgG介导的西红柿不耐受相关系数为-0.90;GO富集分析发现,该模块中蛋白主要参与脂蛋白重构、脂质代谢等相关生物过程以及蛋白质级联激活、补体激活等免疫调节过程;KEGG分析富集到5条通路,包括胆固醇代谢通路、PPAR信号通路、补体和凝血级联通路、类维生素A代谢和运输通路、维生素和辅酶因子代谢通路。turquoise模块与IgG介导的西红柿不耐受相关系数为0.72;GO富集分析发现,该模块主要与蛋白质级联激活、补体激活经典途径、体液免疫应答、受体介导的内吞,血小板脱颗粒、抗氧化活性等生物过程有关;KEGG分析富集到2条通路,补体和凝血级联通路、吞噬体通路。筛选出IgG介导的西红柿不耐受相关模块中的枢纽蛋白为APOA1、APOA4、APOC3、APOA2、APOC1、C3、HRG、FGB、HP、TF。结论WGCNA方法进行IgG介导的西红柿不耐受蛋白质表达数据分析发现:脂质、胆固醇代谢等过程的改变可能是其发生的重要环节;获得的载脂蛋白类蛋白质及其他枢纽蛋白是其潜在关键调控蛋白;本研究从系统生物学的角度,为IgG介导的西红柿不耐受发生机制探索提供了依据和研究方向。
- 张薇孙琳王玉鹏刘美娜
- 葡萄糖酸铬对大鼠肥胖基因表达的影响
- 1994年底Zhang等克隆出肥胖基因,但调控基因表达的因素还不很清楚,该实验分别从预防和治疗两方面来观察食物中的营养素铬(以葡萄糖酸铬的形式给予)对大鼠肥胖基因表达的影响.
- 张薇
- 关键词：葡萄糖酸铬瘦素胰岛素生长激素睾酮
- 文献传递
- 基于sigFeature方法的小麦不耐受患者差异蛋白筛选及通路研究
- 2022年
- 目的 应用蛋白质组学技术,基于sigFeature变量筛选方法,获得小麦不耐受患者血清差异表达蛋白;利用富集分析获得差异蛋白生物学解释,为小麦不耐受发病机制的研究提供依据。方法 收集小麦不耐受患者和对照组血清样本;应用TMT标记定量蛋白质组学技术获得蛋白表达数据、sigFeature方法筛选差异表达蛋白;进行差异蛋白GO功能注释和KEGG富集分析,外部数据集进行差异蛋白验证。结果 TMT技术鉴定蛋白849个,sigFeature筛选获得差异蛋白22个。富集分析结果:GO富集分析发现差异蛋白参与血小板脱颗粒、急性期反应等生物学过程;KEGG富集分析发现差异蛋白参与补体与凝血级联通路。外部验证结果:ITIH2蛋白的ROC曲线下面积最大,AUC值为0.8673。结论 补体系统抑制和脂质代谢过程的改变是小麦不耐受发生的重要环节;ITIH2蛋白可能是小麦不耐受的关键蛋白;本研究从人体血清蛋白质组学的角度,为探究小麦不耐受的发生和调控机制提供依据。
- 赵敏张薇孙琳王玉鹏刘美娜
- 关键词：差异表达蛋白
- 可调节利器盒固定架
- 本实用新型涉及一种可调节利器盒固定架，该固定架整体为一个长方体，该固定架的顶端和前端均敞开，所述固定架的顶端前侧设有挡杆，所述固定架内水平放置一挡板，所述固定架的底端设有底座，所述底座的下面连接滚轮，所述固定架的顶端两侧...
- 张丽莎徐宏邹小明芦桂芝张薇
- 文献传递
