李康 作品数:25 被引量:36 H指数:3 供职机构: 中国食品药品检定研究院 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 国家科技基础条件平台建设计划 艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 轻工技术与工程 更多>>
淋病奈瑟球菌国家参考品菌株的分子生物学特征分析 被引量:3 2015年 目的对中国医学细菌保藏管理中心收集保藏的淋病奈瑟球菌(NG)国家参考品菌株进行分子生物学特征分析。方法对13株NG国家参考品菌株进行16S rRNA和隐蔽性质粒cppB基因扩增和分析,并采用多位点序列分型(MLST)、NG多抗原序列分型(NG-MAST)技术对菌株进行分子分型。结果 13株菌种均扩增出预期大小的16S rRNA基因片段,与NG模式菌株参考序列(X07714.1)的相似性均>99%;13株菌种均扩增出预期大小的cppB基因;MLST结果显示,13株菌种共分为10个ST型,其中含7个新的ST型;NG-MAST结果显示,13株菌种含9个por等位基因和9个tbpB等位基因,配对后是10个不同的ST型,其中含6个新的ST型。结论该研究完善了NG国家参考品菌株的分子生物学方面的质控指标,为今后NG参考品候选菌株的选择提供了新的技术手段。 王春娥 刘茹凤 石继春 李康 陈琼 陈翠萍 叶强金黄色葡萄球菌核酸检测试剂盒用国家参考品的研制 被引量:2 2021年 目的研制金黄色葡萄球菌核酸检测试剂盒用国家参考品。方法将10株金黄色葡萄球菌和10株阴性对照代表性菌株分别在适宜条件下复苏培养,制备合适浓度的菌悬液,并加热灭活和分装。随机抽样不同候选参考品样品10支进行均匀性分析,并将样品分别置于2~8、25、37℃条件下保藏以及反复冻融,评价标准物质的稳定性。同时对候选参考品的准确性、特异性、重复性、最低检出限进行分析,并组织8家实验室进行协作标定。结果制备了由阳性、阴性、重复性和最低检出限样品组成的金黄色葡萄球菌核酸检测试剂盒用候选参考品。不同候选参考品不同样品间的Ct值的变异系数在1.23%~3.86%之间,表明制备候选参考品均匀性良好。同时证实P1~10阳性和最低检出限候选参考品样品在反复冻融及加速破坏条件下稳定性良好。应用3个不同厂家生产试剂盒进行重复性验证实验显示,样本的Ct值均小于5.0%,表明候选参考品的重复性良好。除P6阳性候选参考品样品不能被部分试剂盒检出,其余阳性参考品样品均能成功检测、最低检出限为1.0×10^(3)个/m L。协作标定结果进一步表明阳性、阴性、重复性和最低检出限候选参考品均符合国家参考品的各项要求。结论研制的金黄色葡萄球菌核酸检测试剂盒用国家参考品已获得批准,可用于金黄色葡萄球菌核酸检测试剂盒的质量控制和评价。 陈驰 梁丽 王春娥 石继春 龙新星 刘茹凤 黄洋 李康 徐潇 李江姣 徐颖华 叶强关键词:金黄色葡萄球菌 核酸 国家参考品 均匀性 稳定性 不同来源屎肠球菌的全基因组序列分析 2022年 目的 了解不同分离来源的屎肠球菌(Enterococcus faecium)标准菌株的全基因组特征。方法 采用高通量测序技术对中国医学细菌保藏管理中心保藏的分离于食品和临床患者的6株屎肠球菌标准菌株进行全基因组测序,采用velvet 1.2.03和glimmer 3.02等生物信息学软件对测序数据进行基因组装、基因预测及功能注释,分析基因组中所含耐药基因和毒力基因;并与已发表的6株临床分离的代表性屎肠球菌进行核心基因组和泛基因组比较分析,构建系统发育分子进化树。结果 6株屎肠球菌标准菌株的基因组序列大小约为2.9Mbp,不同菌株基因组中共鉴定出2669~3085个基因,平均G+C含量为38.0%;基因组耐药基因注释分析发现,每株屎肠球菌含有21~37种数量不等的耐药基因,食品来源菌株所携带耐药基因明显少于临床分离株(P=0.009)。而不同来源菌株之间所含毒力基因数量无显著性差异,含有5~8种数量不等的毒力基因,其中参与生物膜形成的基因BopD和胆盐水解酶基因bsh存在于所有菌株中。比较基因组学分析结果显示,随着屎肠球菌基因组测序数量的增加,泛基因组所含基因数量随之增加,而核心基因组则趋于稳定。全基因组的系统发育树进化分析结果显示, 12株屎肠球菌被分成3个进化分支,其中5株食品来源的菌株均分布在同一个进化分支。结论 本研究获得6株屎肠球菌标准菌株的全基因组序列,证实食品来源菌株均携带一定数量的耐药基因和毒力基因,提示应加强食源性菌株的安全监测。本研究结果可为后续屎肠球菌耐药机制、致病性等研究提供数据支持。 王春娥 石继春 徐潇 李康 梁丽 陈驰 龙新星 叶强 徐颖华关键词:屎肠球菌 全基因组序列分析 一株卡他布朗汉姆菌的重新鉴定 被引量:2 2016年 目的对中国医学细菌保藏管理中心库藏的一株卡他布朗汉姆菌CMCC(B)29103株进行重新鉴定。方法用营养琼脂培养基培养CMCC(B)29103株,对其进行形态观察、生理生化特性、脂肪酸组分、分子生物学等多相鉴定,同时与模式株DSM25388T相对照;分析CMCC(B)29103株的特征属性、进化位置以及与Acinetobacter indicus模式株DSM25388T的同源性。结果形态学特性、生理生化以及脂肪酸组分构成均与DSM25388T株十分相似,仅存在个别差异;16 S rRNA基因序列比对显示,CMCC(B)29103株与Acinetobacter(不动杆菌属)相近,与模式株DSM25388T相似性最高,为99.85%。基于Acinetobacter属所有成员的16 S rRNA和rpo B基因的系统进化分析均显示CMCC(B)29103与DSM25388T稳定聚类成一个独立分支,且二者的DNA-DNA同源性为78.3%。结论CMCC(B)29103株属于Acinetobacter indicus种,与模式株DSM25388T为不同的菌株,可将其更名为Acinetobacter i ndicus。 杜慧竟 石继春 梁丽 李康 陈翠萍 叶强关键词:不动杆菌 菌种鉴定 食品检验用标准菌株分子水平质控方法的建立与应用 被引量:4 2018年 目的建立食品检验用标准菌株分子水平质控方法,并进行应用。方法使用16S rRNA基因序列分析、脉冲场凝胶电泳(PFGE)、多位点序列分型等分子生物学技术手段,对食品安全国家标准中使用的标准菌株进行分子确认,并对不同的批号进行验证。结果 16S rRNA基因序列比对结果符合该菌株所在的菌属,并获得标准菌株16S rRNA基因标准序列,不同批号的标准菌株16S rRNA基因序列完全一致;确定了每株标准菌株的ST型和基因型,并对不同批号的菌株进行了基因型比较,未发现型别改变;对无PulseNet标准操作方法的菌株,开展方法学研究,获得了最适用的限制性内切酶和电泳参数,建立了标准菌株分子指纹图谱,比较不同批号菌株的PFGE图谱,相似性均为100%。结论本研究首次将分子生物学技术应用到标准菌株的质量控制,突破了使用传统质控方法的瓶颈,从分子水平实现对标准菌株稳定性的评价,保证了标准菌株在食品检验过程中的稳定性和一致性。 徐潇 石继春 王春娥 梁丽 李康 孙文媛 陈翠萍 叶强关键词:标准菌株 脉冲场凝胶电泳 多位点序列分型 食品检验 铜绿假单胞菌核酸检测用试剂盒国家参考品的研究 被引量:1 2022年 铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)为假单胞菌属的一种革兰氏阴性菌,也被称为绿脓杆菌。在自然界水、土壤与空气中均广泛存在[1]。铜绿假单胞菌污染常见于凉拌菜、熟肉制品、饮用水等食品领域。例如在水源水或成品水中检出铜绿假单胞菌,甚至多批次样品的检出率大于10%,为一种重要的水源和食源性致病菌[2-4]。因此在我国饮用天然矿泉水(GB 8537-2016)[5]和包装饮用水(GB 19298-2014)[6]的国家标准中均明确规定不得检出铜绿假单胞菌。此外,在2015年我国颁布的《化妆品安全技术规范》也要求化妆品中不得有铜绿假单胞菌检出[7]。铜绿假单胞菌作为医院内感染的主要病原菌之一,在机体免疫力低下时,例如术后和恶性肿瘤的患者容易感染本菌,且铜绿假单胞菌的耐药性强,在治疗时往往需要使用多种抗生素进行联合用药[8-9]。因此,快速而准确地鉴定出铜绿假单胞菌对保障食品安全和人民健康具有重要的意义。 梁丽 陈驰 石继春 王春娥 龙新星 刘茹凤 黄洋 李康 徐潇 李江姣 徐颖华 叶强关键词:铜绿假单胞菌 国家参考品 核酸检测 饮用天然矿泉水 凉拌菜 熟肉制品 11群肺炎链球菌荚膜多糖合成相关基因的分子生物学研究 被引量:5 2018年 目的利用分子生物学方法,研究7株11群肺炎链球菌荚膜多糖合成相关基因(cps loci)。方法根据11群肺炎链球菌荚膜多糖合成相关基因设计合成5对特异性引物,以7株肺炎链球菌基因组DNA作为模板进行PCR扩增,并对扩增产物进行序列测定及基因序列比对,确定其血清型。多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)技术分析7株11群肺炎链球菌序列型(ST)。采用相邻合并分析(neighbour-joining analysis),根据MLST的7个管家基因和cps基因分别绘制系统发育树。结果根据wcw C、gct和wcj E等3个基因产物确定5株原11A型肺炎链球菌为11A型,无11E型;根据wcwR和gct等2个基因产物确定2株原11B型肺炎链球菌为11B型。获得7株不包括4个合成调控基因(wzg、wzh、wzd和wze)的11群肺炎链球菌cps loci,长度为11~12 kb,11A型具有12个开放式阅读框(ORF),11B型具有11个ORF。5株11A型肺炎链球菌部分cps基因序列差异较大; 2株11B型肺炎链球菌部分cps基因序列相似性高于99%。根据MLST分析发现3种新的ST型。根据MLST的7个管家基因绘制的系统发育树和cps基因绘制的系统发育树差异很大。结论从分子水平上确定了11A和11B血清型。获得了5株11A型和2株11B型肺炎链球菌ST型和部分荚膜多糖合成相关基因(cps loci),完善了11群肺炎链球菌的菌种档案。 陈琼 龙新星 李红 李康 黄洋 陈翠萍 叶强关键词:多位点序列分型 系统发育树 不同品牌胎牛血清用于肺炎链球菌调理吞噬作用的比较 被引量:2 2019年 目的 比较不同品牌的胎牛血清用于HL-60细胞分化,以及配制成调理缓冲液后对肺炎链球菌调理吞噬杀菌力的影响。方法 采用5个不同品牌(品牌1~5)的胎牛血清用于HL-60细胞分化培养液和调理缓冲液的配制,计算分化后细胞活力,并进行肺炎链球菌调理吞噬杀菌试验,比较对照孔菌数和质控血清的调理指数。结果 与品牌1胎牛血清分化细胞的活力相比较,品牌5分化的细胞活力差异具有统计学意义(P=0.023,P<0.05),而品牌2、3、4分化细胞的活力差异均不具有统计学意义(P=0.129、0.186、0.440,P>0.05);使用品牌5分化的细胞,对3、6A、7F、9V、14、18C、19A、19F血清群/型调理指数因为调理吞噬后菌落数过少,无法计算。使用品牌5配制的调理缓冲液,对3、9V、19F血清群/型调理指数因为调理吞噬后菌落数过少,无法计算。结论 为保障肺炎链球菌调理吞噬试验的稳定性,建议对试验过程中使用的胎牛血清进行筛选。 黄洋 徐潇 李康 李江姣 杜慧竟 郑锐 孙文媛 叶强关键词:肺炎链球菌 胎牛血清 应用分子生物学方法鉴定6群肺炎链球菌血清型 被引量:7 2016年 目的利用分子生物学方法,鉴定26株6群肺炎链球菌的血清型。方法利用6群肺炎链球菌荚膜多糖相关基因设计合成6对特异性引物,PCR扩增26株肺炎链球菌,并对PCR产物进行基因序列的测定及分析。结果26株肺炎链球菌cpsD蛋白229个氨基酸中有7个突变点,第220~222位均没有缺失;其中,19株肺炎链球菌具有与wci Nα蛋白氨基酸序列完全一致的氨基酸组成,第150位均为Ala,第38位均为Asp,其余7株与wciN_α蛋白氨基酸序列没有相似性,但与wciN_β蛋白氨基酸序列相似性超过99%;15株wciP蛋白第195位为Ser,11株wci P蛋白第195位为Asn。综合分析比对后,26株6群肺炎链球菌中,11株属于6A型肺炎链球菌,8株属于6B型肺炎链球菌,4株属于6C型肺炎链球菌,3株属于6D型肺炎链球菌。结论分子生物学方法可用于6群肺炎链球菌血清型的鉴定,为完善6群肺炎链球菌的菌种档案提供了实验依据。 陈琼 李康 梁丽 龙新星 黄洋 石继春 叶强关键词:肺炎链球菌 血清型 一株气管炎疫苗生产菌株的鉴定更名 被引量:1 2016年 目的:对中国医学细菌保藏管理中心库藏气管炎疫苗生产菌株重新鉴定并更名。方法同时培养库藏待检菌株CMCC(B)29108和对照用模式株DSM30007T,比较二者的形态、生理生化、脂肪酸成分等特性,对16S rRNA和rpoB基因进行系统进化分析以及DNA-DNA同源性测定。结果16S rRNA基因序列比对结果显示CMCC(B)29108与不动杆菌属(Acinetobacter)相近,与模式株鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii)DSM30007T 相似性最高,形态学特性、生理生化特性以及脂肪酸成分构成均与DSM30007T 十分相似,仅存在个别差异。基于Acinetobacter属所有成员的16S rRNA和rpoB基因的系统进化分析均显示CMCC(B)29108与DSM30007T 稳定聚类成一个独立分支,且二者的DNA-DNA同源性为100%。结论基于表型、系统进化学以及化学成分的鉴定研究结果,CMCC (B)29108为鲍曼不动杆菌种内区别于模式株的一株菌,可用于气管炎疫苗生产,建议更名为鲍曼不动杆菌( Acinetobacter baumannii)。 石继春 杜慧竟 梁丽 李康 徐潇 邢玉华 陈翠萍 叶强关键词:气管炎疫苗 菌种鉴定 鲍曼不动杆菌