曾颖
- 作品数:5 被引量:9H指数:2
- 供职机构:新疆维吾尔自治区人民医院更多>>
- 发文基金:国际科技合作与交流专项项目更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 黑素瘤相关DNA甲基化位点的初步筛查及异常甲基化谱的构建被引量:2
- 2021年
- 目的运用基因芯片技术筛查与黑素瘤相关的DNA异常甲基化位点,初步构建黑素瘤特异性甲基化谱。方法采用Illumina Human Methylation 450K全基因组甲基化芯片对6例黑素瘤组织及其瘤旁组织标本进行全基因组DNA检测,得出差异DNA甲基化位点。采用Gene Ontology(GO)富集分析及KEGG_Pathway分析了解基因功能。结果基因芯片检测结果显示,黑素瘤组织与瘤旁组织存在差异甲基化位点,共27779个,其中16673个为高甲基化位点,11106个低甲基化位点。提高筛选条件为P<0.01、︳Δβ︳>0.2,过滤掉所有单核苷酸多态性相关探针、位于XY染色体上的探针以及交叉反应的探针,共筛选得到4883个差异甲基化位点,其中1459(30%)个位于启动子区(包括TSS1500、TSS200、5′UTR、1st Exon)。GO富集分析显示,差异甲基化基因参与的生物学过程主要包括细胞生长、分化、黏附、运动迁移、信号转导及转录调控等。KEGG_Pathway分析显示,差异甲基化基因主要参与黏着斑、癌症通路、转化生长因子β信号通路、磷脂酰肌醇信号通路、黑素生成、趋化因子信号通路、黏合连接、钙信号通路、细胞黏附分子、MAPK信号通路、Wnt信号通路、JAK-STAT信号通路。基于"启动子区高甲基化位点对应的前16个基因、出现甲基化频率最高(CpG位点≥7)的基因、具有一定的功能或参与某条信号通路"条件,选出8个基因(KAAG1、DGKE、SOCS2、TFAP2A、GNMT、GALNT3、ANK2、HOXA9)作为黑素瘤候选生物标志物。结论黑素瘤组织存在较多高甲基化基因,8个差异甲基化基因有可能作为黑素瘤的生物标志物。
- 陈丽君李婷婷赵娟曾颖王鹏康晓静
- 关键词:DNA甲基化芯片分析技术生物学过程信号通路
- 肢端型黑素瘤NRAS基因突变检测及预后分析被引量:4
- 2016年
- 目的:分析肢端黑素瘤临床及病理特点,检测肢端型黑素瘤NRAS基因突变情况,探讨NRAS基因突变与疾病预后的关系。方法收集经病理确诊的55例肢端型黑素瘤患者的临床及病理资料,提取其石蜡包埋组织及15例色素痣石蜡包埋组织DNA,采用PCR及DNA直接测序法检测NRAS基因突变。采用Cox比例风险回归模型进行单因素和多因素分析。结果55例肢端型黑素瘤患者中,6例(10.9%)发生NRAS突变,突变位于61密码子,以Q61R为主。NRAS基因1、2外显子及15例色素痣组织未见上述突变。6例NRAS突变患者中,4例发生淋巴结转移。多因素Cox回归模型分析中,临床分期晚(RR=2.54,95%CI:1.062~6.066)、未手术切除(RR=2.98,95%CI:1.316~3.525)、存在NRAS突变(RR=2.73,95%CI:0.932~3.257)为预后不良的独立影响因素(均P〈0.05)。结论肢端型黑素瘤患者NRAS突变可能与淋巴结转移相关,临床分期、治疗方法、NRAS突变与预后有关。NRAS突变可能为肢端型黑素瘤提供一个新的预后评估指标。
- 曾颖康晓静张祥月靳颖柴莉曾明凤王莹王唯嘉
- 关键词:黑色素瘤突变预后
- PNL2单克隆抗体在黑素瘤中的表达及其意义的相关分析
- 目的 检测PNL2 单克隆抗体在不同类别黑素瘤中的表达情况,探讨PNL2 单克隆抗体与黑素瘤的诊断、侵袭转移、预后的关系和临床意义.方法 采用免疫组织化学SP 法检测60 例黑素瘤石蜡包埋组织(黏膜16 例,肢端28 例...
- 康晓静曾颖王朋热依拉·莫合塔尔刘广勇赵娟柴莉彭吕娇曾明凤王莹
- DNA甲基化与皮肤肿瘤的研究进展被引量:2
- 2015年
- DNA甲基化是表观遗传学的重要内容之一,该DNA修饰方式在不改变基因序列的前提下实现对基因表达的调控.多项研究证实,DNA甲基化异常与黑素瘤、皮肤基底细胞癌、皮肤鳞状细胞癌、皮肤T细胞淋巴瘤的发生密切相关,而DNA甲基化检测技术为检测DNA甲基化提供技术平台.通过甲基化检测技术分析基因异常甲基化已成为当前皮肤肿瘤早期诊断、治疗、预后评估等的方向.
- 曾颖康晓静
- 关键词:DNA甲基化黑色素瘤肿瘤基底细胞肿瘤鳞状细胞
- 人端粒酶反转录酶mRNA在不同类型黑素瘤中的表达及其意义被引量:1
- 2016年
- 目的:检测黑素瘤组织中人端粒酶反转录酶(hTERT)mRNA的表达,并分析其表达与黑素瘤类型及患者临床病理特征之间的关系。方法采用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)法检测64例黑素瘤组织和30例色素痣组织中hTERT mRNA表达水平;采用SPSS 17.0软件分析黑素瘤hTERT mRNA的表达与临床病理特征间的关系。结果黑素瘤组织中hTERT mRNA相对表达水平为52.43±5.42,高于色素痣组织的21.38±3.73,差异有统计学意义(t=4.72,P=0.000)。hTERT mRNA的表达与黑素瘤患者的年龄、性别、民族均无关(均P>0.05),而与黑素瘤类型、淋巴结转移、Clark分级相关(均P<0.05)。黏膜黑素瘤中hTERT mRNA表达水平高于肢端、非肢端黑素瘤(t=7.71,P=0.001),而肢端、非肢端黑素瘤间差异无统计学意义(P>0.05)。结论黑素瘤组织中hTERT mRNA的表达升高,其中以黏膜黑素瘤尤为显著。 hTERT可能与黑素瘤的发生、发展相关。
- 曾明凤康晓静曾颖柴莉吴秀娟赵娟孙振柱王莹王唯嘉
- 关键词:黑素瘤黏膜人端粒酶反转录酶实时荧光定量聚合酶链反应