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李俊: 作品数：13 被引量：64H指数：4; 供职机构：贵州大学动物科学学院更多>>; 发文基金：贵州省农业动植物育种专项项目中央级公益性科研院所基本科研业务费专项教育部科学技术研究重点项目更多>>; 相关领域：农业科学生物学更多>>

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从江香猪MC4R基因多态性及生物信息学分析被引量：3: 2015年; [目的]旨在对3个群体猪MC4R基因进行SNPs筛选,为从江香猪选种选育提供一定的理论基础。[方法]以从江香猪作为研究对象,野猪×从江香猪二元杂交猪和杜×大×长外三元杂交猪作为对照,构建品种DNA池,PCR扩增MC4R基因外显子、内含子和3’非编码区序列,采用直接测序法对3个群体的MC4R基因进行单核苷酸多态性检测,利用生物信息学软件预测不同多态性位点对MC4R基因mRNA二级结构和蛋白质二级结构的影响。[结果]在3个群体中共检测出10个SNPs位点,其中,C860T、G1392A和G1577A位于第2外显子区;G1699A、T1702A、A1870C、G1875A、C2025T、G2073A和A2111T位于3’非编码区序列。C860T为同义突变,G1392A和G1577A为错义突变,分别导致了精氨酸变为组氨酸、天冬氨酸变为天冬酰胺。经分析软件预测,处于第二外显子中的3个SNPs位点对MC4R基因的mRNA二级结构、蛋白质二级结构有一定的影响。[结论]DNA池结合测序技术检测到MC4R基因外显子、内含子和3’非编码区序列共10个SNPs。; 张雄张勇李俊杨红彭松何琦张宇君; 关键词：从江香猪 MC4R基因 SNPS 生物信息学

3个贵州地方鸡种NKX2-5基因多态性及生物信息学分析被引量：3: 2014年; 以高脚鸡、威宁鸡、乌蒙乌骨鸡(含白壳蛋鸡和绿壳蛋鸡)3个贵州地方鸡种为研究对象,构建品种DNA池,扩增NKX2-5基因第1外显子全部序列及第2内含子部分序列,采用直接测序法对3个品种(4个群体)的NKX2-5基因进行单核苷酸多态性检测,利用生物信息学软件预测不同多态性位点对NKX2-5基因mRNA二级结构、蛋白质二级结构的影响。结果表明,在3个品种(4个群体)中共检测到G108A、T288C、C400T、T420G和G429A5个SNPs位点,其中,G108A位于非编码区;T288C、C400T位于第1外显子区;T420G和G429A位于内含子区。T288C和C400T均为错义突变,T288C突变导致丝氨酸(Ser)变为脯氨酸(Pro)、C400T突变导致丙氨酸(Ala)变为缬氨酸(Val),SNPs位点对于NKX2-5基因mRNA二级结构、蛋白质二级结构有一定影响。; 杨红孙鹃裘贵华宋汝谋杨开明朱明贵李俊张勇; 关键词：SNPS 生物信息学

两种中草药添加剂对从江香猪仔猪生长性能及血清免疫指标的影响被引量：21: 2017年; 本试验旨在探索2种中草药添加剂对从江香猪仔猪生长性能、血清生化及免疫指标的影响。本试验选用36头体重(10.35±0.93)kg、60日龄断奶的从江香猪仔猪,随机分为3组,每组3个重复,每个重复4头。各组试验猪分别饲喂基础饲粮(对照组)、基础饲粮+1 000 mg/kg板蓝根粉剂(板蓝根组)、基础饲粮+1 000 mg/kg紫苏籽提取物(紫苏籽提取物组),试验期为45 d。结果表明:紫苏籽提取物组耗料增重比(F/G)显著低于对照组(P<0.05);紫苏籽提取物组尿素氮(BUN)显著低于板蓝根组和对照组(P<0.05),紫苏籽提取物组和板蓝根组总蛋白(TP)、白蛋白(ALB)和球蛋白(GLO)水平均显著高于对照组(P<0.05);各试验组间白细胞分类计数差异水平不显著(P>0.05);紫苏籽提取物组免疫球蛋白G(Ig G)显著高于板蓝根组和对照组(P<0.05),各试验组免疫球蛋白M(Ig M)均显著高于对照组(P<0.05)。由此可知,2种中草药添加剂均可改善从江香猪仔猪免疫性能,添加紫苏籽提取物具有增加仔猪生长发育和营养代谢的功效。; 张勇张雄陆静谢蝶李俊白优龙泳; 关键词：从江香猪紫苏籽提取物板蓝根血清生化指标

3个鸡种NKX2-5基因多态性与胫长的关联性分析: 2016年; 以贵州特有鸡种高脚鸡、矮脚鸡和百宜黑鸡为试验对象,利用PCR-SSCP和DNA测序等方法检测了NKX2-5基因T563C、C675T位点在3个试验鸡群中不同基因型与胫长的关联性。T563C与胫长关联分析表明,高脚鸡群体中TT基因型个体胫长显著高于CC型,百宜黑鸡群体中TT基因型显著高于CT型,矮脚鸡群体中不同基因型个体间胫长差异不显著;C675T突变位点在3个鸡种中只有CC和CT两种基因型,且各鸡种不同基因型个体间胫长差异不显著。; 杨红张勇何琦李俊张雄彭松; 关键词：胫长 SSCP 多态性

从江香猪不同组织脂蛋白脂酶mRNA的表达及其酶活性研究被引量：2: 2017年; 为进一步探究脂蛋白脂酶(LPL)基因的功能,揭示其对从江香猪肉质性状的影响,本研究采用荧光定量RT-PCR技术结合酶活性检测方法分析了从江香猪不同组织LPL基因表达水平及活性规律。结果显示,LPL基因在从江香猪大脑、心脏、肝脏、脾脏、肺、肾脏、大肠、背肌、子宫和卵巢10种组织内均有表达;其中,背肌和心脏组织中表达量较高,子宫和肺组织中表达量较低,且背肌中LPL mRNA表达量显著高于其他各组织(P<0.05)。从江香猪4种组织LPL活性分析结果表明,背肌组织中的LPL活性显著高于子宫和心脏组织(P<0.05),说明背肌中脂肪沉积能力高于子宫和心脏组织,研究结果将为今后分析该基因对从江香猪肉质性能的影响奠定基础。; 张雄张勇陈祥李俊李俊白优; 关键词：从江香猪酶活性 LPL RT-PCR

山羊痘病毒TaqMan-MGB荧光定量PCR检测方法的建立与应用被引量：13: 2009年; 利用DNAStar分析了GenBank中所有8株羊痘病毒全基因序列,选取位于山羊痘病毒(AY077835)基因组gp064区域约64bp的基因片段,设计并合成了一对PCR引物和一条TaqMan-MGB探针,建立了FQ-PCR和标准曲线,并利用该方法对山羊痘临床皮肤痘疹材料和人工感染动物材料进行GPV核酸检测。结果表明,构建的FQ-PCR具有良好的敏感性、特异性、稳定性和临床应用性。该方法的建立为山羊痘临床快速高效地诊断和山羊痘病毒感染羊只的发生、发展及转归研究提供了一种有效的手段。; 程振涛岳筠李永明许乐仁王开功周碧君陈军义李俊江楠; 关键词：山羊痘病毒荧光定量PCR

猪肌分化因子1基因启动子区多态性及生物信息学研究被引量：6: 2016年; 为揭示猪肌分化因子(myogenic differentiation 1,MyoD1)基因启动子区多态性,本试验分别以野猪×从江香猪二元杂交猪、杜×长×大外三元杂交猪及贵州宗地花猪为研究对象,采用DNA池和直接测序技术,筛选MyoD1基因5′UTR及部分第1外显子区SNP位点,利用生物信息学软件预测SNP位点对核心启动子区、CpG岛和转录因子结合位点的影响。结果表明,在MyoD1基因5′UTR及部分第1外显子区筛查到3个SNPs位点,分别为A-39G、T+150C和C+227G;生物信息学软件预测发现,A-39G位点附近出现重要转录因子结合位点消失和新位点生成;CpG Island searcher软件分析得到多态位点突变前后CpG岛大小及GC含量发生改变,据此推测猪MyoD1基因5′UTR区域的A-39G位点对调控启动子功能元件有重要影响。; 张雄张勇陈祥李俊白优陈村年李冬光; 关键词：SNP 启动子生物信息学

从江香猪DRD1基因多态及其生物信息学分析被引量：3: 2017年; 为揭示猪DRD1基因多态性,本研究以从江香猪为研究对象,以外三元(杜×长×大)杂交猪及贵州宗地花猪为对照,采用DNA池和直接测序技术,筛查DRD1基因所有外显子区SNPs位点;利用生物信息学软件估算等位基因频率并预测SNPs位点对m RNA二级结构的影响。结果表明,在DRD1基因中共筛查到1个SNPs位点,位于5'UTR区为T-182G;从等位基因频率角度分析,从江香猪与贵州宗地花猪估算得到的等位基因频率较一致,与外三元(杜×长×大)杂交猪却存在较大差异;利用RNA secondary structure prediction软件预测,发现m; 白优张勇陈祥李俊李俊张雄何琦; 关键词：从江香猪多态性生物信息学

从江香猪BMP15基因多态性研究及单倍型构建被引量：5: 2016年; 研究BMP15基因多态性及单倍型与从江香猪繁殖性状的相关性,寻找影响从江香猪繁殖性状的QTL,为分子标记辅助选择提供依据。以从江香猪母猪为研究对象,利用DNA直接测序技术,对BMP15基因多态位点进行筛选和基因型分析,采用SHEsis在线软件构建单倍型。结果表明:在受试群体中,发现BMP15基因存在3个SNPs位点,其中C122T位于exon1,T111C位于exon2,A13G位于intron1;C122T和T111C突变均为错义突变,分别导致半胱氨酸(Cys)变为精氨酸(Arg),组氨酸(His)变为酪氨酸(Tyr)。基于上述3个SNPs位点,构建了6种单倍型,其中H1和H3为主要单倍型,频率分别为64.2%、24.3%;最小二乘分析发现,H3单倍型在初产和经产母猪中,总产仔数、产活仔数、乳头数均为最高,但差异性均不显著(P>0.05);C122T位点与初产母猪的总产仔数、产活仔数、乳头数显著相关(P<0.05),而T111C位点与初产和经产母猪的总产仔数、产活仔数、乳头数差异性均不显著(P>0.05),但CC基因型和EE基因型均为最多;在A13G位点上,经产母猪AB基因型总产仔数、产活仔数、乳头数均比AA基因型多,且差异显著(P<0.05)。可以考虑将H3单倍型和CC基因型、AB基因型及EE基因型作为影响从江香猪产仔数和母猪乳头数的有利单倍型和基因型。; 李俊张勇杨红张雄龙泳; 关键词：从江香猪 BMP15基因多态性单倍型繁殖性状

从江香猪SIM1基因SNPs筛查及生物信息学分析被引量：3: 2015年; 本研究以从江香猪为研究对象,二元杂交猪(从江香猪×野猪)、外三元杂交猪(杜×长×大)为对照,采用DNA池和直接测序技术对3个群体的SIM1基因7个外显子、部分内含子以及3′非翻译区序列进行多态性检测;利用生物信息学软件预测多态位点对SIM1基因mRNA二级结构和蛋白质一级、二级结构的影响。结果表明,在3个群体的SIM1基因中筛查到12个SNPs,C77T位于第5外显子,T29186C、A29195C位于第9内含子,C63T、C225T位于第10外显子,C107T、A426G、T583C、A586C、A605C、A615C位于第11外显子,G267T位于3′非翻译区。其中C77T、T29186C、A29195C、C63T、C225T、C107T、G267T为同义突变,A426G、T583C、A586C、A605C、A615C为错义突变;5个错义突变分别导致异亮氨酸(Ile)变为缬氨酸(Val)、亮氨酸(Leu)变为脯氨酸(Pro)、谷氨酸(Glu)变为丙氨酸(Ala)、谷氨酸(Glu)变为天冬氨酸(Asp)、天冬酰胺(Asn)变为组氨酸(His);根据在线软件预测,突变前后的SIM1基因mRNA二级结构和蛋白质一级、二级结构均会发生改变。; 李俊张勇杨红张雄; 关键词：从江香猪 SNPS 生物信息学

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