贾阳
- 作品数:29 被引量:64H指数:5
- 供职机构:中国农业科学院研究生院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域:环境科学与工程化学工程农业科学轻工技术与工程更多>>
- 一种可同时降解毒死蜱和萘的施氏假单胞菌
- 本发明提供了一种能够同时降解毒死蜱和萘的施氏假单胞菌,该菌株命名为YC-YH1,保藏编号为CGMCC No.9624。该菌能够在4天内将无机盐培养基中同时含有的100mg/L浓度毒死蜱和100mg/L浓度萘的混合物同时1...
- 闫艳春史延华任磊贾阳
- MehpH的生化与结构特性(英文)
- 2018年
- 【目的】本研究旨在系统探究环境因素对邻苯二甲酸单乙基己基酯水解酶(monoethylhexyl phthalate hydrolase,MehpH)活性的影响,模拟该酶的3D结构并分析活性中心氨基酸残基与底物之间的相互作用。【方法】根据标准的酶学实验验证了环境因素对酶活性的影响。该酶的基本结构分析由DNAMAN(2.1)分析所得,同时利用SWISS-MODEL对其3D模型进行预测,并通过PyMOL软件对相关结果作了可视化处理。Autodock工具,Swiss-Pdb以及Py MOL均用以酶与邻苯二甲酸单乙基己基酯(monoethylhexyl phthalate,MEHP)的相互作用分析。【结果】该酶的初级结构与已报道Gordonia sp.P8219菌株中的酯类水解酶相似,该酶的最适温度与p H(分别为40°C和8.0)和菌株P8219有所不同;该酶在有机溶剂、洗涤剂和金属离子环境中表现出良好的稳定性;然而,其酶活受2 mol/L的Ni^(2+)、Fe^(3+)、Cu^(2+)和Zn^(2+)离子,1 mol/L苯甲基磺酰氟(PMSF),0.5 mol/L的对氧磷,1 mol/L苯基醚(PGO),2 mol/L焦碳酸二乙酯(DEPC)和5 mol/L的毒扁豆碱所抑制。丝氨酸水解酶中高度保守五肽基序GXSXG与催化三联体HSD结构均存在于该酶的编码序列中。根据分子对接结果,Thr152与Ser230在水解酶与其模板之间也显得更为保守,且与MEHP联系较为紧密(分别为5.8?和3.6?),可能起着重要的催化作用。而MEHP与催化氨基酸残基Ser125、His291、Asp259并不十分靠近。【结论】YC-RL2中MehpH在有机溶剂、洗涤剂以及金属离子环境中具有稳定的生物活性,表明其具有良好的应用潜力。酶的结构及活性中心得到了初步的分析,对于催化机理及酶改造研究具有重要意义。
- Ruth Nahurira贾阳任磊王俊欢乔铖樊双虎王海胜闫艳春
- 关键词:生化特性水解酶结构特性
- 节杆菌(Arthrobacter sp.)CN2对对硝基苯酚的趋化性研究被引量:2
- 2016年
- 利用已获取的对硝基苯酚降解菌CN2,以对硝基苯酚为底物,通过游动平板趋化性、土壤趋化性实验以及毛细管趋化性实验对该菌株的趋化特性进行了研究,同时通过模拟土壤原位修复探究了菌株在实际应用中的效果。高效液相色谱检测结果表明,72 h内菌株CN2对对硝基苯酚的降解率大于99%。CN2在平板趋化性与土壤趋化性实验中均表现出对对硝基苯酚的趋化性特征,毛细管趋化性实验中,当对硝基苯酚浓度在一定范围内(5~800 mg·L^(-1))时,菌株的趋化性与对硝基苯酚浓度呈正相关,当其浓度高于800mg·L^(-1)时,菌株的趋化性逐渐受到抑制。模拟土壤原位修复实验的结果表明,菌株CN2在未灭菌土壤中的对硝基苯酚降解速率高于灭菌后土壤中的降解速率,在14 d内其降解率可达95%。研究表明,该菌株对环境具有良好的适应性,其对污染环境修复具有应用价值与潜力。
- 乔铖任磊贾阳樊双虎王俊欢闫艳春
- 关键词:节杆菌对硝基苯酚趋化性环境修复
- 施氏假单胞菌YC-YH1对有机磷农药的降解特性研究
- 多年来,在农业生产过程中我们大量使用有机磷农药,虽然有效保障了粮食果蔬的产量,但也导致了有机磷农药残留及环境污染。使得大气、土壤、水体等环境都遭到了不同程度的污染,严重危害了人类的生命安全。高效清除环境中残留的有机磷农药...
- 贾阳
- 关键词:有机磷农药施氏假单胞菌降解特性有机磷水解酶酶学性质
- 文献传递
- 食碱戈登氏菌YC-RL2及其应用
- 本发明提供一种能够降解多种邻苯二甲酸酯类物质的食碱戈登氏菌(Gardenia alkanivorans)YC‑RL2,其保藏编号为CGMCC No.10992。该菌能够在5天内将无机盐培养基中含有的100mg/L邻苯二甲...
- 闫艳春任磊贾阳乔铖
- 文献传递
- 芳香族污染物降解菌节杆菌YC-RL1的基因组测序
- 基因组测序技术与生物信息学分析的飞速发展,为全面、精确地解析基因组所携带的遗传信息,从而破解其所包含的生命特征,揭示生命的复杂性、多样性提供了巨大的帮助。对于污染物的生物降解,尤其是微生物降解,以其高效、低成本且无二次污...
- 乔铖王俊欢Nahurira Ruth贾阳任磊闫艳春
- 烟嘧磺隆的生物降解机制及其促进子宫内膜癌细胞HEC-1B增殖研究
- 磺酰脲类除草剂具有高效、低毒等特点,在农业生产中被广泛使用,环境中残留的磺酰脲类除草剂已严重影响生态环境和人类健康.以微生物为主导的生物降解被认为是一种绿色和高效的农药降解方法.本实验从烟嘧磺隆生产工厂排污口的活性污泥中...
- 冯为民杨婷贾阳王嘉翼王俊欢樊双虎赵百锁闫艳春
- 关键词:增殖系数
- 联苯利用节杆菌YC-RL1中2,3-二羟基联苯-1,2-双加氧酶BphC功能验证被引量:1
- 2017年
- 【目的】通过节杆菌(Arthrobacter sp.)YC-RL1对多氯联苯降解过程中关键基因bph C的克隆与原核表达,鉴定其编码的2,3-二羟基联苯-1,2-双加氧酶Bph C的酶活特性与功能。【方法】以菌株YC-RL1全基因组为模板进行PCR扩增获得bph C基因,将该基因转入Escherichia coli BL21(DE3)感受态细胞后进行原核表达;利用镍柱亲和层析法对Bph C酶进行纯化并分别测定该酶在不同条件下对底物2,3-DHBP的催化特性,确定其最适反应pH、温度及不同金属离子对酶活特性的影响;进一步根据米氏方程对该酶的动力学参数进行测定与分析。【结果】通过PCR扩增获得了bphC基因,其大小为930 bp;对该基因进行原核表达,所得重组蛋白BphC携带有6个组氨酸标签,经纯化后体外仍具有活性,该酶作用于2,3-DHBP时的最适pH与温度分别为pH 7.4和30°C,且在最适条件下,Fe^(2+)、Cu^(2+)及Cd^(2+)等金属离子可明显促进其酶活作用,但多数金属离子对该酶有不同程度的抑制作用;该酶在与底物2,3-DHBP作用过程中,酶促动力学常数分别为K_m:8.67 mmol/L,V_(max):27.32μmol/s,k_(cat):15.55 s^(–1),k_(cat)/K_m:1.79 L/(mmol·s),其催化效率同有关报道中同类酶的动力学特性比较均有所提高。【结论】菌株YC-RL中的bphC基因对于多氯联苯的生物降解具有至关重要的作用,其编码的BphC是重要的芳香环裂解酶,该酶对其底物具有较高的亲和性,可在体外环境中发挥高效的酶促作用,具有良好的应用价值。
- 乔铖任磊樊双虎贾阳赵百锁闫艳春
- 关键词:多氯联苯生物降解酶促动力学
- 一种节杆菌属细菌及其应用
- 本发明提供一种节杆菌属细菌及其应用。该菌为YC‑RL1,保藏编号为CGMCC No.10611,其能够在4天内将无机盐中萘、芴、联苯、1,2,3,4‑四氯苯和对硝基苯酚各100mg/L的混合物同时100%降解。该菌对于盐...
- 闫艳春任磊史延华贾阳
- 文献传递
- 施氏假单胞菌YC-YH1的萘降解特性及产物分析被引量:14
- 2015年
- 【目的】萘是一种重要的环境污染物,它在环境中的积累会对人类健康造成危害,生物降解是解决这一问题的有效方法。本实验室保存的施氏假单胞菌YC-YH1对萘具有较强的降解能力,在此基础上,研究和分析菌株对萘的降解特性、环境因素对萘降解率的影响以及代谢产物。【方法】采用单因素实验法研究pH、温度、接种量、萘初始浓度对萘降解率的影响;并在单因素实验结果的基础上,利用Design-Expert 8.0.5软件和Box-Behnken设计对pH、温度、接种量3个影响因素进行响应面优化分析,建立环境因素对萘降解率影响的优化模型。利用LC-MS检测萘降解过程中产生的重要代谢产物,从而推测菌株对萘的代谢途径。【结果】响应面分析结果表明,优化模型极显著(P<0.001),拟合度良好,预测结果可信度高。降解实验证明,在培养温度为32.4°C、pH为7.10、接种量5.74%(体积比)的优化条件下培养3 d即可将浓度为100 mg/L的萘100%降解。LC-MS分析表明,菌株降解萘的过程中,能够被检测到的主要代谢产物有1,2-二羟基萘、水杨酸、邻苯二酚等。【结论】施氏假单胞菌YC-YH1对萘有高的降解效率,pH、温度、接种量3个因素对菌株的降解率有较大影响。利用响应面法优化菌株对萘的降解条件,能够提高YC-YH1菌株对萘的生物降解性能。初步推测菌株YC-YH1对萘的降解是通过水杨酸途径,萘首先被其代谢为1,2-二羟基萘,而后被转化为水杨酸和邻苯二酚,最后进入三羧酸循环被彻底降解。
- 史延华任磊贾阳赵百锁闫艳春
- 关键词:施氏假单胞菌生物降解响应面法降解途径