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周伟: 作品数：14 被引量：43H指数：5; 供职机构：扬州大学兽医学院更多>>; 发文基金：国家自然科学基金江苏省自然科学基金江苏高校优势学科建设工程资助项目更多>>; 相关领域：农业科学生物学自动化与计算机技术更多>>

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鸡16号染色体SNP单倍型和拷贝数变异对血清IgG含量的影响被引量：1: 2013年; 旨在探讨鸡16号染色体SNP单倍型和拷贝数变异（Copy number variation，CNV）对血清IgG含量的影响。采用鸡60KSNP芯片对995只北京油鸡进行分型，同时测定80日龄IgG含量。分别采用PennCNV、Haplo-view4．1和PHASE2．0软件对拷贝数变异、连锁不平衡、单倍型分析及与IgG的关联分析。结果发现，该区域存在2个单倍型块和2个拷贝数变异区。Block159984～73717bp）单倍型分析发现3种单倍型和6种双倍型，其中双倍型H1H2血清中IgG含量是H3H3的1．45倍（P〈0．05）；Block2（102256～138076bp）内发现9种单倍型和9种常见双倍型，不同型之间差异不显著（P〉0．05）。CNV1（6471～59984bp）是稀有型拷贝数变异区；CNV2（201882～299166bp）缺失型IgG含量是增加型的1．25倍（P〈0．05）。分析挑选出8个与IgG抗体含量相关的SNP位点，结果发现Gga-rs16057310、Gga-rs15788237及Gga-rs15788101不同基因型之间差异显著（P〈0．05）。结果表明：Blockl和拷贝数变异CNV2（201882299166bp）及SNP位点Gga_rs16057310、Gga_rs15788237、Gga-rs15788101对IgG含量有显著影响，位于这些区域附近含有CD1b、TRIM27、ZNF692及MHC与免疫机能相关的重要基因。; 周伟刘冉冉郑麦青文杰赵桂苹陈国宏常国斌张磊孙艳发李鹏孙艳; 关键词：16号染色体 CNV 血清IGG

基于Web的中国地方鸡品种生物信息查询系统的设计与实现: 2011年; 构建独立的中国地方鸡品种生物信息查询系统是解决海量地方鸡品种信息存储和快速搜索策略问题的基础。该系统结合鸡的遗传与育种实际,立足中国特色资源,采用ASP编程技术和Microsoft SQL Server 2005数据库技术,以Windows 2003 Server为开发平台,将相关异质数据快速生成生物信息二次数据库,与Web系统链接,通过后台进行实时更新,并添加数据分析功能,初步实现系统的应用。详细介绍了中国地方鸡品种生物信息查询系统的设计、开发以及实现过程,为农业信息化奠定基础。; 栾德琴陈国宏常国斌周伟马腾戴爱琴李芹盛中伟白云峰包文斌; 关键词：生物信息 WEB系统

鸡肌内脂肪性状候选基因的聚合效应及初步验证被引量：5: 2011年; 【目的】旨在探讨影响鸡脂肪性状重要候选基因A-FABP、Ex-FABP的聚合效应,并对其进行初步验证,为进一步开发利用脂肪性状的有效分子标记提供依据。【方法】运用PCR-SSCP技术分别检测如皋鸡A-FABP、Ex-FABP基因所有外显子区域的单核苷酸多态性(SNPs),分析单基因型和聚合基因型与12周龄胸肌脂肪含量之间的关系;同时,采用荧光定量PCR技术检测后代分离群体单基因型和聚合基因型的发育性表达规律,进行聚合基因型遗传效应的初步验证。【结果】如皋鸡A-FABP的外显子3、Ex-FABP基因外显子4区域中存在A/G突变,共出现3种基因型;AA型(A-FABP)、BB(Ex-FABP)型个体的肌内脂肪含量显著高于其它基因型(P<0.05),为有利基因型,两者聚合的AABB型个体同样为最佳基因型。经后代分离群体Q-PCR证实,单基因表达和聚合基因型的表达均不存在性别效应,在胸肌组织中,两候选基因在4周龄时表达量最高,8周龄下降,至12周龄缓慢上升。在聚合基因型个体中,均以AABB型表达水平最高,ABAB型表达量较低。【结论】A-FABP、Ex-FABP两个基因存在聚合效应;其中,AABB型与胸肌组织中高肌内脂肪含量具有紧密关联性。A-FABP、EX-FABP两基因及其聚合基因型可作为如皋鸡肌内脂肪性状有效的候选标记。; 常国斌刘向萍陈蓉栾德琴王克华张颖马腾周伟戴爱琴陈国宏; 关键词：肌内脂肪基因型

鸡GPC1基因外显子8的SNPs与部分免疫性状的相关性分析: 2012年; 采用PCR-SSCP对12个不同鸡种glypican-1(GPC1)基因外显子8的单核苷酸多态性进行检测,同时检测如皋鸡、安卡鸡和文昌鸡3个鸡种56日龄的5个免疫性状,进一步分析SNP位点与免疫性状的关系。结果表明:12个鸡种中均出现3种带型,存在g.155 C>A错义突变,引起苏氨酸突变为精氨酸。12个鸡种群中,AA、AB和BB基因型平均频率分别为0.259、0.545和0.211;平均观察杂合度为0.466,平均Shannon信息指数为0.671。除乌骨鸡、大骨鸡偏离了Hardy-Weinberg平衡外(P<0.05),其余群体均处平衡状态。基于该位点构建的UPGMA聚类图将12个鸡种分为3大类,反映了12个鸡种在抗性方面存在的差异。经过关联分析,如皋、安卡鸡中AB型个体的IL-1浓度、H/L值与BB型存在显著差异,与AA型差异不显著;在其他免疫性状中各基因型之间均无显著差异。安卡鸡的一般抗性总体低于如皋鸡和文昌鸡。; 盛中伟常国斌栾德琴周伟胡国顺刘艳李芹陈国宏; 关键词：单核苷酸多态性免疫性状

如皋鸡不同时期肌肉组织生长相关基因的表达谱分析被引量：4: 2012年; 旨在了解如皋鸡不同时期肌肉生长发育机制。本研究利用基因芯片技术,分析在不同生长阶段下(2～12周龄)如皋鸡肌肉组织基因的表达情况。获得了13 379个基因的差异表达动态图谱。在不同生长阶段下肌肉组织生长基因的表达发生变化,与2周龄相比,4和12周龄下调表达的基因数量多于上调表达的基因数量,6、8和10周龄下调表达的基因数量少于上调表达的基因数量。同时对杂交数据进行多种聚类分析。利用实时荧光定量PCR验证4个基因的差异表达,其结果和芯片杂交分析的结果基本一致。初步建立了不同时期肌肉生长应答基因的动态表达谱,比较全面地获得了肌肉生长应答基因,初步揭示了如皋鸡不同时期肌肉生长发育机制。; 栾德琴常国斌盛中伟黄正洋周伟龚琳琳陈丹艳刘岩王克华窦套存陈国宏; 关键词：如皋鸡肌肉生长基因芯片实时荧光定量PCR

细菌内毒素对鸡NLRC5受体及IFN基因转录的影响被引量：9: 2011年; 本研究旨在探讨鸡NLRC5受体及IFN基因对不同细菌内毒素的诱导表达变化,为禽类NLRC5受体的分子功能及其参与先天免疫调控的作用机制提供理论依据。用不同浓度的(0、0.1、1.0、10.0μg.mL-1)来自致病性大肠杆菌(E.coli,EC)和肠炎沙门氏菌(S.enteriditis,SE)的2种内毒素(LPS)分别刺激鸡天然巨噬细胞系(HD11)2、4和6h,在不同的时间点收集细胞,提取总RNA,并设计相关引物,利用荧光定量PCR分析鸡NLRC5受体以及下游功能基因IFNA和IFNB的转录量变化,探讨HD11细胞对不同来源的细菌内毒素的免疫反应。研究表明:与对照组相比,1.0和10.0μg.mL-1的EC-LPS、SE-LPS均能诱导HD11细胞产生免疫应答,但0.1μg.mL-1组未能诱导成功;不同细菌LPS诱导的免疫应答时间不一致,经EC-LPS诱导的NLRC5和IFNB基因均在刺激后6h达到转录高峰,与2、4h差异显著(P<0.05),与对照组差异极显著(P<0.01);但IFNA基因在2、6h达到高峰,而在4h下降,呈"V"型转录趋势。SE-LPS诱导的NLRC5和IFNA、IFNB转录量随时间均保持一直上升的趋势,在6h达到高峰,且与对照组及2、4h差异显著(P<0.05)。结果表明NLRC5受体与IFNA和IFNB共同参与了细胞对细菌内毒素的免疫应答,NLRC5基因可能对鸡先天免疫功能具有调节作用。; 常国斌陈蓉栾德琴张颖刘向萍马腾戴爱琴周伟陈国宏; 关键词：IFN 先天免疫

利用基因芯片技术研究隐性白鸡不同时期肌肉组织相关差异表达基因被引量：2: 2012年; 应用包含13 319条鸡基因探针序列的表达谱芯片,对从隐性白鸡不同时期肌肉组织抽提及纯化的cRNA进行芯片杂交,并对基因表达谱进行分析,旨在筛选隐性白鸡不同时期肌肉组织相关差异表达基因,探讨造成不同时期肌肉组织生长发育的分子生物学机理。结果显示,在不同生长时期(2周和12周)共筛选出差异表达基因78条(表达上调34条,表达下调44条),其中已知功能基因39条,主要涉及生长发育、分子代谢、免疫应答、生物合成、细胞通信以及蛋白质合成与分解等相关基因,其中包括一些尚未在GenBank上登陆的序列,推测可能是未知的新基因,它们在鸡生长发育、能量代谢等的过程所起到的作用还需进一步证明。; 栾德琴常国斌龚琳琳周伟陈丹艳刘岩王克华窦套存陈国宏; 关键词：基因芯片肌肉组织基因表达谱

如皋鸡不同时期肌肉组织生长相关基因的表达谱分析: 肌肉生长发育和分子代谢是十分复杂的生命活动，受多基因、多途径、多阶段的影响。到目前为止，涉及利用基因芯片技术研究鸡生长发育的分子机制报道较少，尤其是对我国地方鸡种研究更少，大大地制约了鸡肉品质研究的进展，利用基因芯片技术...; 栾德琴常国斌周伟陈国宏; 关键词：如皋鸡肌肉生长基因芯片实时荧光定量PCR

狼山鸡MHC多态性及血型与部分抗性性状关联的研究被引量：6: 2012年; 为探究血型与抗病性状的关系,本研究利用微卫星标记技术对狼山鸡MHC-Ⅰ和MHC-Ⅳ区遗传多样性及血型进行研究;同时检测了部分抗性性状,并分析不同血型与抗性性状的相关性。结果表明:狼山鸡MHC-I位点期望杂合度为0.4891,多态信息含量平均为0.3695;MHC-IV位点期望杂合度为0.6357,多态信息含量平均为0.5628。狼山鸡中共发现6种常见血型,即纯合型B4、B21、B13及其杂合型B4/B21、B4/B13和B13/B21;免疫性状检测结果发现B21综合抗性指标显著好于其他血型(P<0.05)。实验提示,可利用MHC-Ⅰ和MHC-Ⅳ区进行血型判定,且血型与免疫性状存在关联性。; 周伟常国斌陈国宏盛中伟徐琪陈福斌朱金金赵桂苹刘艳; 关键词：微卫星 MHC 血型免疫狼山鸡

鸡胚胎期和出生后Pax3基因时空表达规律的研究被引量：6: 2011年; 为探讨鸡Pax3基因在胚胎阶段以及不同生长阶段的时空表达规律,试验选取同一批鸡胚(8、16、20 d和21 d)以及2、4、6、8、10、12周龄的如皋鸡各6只,公、母各半,采用SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR技术分析了Pax3基因在胸肌、腿肌中的表达规律。结果表明:胸肌和腿肌组织中公、母鸡表达水平变化趋势一致,无性别效应;在胸肌组织中,Pax3基因在8 d的鸡胚中表达水平最高,随后降到最低,出雏前缓慢上升,出雏后随着周龄的增加表达水平保持在较低状态。但在腿肌组织中,Pax3基因的表达高峰在出雏前(20 d和21 d),出雏后随周龄的增加表达量持续降低,并保持在较低的水平。表明Pax3基因表达存在组织特异性,且集中在胚胎期大量表达,出雏后表达水平较低,揭示该基因可能对鸡肌纤维生长发育存在调控作用。; 常国斌刘向萍张颖戴爱琴马腾周伟陈国宏; 关键词：RT-PCR

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