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一种鉴定番茄果实干汁性状的差异性序列及其分子标记物与鉴定方法: 本发明公开了一种番茄果实干汁性状的差异性序列，该序列如SEQ ID NO：1所示，还提供了鉴定上述性状的方法与分子标记物，包括如核苷酸序列SEQ ID NO：2所示的上游引物，如核苷酸序列SEQ ID NO：3所示的下游...; 刘磊李君明舒金帅朱庆宝邓学斌冯晶晶白金瑞; 文献传递

加工番茄Ve-1、I-2、Mi-1和Pto基因关联变异位点的挖掘被引量：4: 2018年; 为了开发番茄抗黄萎病、枯萎病、根结线虫和细菌性斑点病基因的高通量分子标记,以189份加工番茄核心种质为试材进行低倍重测序(0.5×),群体结构和主成分分析结果均将材料分为2个大的亚群。利用混合线性模型(Mixed linear model,MLM)对抗病基因Ve-1、I-2、Mi-1和Pto的分子标记检测结果进行全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS),获得了与抗病基因紧密连锁的变异位点,并获得了Ve-1、I-2、Mi-1和Pto基因内部的单核苷酸多态性位点(Single nucleotide polymorphisms,SNPs),提高了基因检测的准确性。其中与Ve-1关联度最高的位点位于基因内部,与I-2、Mi-1与Pto关联度最高的位点位于基因侧翼,可能与不同材料内等位基因变异及变异频率有关。利用该群体还可以进行加工番茄其他性状的挖掘;通过明确等位基因的变异与材料抗病基因的关系获得的关联位点可以用于通量SNP标记的开发,进行分子辅助番茄育种,提高番茄育种效率。; 刘磊邓学斌冯晶晶王静孙晓荣舒金帅李君明; 关键词：番茄抗病基因全基因组关联分析变异位点

加工番茄核心种质构建及其遗传背景分析被引量：22: 2015年; 基于50年来收集的3 026份加工番茄不同类型种质资源,分别利用20个表型性状和均匀覆盖12条染色体的46个SNP标记,采用5种不同方法(Mstrat、Random、REMC、SBS和SFS)构建了10种初始核心种质。通过对其代表性评价与分析,最终确定了加工番茄最佳核心种质。Mstrat是构建加工番茄亚群核心种质的最佳方法,采用10%抽样比例所构建的302份最佳核心种质GCC1对原始种质的遗传结构和多样性均具有较好的代表性。通过对原始种质群体结构和主成分分析,加工番茄种质资源可分为2个较大的群体,遗传背景分别是基于代表性材料普通栽培番茄E6203和M82,所构建的GCC1核心种质均匀分布在原始种质资源群体。; 邓学斌刘磊闫喆李涛刘希艳冯晶晶池海娟郑峥李君明; 关键词：加工番茄 SNP标记核心种质

中国加工番茄资源遗传多样性分析被引量：12: 2016年; 基于构建的加工番茄核心种质,从3 026份自交系中选择了代表50年育种历程的615份,分别利用16个表型性状和81个(13对SSR、24对In Del、44个SNP)不同类型的多态性分子标记,对其遗传多样性进行了分析。结果表明,无论是基于表型还是基因型数据,供试自交系聚类结果基本一致,均分为两大群。其中表型聚类包括7个亚群,基因型聚类包括6个亚群。综合分析表型和基因型聚类结果,发现大多数早期(2010年以前)育成的自交系聚为一类,近年(2010年以后)育成的自交系不同程度地分布在两类中,说明近年育成的自交系遗传多样性更为丰富。在不同类型标记中,SNP在亚群中呈现更好的多态性,等位基因数、基因多样性、多态性信息量均明显高于SSR和In Del。; 刘希艳郑峥邓学斌冯晶晶白金瑞宋燕刘磊李君明; 关键词：加工番茄分子标记多态性

番茄果实干汁性状的特异性序列及其分子标记物与鉴定方法: 本发明公开了一种番茄果实干汁性状的特异性序列，该序列如SEQ ID NO：1所示，还提供了鉴定上述性状的方法与分子标记物，包括如SEQ ID NO：2所示的上游引物，如SEQ ID NO：3所示的下游引物，也提供了鉴定上...; 李君明刘磊舒金帅王佳彤白金瑞冯晶晶

一种鉴定番茄果实干汁性状的差异性序列及其分子标记物与鉴定方法: 本发明公开了一种番茄果实干汁性状的差异性序列，该序列如SEQ ID NO：1所示，还提供了鉴定上述性状的方法与分子标记物，包括如核苷酸序列SEQ ID NO：2所示的上游引物，如核苷酸序列SEQ ID NO：3所示的下游...; 刘磊李君明舒金帅朱庆宝邓学斌冯晶晶白金瑞

醋栗番茄Solanum pimpinellifolium遗传多样性分析被引量：13: 2017年; 野生种醋栗番茄包含丰富的变异,具有众多优良性状。本研究对从世界不同地区收集的433份醋栗番茄遗传资源进行了表型鉴定及遗传多样性分析。表型鉴定结果表明,在收集的433份醋栗番茄中约有14%为樱桃番茄,370份典型醋栗番茄中约22%的材料存在不同程度的分离。群体变异分析表明,不同性状间变异系数存在较大差异,其中柱头变异系数最大,为56.716%;花瓣数遗传稳定,变异系数最小,为2.082%;相关分析表明,多个性状间存在显著相关性;利用表型和基因型数据聚类均将醋栗番茄群体划分为两大类群;主成分分析表明,坐果率、单果重、可溶性固形物对变异的贡献率较大。研究结果将为利用醋栗番茄进行栽培种番茄遗传改良奠定一定的基础。; 冯晶晶刘磊郑峥邓学斌刘希艳白金瑞舒金帅宋燕李君明; 关键词：表型

番茄果实干汁性状的特异性序列及其分子标记物与鉴定方法: 本发明公开了一种番茄果实干汁性状的特异性序列，该序列如SEQ ID NO：1所示，还提供了鉴定上述性状的方法与分子标记物，包括如SEQ ID NO：2所示的上游引物，如SEQ ID NO：3所示的下游引物，也提供了鉴定上...; 李君明刘磊舒金帅王佳彤白金瑞冯晶晶; 文献传递

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