赵启红
- 作品数：4 被引量：18H指数：2
- 供职机构：北京林业大学生物科学与技术学院林木育种国家工程实验室更多>>
- 发文基金：北京市自然科学基金北京市科委项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 植物镉富集PCS基因的生物信息学分析被引量：1
- 2015年
- 植物络合素是植物细胞中的小分子多肽,可以螯合重金属离子并储存于液泡中,起到降低毒性和富集重金属的作用。植物络合素合酶基因(PCS)是植物络合素合成过程的关键基因,本研究对15种植物镉(Cd2+)富集相关的PCS基因序列进行了生物信息学分析。结果表明,PCS具有保守的外显子组成;位于PCS肽链N端的氨基酸序列一致率达到82.54%,位于C端的氨基酸序列一致率为63.37%;PCS含量最多的氨基酸为亮氨酸(11.17%),色氨酸含量最少(1.63%);PCS具有保守的催化活性中心Cys70、His176、Asp194;不同PCS基因的密码子偏好使用性差异明显,高频密码子平均数量超过9个。研究结果显示,不同PCS基因既有保守的结构组成,也显现出种属的差异,可以用于物种的分类和亲缘关系分析。研究结果为PCS基因的功能及作用机制研究提供了重要的科学依据。
- 丁亚娜陈永坤刘海珍赵启红徐吉臣
- 关键词：CD^2+抗性生物信息学
- 美洲商陆谷氧还蛋白基因PaGRXC13的克隆与生物信息学分析被引量：3
- 2016年
- 谷氧还蛋白(Glutaredoxin,GRX)是一类小分子氧化还原酶,能够调节蛋白质的氧化还原状态,在逆境胁迫中发挥重要的作用。本研究从美洲商陆鉴定克隆了一个重金属镉诱导表达的谷氧还蛋白基因Pa GRXC13。该基因全长306 bp,编码101个氨基酸。Pa GRXC13蛋白分子量约为11.189 k D,属于典型的CC型谷氧还蛋白。Pa GRXC13与不同来源CC型谷氧还蛋白的氨基酸序列保守性较高,一致率介于67.0~83.5%之间。系统进化分析显示,Pa GRXC13与菠菜(Spinacia oleracea)、中粒咖啡(Coffea canephora)和克莱门柑橘(Citrus clementina)的GRXC13处在同一个进化分支上。该基因在美洲商陆的叶和须根中具高转录水平,在块根和茎中表达量低。
- 陈永坤赵启红刘海珍周天行徐吉臣
- 关键词：美洲商陆克隆生物信息学
- 北方城市绿化常用灌木树种抗旱性评价被引量：12
- 2016年
- 灌木树种是城市绿化的重要组成部分。本研究以目前北方城市绿化造林常用的13个灌木树种为材料,测定其生理指标,并对各项生理指标进行主成分和隶属函数分析,评估不同品种的抗旱能力,以期为北方地区造林树种的选择提供重要的依据。结果表明,不同物种干旱处理后各项生理指标,如相对水含量、相对电导率、以及可溶性糖、叶绿素和脯氨酸含量等的变化规律均存在明显差异,采用单一生理指标比较物种间抗旱性有一定的偏差。主成分和隶属函数分析表明,13个灌木树种的抗旱性由高到低依次为:金焰绣线菊>紫叶小檗>沙地柏>红宝石海棠>珍珠梅>锦带>胡枝子>黄栌>水蜡>金银木>红瑞木>紫穗槐>连翘,分析结果与实际表现相吻合。
- 张皓丁亚娜赵启红陈永坤施杨刘海珍王玉玲徐吉臣
- 关键词：灌木抗旱生理指标
- 垂序商陆抗坏血酸过氧化物酶(APX1)基因克隆及表达分析被引量：2
- 2016年
- 从垂序商陆中克隆了抗坏血酸过氧化物酶基因PaAPX,CDS(coding sequence)全长为753 by,可编码250个氨基酸,预测蛋白分子质量为27.54 kD,等电点为5.39,二级结构主要由α螺旋和无规则卷曲组成。生物信息学分析显示,在氨基酸水平上PaAPX1蛋白与菠菜的同源性达到93.2%,系统进化树显示与菠菜、盐地碱蓬、甜菜等物种的亲缘性较近;实时荧光定量PCR结果显示,PaAPX1在块根、须根、茎、叶中均有表达,茎和叶中的表达量高于根连;镉胁迫处理后,PaAPX1在块根、须根中上调表达,茎和叶中下调表达,且根中的表达量高于茎和叶。
- 赵启红张皓刘海珍徐吉臣
- 关键词：抗坏血酸过氧化物酶基因克隆
