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陈玲玲
作品数:
1
被引量:4
H指数:1
供职机构:
华南师范大学生命科学学院
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发文基金:
国家自然科学基金
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相关领域:
农业科学
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合作作者
宁婵娟
华南师范大学生命科学学院
李韶山
华南师范大学生命科学学院
耿妍
华南师范大学生命科学学院
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作者
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耿妍
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李韶山
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陈玲玲
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宁婵娟
传媒
1篇
热带亚热带植...
年份
1篇
2016
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de novo转录组学分析华南地区入侵植物五爪金龙代谢特征(英文)
被引量:4
2016年
为探究华南地区严重入侵植物五爪金龙(Ipomoea cairica)生物入侵的分子机制,对五爪金龙及其近缘种七爪金龙(I.digitata)和裂叶牵牛(I.nil)进行de novo转录组测序和组装,得到56551条unigenes,其中56522条得到注释,7815条GO注释,15615条COG注释,180201条KEGG数据库注释。转录组分析结果表明,五爪金龙氮代谢通路关键酶基因的表达高于对照。次生代谢关键酶(PAL、4CL、CAD、查耳酮合酶、苯基丙乙烯酮异构酶、槲皮黄3-O-甲基转移酶等)基因在五爪金龙与七爪金龙及裂叶牵牛中均得到协同性的差异表达,而这些代谢通路指导的产物合成对五爪金龙的抗逆境能力、生长、化感作用等均起关键作用。关键基因的RT-q PCR验证结果与转录组结果具有一致性。因此,这从分子生物学层面上对解释五爪金龙在华南地区的入侵机制提供了新的证据。
耿妍
陈玲玲
鲁焕
宁婵娟
BJORN Lars Olof
李韶山
关键词:
DE
转录组
五爪金龙
生物入侵
代谢
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