孙清鹏
- 作品数:57 被引量:279H指数:9
- 供职机构:北京农学院植物科学技术学院更多>>
- 发文基金:北京市自然科学基金国家自然科学基金北京市属高等学校人才强教计划资助项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学轻工技术与工程化学工程更多>>
- 玉米ZmCKX基因的克隆及分析
- 2015年
- 细胞分裂素氧化酶降解细胞分裂素,从而调控植物的生长发育,克隆和分析玉米细胞分裂素氧化酶基因(Zm CKX),为研究Zm CKX在玉米抗逆反应中的作用奠定基础。运用RT-PCR和RACE技术克隆了Zm CKX基因的c DNA全长,并对其进行了初步的生物信息学分析。琼脂糖凝胶电泳鉴定结果表明,PCR扩增出一条约1035 bp的片段,与目的片段大小相似。将目的片段与p MD-19t构建的p MDZm CKX重组质粒并转化为DH5α,经检测片段与原始片段大小相同。Blastn分析结果表明,其与Zm CKX1的相似性为99%。对该基因序列分析表明,Zm CKX基因编码的蛋白的开放阅读框为1035 bp,起始位点为23 bp,终止位点为1057 bp。Zm CKX基因长1035 bp,编码344个氨基酸。它与Zm CKX1基因核苷酸同源性99%。Zm CKX基因编码的蛋白是存在于细胞质中的亲水蛋白。
- 刘建怡张彦彦宋玉峰潘金豹韩俊南张杰王维香史利玉王晔孙清鹏卢敏
- 关键词:玉米克隆原核表达载体
- 茄子品种基于WRKY转录因子的指纹图谱构建及遗传相似性分析被引量:2
- 2010年
- 应用WRKY转录因子分子标记构建34个茄子品种的指纹图谱及进行遗传相似性分析,筛选出5对多态性高的引物进行PCR扩增,结果显示,扩增多态性带663条,每对引物检测到多态性条带84~181条,平均为132条。对所得到的34个茄子品种的指纹图谱进行组合和综合分析,可以将供试的34个茄子品种区分开来。表明利用WRKY转录因子分子标记技术可以用以鉴定茄子种质资源。按照UPGMA法进行聚类,从分子水平上将供试品种大体分为5个类群,第一类群又可分为2个亚类群,WRKY转录因子分子标记分类与传统的以果形或果皮颜色单一形态学性状为基础的分类没有直接的相关性。
- 牛艳秀赵福宽孙清鹏杨爱珍
- 关键词:茄子转录因子指纹图谱
- 茉莉酸类物质的生物合成及其信号转导研究进展被引量:14
- 2008年
- 茉莉酸(JA)是脂类起源的并在植物界广泛存在的一种重要的信号分子,在植物防御生物和非生物胁迫反应及植物的生长和发育过程中起着重要作用.文中介绍了茉莉酸生物合成,钙离子在茉莉酸信号传导中的作用及其钙离子的来源,环核苷酸门控的离子通道可能参与JA诱导的质外体钙离子动员等,并对该领域今后的研究进行展望.
- 于涌鲲郝玉兰万善霞赵福宽杨瑞楠孙清鹏
- 关键词:茉莉酸信号传导CA^2+
- 番茄中WRKY2基因的克隆
- 2011年
- WRKY转录因子在植物应对生物或非生物胁迫的反应及生长和发育中起重要作用,为研究WRKY转录因子在番茄中的功能,本研究根据课题组已经克隆的番茄WRKY转录因子片段设计引物,采用RT-PCR方法,从JA诱导的番茄幼苗中,获得了608bp的cDNA片段。序列分析表明,该序列含有WRKYGQK保守结构域,与Capsicum annuum WRKY-c序列相似性是79%,与Nicotiana tabacum NtWRKY-7序列相似性是74%,表明已经成功克隆了番茄WRKY2基因片段。
- 李娜于涌鲲赵福宽汤世坤孙清鹏于同泉路苹
- 关键词:番茄WRKY转录因子克隆
- 低温胁迫下两种热带相思某些生理特性的变化
- 以热带和南亚热带主要速生丰产造林树种大叶相思(AcaciaauriculiformisA.Cunn.) 和马占相思(A.mangiumWilld)为试验材料,在相对湿度(RH)为75~85的条件下, 采用室内测定苗木抗寒...
- 孙清鹏
- 关键词:大叶相思马占相思低温胁迫抗寒性脱落酸
- 文献传递
- Ca<'2+>/CaM在拟南芥茉莉酸信号通路中的作用
- 为探究JA诱导的钙动员的来源、钙调素(CaM)的影响以及Ca<'2+>/CaM在JA信号通路中的作用,该文研究了不可过膜的质膜钙通道抑制剂(nifedipine、verpamil)、IP<,3>受体拮抗剂(heparin...
- 孙清鹏
- 关键词:拟南芥茉莉酸钙离子钙调素信号转导
- 文献传递
- 玉米E3泛素连接酶类基因ZmGW2-1的克隆及表达分析被引量:2
- 2014年
- 提高玉米产量是玉米育种的重要目标,而籽粒大小和粒重是禾谷类作物产量的重要构成因子。本研究根据水稻中已克隆的决定籽粒产量的主效基因Os GW2(RING型E3泛素连接酶)的序列信息,利用3’-RACE和RT-PCR技术从玉米基因组中分离出其直系同源基因,并对克隆的目的基因进行序列及组织表达特异性分析。结果表明,克隆得到的玉米同源基因编码区长为1287 bp,编码428个氨基酸残基。Blastx功能分析发现该基因编码E3泛素连接酶类蛋白,该基因的编码序列与Os GW2的编码序列相似度高达83%,将其暂时命名为ZmGW2-1,且ZmGW2-1在雌穗中高度表达,表明该基因可能参与玉米雌穗的发育调控。该基因的克隆为进一步分析其功能奠定了基础。
- 孔曼丽李彩云孙清鹏卢敏王维香潘金豹韩俊
- 关键词:玉米E3泛素连接酶克隆
- 番茄WRKY转录因子基因片段的克隆及序列分析被引量:10
- 2009年
- 以番茄苗为实验材料,克隆出番茄WRKY转录因子的一个基因片段并对其核酸序列进行分析。根据笔者课题组已经克隆出的番茄特异的WRKY基因片段和番茄EST序列设计特异引物,利用RT-PCR技术获得番茄WRKY转录因子的一个基因片段并连接到pMD19-T载体中,转化DH5α,筛选阳性克隆,用双酶切分析法对其进行鉴定并进一步对核酸序列进行测序分析。结果表明,克隆获得的WRKY转录因子基因片段约为680 bp,用GenBank中的Blastn程序分析表明,其与CaWRKY(AY789641.1)、WIZZ(wizz mRNA)(AB028022.1)的相似性分别为86%和84%。WRKY转录因子在番茄中同样受JA诱导,这为克隆番茄WRKY基因全长,进而为番茄抗病育种奠定基础。
- 王丽芳杜希华于涌鲲赵福宽孙清鹏
- 关键词:番茄转录因子WRKY
- 玉米NAC转录因子片段的克隆及分析被引量:1
- 2012年
- 以三叶期玉米幼苗为材料,根据NAC转录因子特有的保守结构设计特异引物,利用RT-PCR技术获得一个玉米NAC转录因子的基因片段,并对该片段进行了测序和生物信息学分析。测序分析结果表明,克隆得到的NAC转录因子基因片段为230 bp,聚类分析结果表明其属于NAC家族的NAM亚类。该片段的获得为克隆玉米NAC转录因子基因全长,进而为玉米抗逆育种奠定了基础。
- 王彦威潘金豹韩俊张秋芝南张杰孙清鹏
- 关键词:玉米NAC转录因子克隆
- 茄子反转录转座子基因片段的克隆及序列分析
- 2006年
- 根据己报道的反转录转座子的序列设计合成一对特异引物,以西安绿茄基因组DNA为模板,采用PCR扩增的方法扩出一条DNA特异片段并克隆到pMD18-T载体中.用PCR法和酶切分析法对克隆片段进行鉴定并进一步进行核苷酸序列分析.序列测定该片段长为518 bp.用GenBank中的BLAST程序分析表明,该片段与马铃薯(Solanum demissum)反转录转座子的gag-pol聚合蛋白90-243aa区域氨基酸同源性为43%.
- 赵海艳孙清鹏秦勇赵福宽
- 关键词:茄子反转录转座子克隆