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何小林

作品数:7 被引量:1H指数:1
供职机构:中国科学院生物物理研究所更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划中国科学院知识创新工程更多>>
相关领域:生物学医药卫生更多>>

文献类型

  • 3篇期刊文章
  • 2篇会议论文
  • 1篇学位论文
  • 1篇科技成果

领域

  • 4篇生物学
  • 3篇医药卫生

主题

  • 6篇神经毒素
  • 5篇神经毒
  • 5篇晶体
  • 5篇晶体结构
  • 3篇马氏钳蝎
  • 3篇BMK
  • 2篇毒素
  • 2篇晶体结构研究
  • 1篇蛋白
  • 1篇蛋白质
  • 1篇蝎神经毒素
  • 1篇钠通道
  • 1篇结构与功能研...
  • 1篇晶体结构测定
  • 1篇聚体
  • 1篇二聚体
  • 1篇分辨率
  • 1篇Α毒素
  • 1篇白质
  • 1篇M1

机构

  • 7篇中国科学院

作者

  • 7篇何小林
  • 5篇王大成
  • 3篇张英
  • 3篇李宏民
  • 2篇管荣津
  • 2篇刘新奇
  • 1篇孙艳梅
  • 1篇王淼
  • 1篇熊玉梅
  • 1篇曾宗浩
  • 1篇王春光

传媒

  • 1篇中国科学(C...
  • 1篇生物化学与生...
  • 1篇中国科学院研...
  • 1篇第九次全国生...
  • 1篇第八次全国生...

年份

  • 1篇2006
  • 1篇2004
  • 1篇2002
  • 1篇2001
  • 2篇2000
  • 1篇1998
7 条 记 录,以下是 1-7
排序方式:
马氏钳蝎神经毒素BmK M4晶体结构及其与相关结构的比较研究
何小林刘新奇
马氏钳蝎中性神经毒素BmK M4 0.20nm晶体结构测定
2000年
BmKM4是一种中性蝎神经毒素 ,在BmK系列中具有中等毒性 ,属GroupⅢα 型毒素 .纯化样品结晶为六方晶体 ,空间群为P6 1.运用X射线衍射分析技术 ,通过分子置换法在 0 .2 0nm分辨率水平测定了BmKM4晶体结构 ,并对模型结构进行了修正 .最后的晶体学R因子为 0 .1 42 ,自由R因子为 0 .1 73,模型的标准键长偏差为 0 .0 0 1 5nm ,标准键角偏差为 1 .75 3° .在一个不对称单位里加入了 6 4个水分子 .精化的结构显示第 1 0位残基含有 1个反常的非脯氨酸顺式肽键 .将精化后的结构与GroupⅡα 型蝎毒素BmKM8(酸性弱毒素 )的结构进行比较 ,并以此为基础讨论该cis肽键可能的结构意义 .
何小林刘新奇曾宗浩李宏民王淼张英王大成
关键词:神经毒素晶体结构马氏钳蝎
二聚体蝎钠通道毒素的1.4 分辨率晶体结构:反常非脯氨酸顺式肽键及其内在结构因素(英文)
2006年
报道了以二聚体存在的dimo-BmKM1的1.4!分辨率晶体结构.蛋白质中的肽键是局部双键,不可旋转,因此具有顺式(cis)和反式(trans)两种构型,它们不能通过旋转操作相互转换.非脯氨酸顺式肽键是指形成该肽键的氨基是由脯氨酸以外的氨基酸提供的(Xaa-nonPro),这类肽键的顺式构型的自由能远比反式高,因此极少出现在天然蛋白质结构中.事实上,在长时间中,多肽链的“反式肽键连接”被视为蛋白质结构的一条基本规则,把顺式肽键视为不可能.随着高分辨率精确蛋白质结构数量的增加,近年来有详细的统计分析揭示,非脯氨酸顺式肽键(Xaa-nPro)在蛋白质结构中出现的几率为0.03%~0.05%,而且大多存在于功能敏感的结构区域,可能具有重要意义.但由于所用的基本结构数据都来自晶体结构,对这种反常肽键是否由结晶环境影响而形成,存在疑问.此前曾在以单体形式存在的蝎神经毒素mono-BmKM1的高分辨率结构中发现其中肽键Pro9-His10是非脯氨酸顺式肽键,并详细分析了其结构-功能意义.以二聚体存在的dimo-BmKM1的1.4"分辨率晶体结构表明,它与mono-BmKM1有不同的空间群、不同的分子堆积方式,不同的晶体环境.结构模型被高度精化,Rcryst达到0.109.dimo-BmKM1结构显示,在不对称单位中的两个M1分子在同一位置(残基9-10之间)都清晰地存在顺式肽键.立体化学分析显示,这一肽键的几何参数和局部结构与mono-BmKM1中的(9-10)顺式肽键基本相同.这一结果表明,非脯氨酸顺式肽键9-10的存在与结晶环境无关,是BmKM1分子的固有结构特征.在此基础上,综合分析了与顺式、反式肽键相关的结构元素,发现与残基(8-19)序列模体-KPXNC-(X为任意氨基酸)所决定的特征回折结构可能是分子内在的主要结构因素,其中第8位残基是Lys或Asp对决定肽键是顺式还是反式有关键作用.近来的突变实验及其晶体结构测定已证实,Lys8/Asp8�
何小林管荣津张英王大成
关键词:晶体结构神经毒素
中国马氏钳蝎神经毒素BmK M1和M4的晶体结构研究被引量:1
2001年
Three bioactivity variant neurotoxins, BmK M1, M4 and M8, have been purified from venom of the Chinese scorpion Buthus martensii Karsch. They possess distinct toxic activity on mice in vivo with different electrostatic properties. The relative toxicities of BmK M1, M4 and M8 are 13.3:2.5:1, which interestingly correspond to their respective pI values, ranging from basic to acidic, of 9.01, 7.53 and 5.30. In addition, the BmK M1 and M4 belong to α like toxin, while the BmK M8 belongs to classical α toxin so that they may bind to Na + channel at different microsite. The crystal structures of BmK M1, M4 have been determined and refined at resolutions 0.17 nm (M1), 0.13 nm (M4), respectively. The structure investigations in association with the site mutagenesis experiments revealed three significant surface areas: Face A and B relevant to the toxic potency expression; Site RC involved in the receptor binding specificity. Interestingly the substitutions with negative charge potentid residues in the Face B will dramatically reduce the toxic activity of the molecule, which suggested a "Charge potential mediated mechanism" for toxicity expression. Based on the high resolution structure, the most interesting finding is a unusual non prolyl cis peptide bond (residue 9~10) appeared in the site relative to receptor binding of the α like toxin BmK M1 and M4, but not in the classical α toxin BmK M8. The observations provide a possible structural basis for the α like toxin receptor binding site selectivity and propose a " cis peptide bond mediated mechanism" for the toxin receptor binding specificity. This manifested a way to achieve high levels of molecular specificity through the strained backbone geometry.
何小林王大成
关键词:马氏钳蝎神经毒素晶体结构
东亚马氏钳蝎几个类α毒素的晶体结构研究
蝎钠通道毒素是专一性结合神经肌肉系统的钠离子通道的神经毒素.研究其三维结构有助于阐明通道作用机理和毒素-受体相互作用.最近在蝎毒素中新认定一类毒素与经典α毒素对钠通道有着不同的作用方式和结合位点,它们被称为类α毒素.为阐...
何小林
关键词:晶体结构
蛋白质中的反常结构:蝎神经毒素中的非脯氨酸顺式肽键及其功能意义
<正> 众所周知,蛋白质中的肽键具有局部双键性质,不能自由旋转,因此具有反式(trans)和顺式(cis)二种构型。由于在cis肽构型中原子间的排斥力较大,能量上处于不利状态,计算表明非脯氨酸顺式肽键比其反式的稳定性低1...
王大成何小林李宏民张英
文献传递
中国马氏钳蝎(Buthus martensii Karsch)长链神经毒素的结构与功能研究
王大成戚正武李宏民何小林熊玉梅王春光孙艳梅管荣津
该项研究首次发现酸性毒素并测定其晶体结构,突破了一般认为蝎毒素都是碱性分子的概念;测定首批Alpha-like毒素的高分辨率晶体结构,从中发现反常的非脯氨酸顺式肽键,以及通过肽键顺-反异构调节分子特征结构和功能活性的机理...
关键词:
共1页<1>
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