陈海梅
- 作品数：11 被引量：38H指数：3
- 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金山东省自然科学基金厦门市科技计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学轻工技术与工程环境科学与工程更多>>
- 药食两用藠头叶绿体基因组解析、比较基因组学及系统发育研究被引量：13
- 2019年
- 藠头(Allium chinense)为百合科葱属常用药食两用植物。为探究部分葱属植物系统发育关系不明确及该属物种鉴别通用DNA条形码匮乏的问题,本研究应用高通量测序技术对藠头叶绿体全基因组进行测序、组装、注释及系统进化研究。结果显示藠头叶绿体基因组为152 525 bp,呈典型的四分状结构,共编码116个基因,其中蛋白质编码基因81个,转运RNA (transfer RNA)基因31个和核糖体RNA (ribosome RNA)基因4个。对6个葱属植物叶绿体基因组比较分析发现了7个变异较大的区间,包括基因编码区ndhA和ycf1,以及非编码区rps16-trnQ、trnT-trnF、ndhF-rpl32、rpl32-trnL和rpl16-rps3。利用葱属和非葱属53个物种的58个共有蛋白序列构建了进化树,发现除百合属、重楼属外其余各属物种所在分枝的支持率都达到66%～100%,有效地解决该类植物的系统进化与分类问题。此外,利用EcoPrimer软件成功发现了7个可用于葱属物种鉴定的候选DNA条形码序列并设计了引物。本研究首次获得了藠头叶绿体基因组序列,明确葱属物种间的亲缘关系,发现了一系列葱属物种特异的DNA条形码序列,为深入研究葱属植物的系统进化、分类及物种鉴定提供科学依据。
- 杨俏俏姜梅王立强陈海梅刘昶黄林芳
- 关键词：藠头叶绿体基因组系统发育DNA条形码
- 毛脉翅果菊完整叶绿体基因组分析
- 李宇宁姜梅王立强陈海梅刘昶
- 鉴定五种山姜属植物的分子标记及其应用
- 本发明公开了鉴定五种山姜属植物的分子标记及其应用，属于植物分子鉴定技术领域。利用本发明分子标记及基于其设计的引物能够有效鉴定区分红豆蔻、海南山姜、黑果山姜、高良姜和益智，有利于山姜属物种分类、质体基因组进化研究以及山姜属...
- 刘昶王立强杨合宇陈海梅
- 文献传递
- 串叶松香草叶绿体基因组序列研究
- 郑彧玥姜梅王立强陈海梅刘昶
- 蒙古黄芪叶绿体基因组的种内和异质变异及基因缺失和倒位
- [背景和目的]:2015版《中国药典》中收载蒙古黄芪Astragalus membranaceus (Fisch.)Bge.var.mongholicus (Bge.) Hsiao.和膜荚黄芪A.membranaceus...
- 陈海梅雷万钧邵俊杰张慧杨丹刘昶
- 利用SSR、SRAP和ISSR分子标记构建首张丹参遗传连锁图谱被引量：19
- 2015年
- 以2个丹参（Salvia miltiorrhiza Bge.）品系杂交得到的94株F1代植株为作图群体,利用SSR（simple sequence repeat,简单重复序列）、SRAP（sequence-related amplified polymorphism,相关序列扩增多态性标记）和ISSR（inter-simple sequence repeat,内部简单重复序列）标记进行了首张丹参遗传连锁图谱的构建。该图谱包含8个连锁群,93个标记位点,覆盖长度400.1 cm,平均图距4.3 cm;各连锁群包括2～23个标记,遗传距离3.3～132cm。该图谱为丹参相关数量性状的基因定位、分离以及克隆奠定了重要基础。
- 宗成堃宋振巧陈海梅刘昶王建华郭林林刘甜潘玉玲
- 关键词：丹参遗传连锁图谱SSRSRAPISSR
- 药用植物豨莶草叶绿体基因组的完整序列与系统进化分析
- 柳靖婷姜梅王立强陈海梅刘昶
- 鉴定五种山姜属植物的分子标记及其应用
- 本发明公开了鉴定五种山姜属植物的分子标记及其应用，属于植物分子鉴定技术领域。利用本发明分子标记及基于其设计的引物能够有效鉴定区分红豆蔻、海南山姜、黑果山姜、高良姜和益智，有利于山姜属物种分类、质体基因组进化研究以及山姜属...
- 刘昶王立强杨合宇陈海梅
- 鬼针草完整叶绿体基因分析
- 于绮霞姜梅王立强陈海梅刘昶
- 益母草叶绿体基因组序列与系统进化位置分析被引量：7
- 2018年
- 目的:对益母草叶绿体基因组序列与系统进化位置进行分析,旨在为益母草种质资源的开发和利用提供科学依据。方法:采用二代测序技术对益母草全基因组DNA进行测序,并成功组装了其完整的叶绿体基因组。结果:益母草叶绿体基因组全长159 375 bp,由一个大的单拷贝区(LSC)87 204 bp,一个小的单拷贝区(SSC)17 515 bp和一对27 099 bp的反向重复序列(IRs)组成。基因组注释结果显示其共编码115个基因,包括99个蛋白编码基因、38个t RNA基因和8个r RNA基因。叶绿体基因组GC含量为38.41%。同时,本研究共检测到160个简单重复序列和49个串联重复序列。结论:系统发育分析表明,益母草属与水苏属的亲缘关系较近,本研究为益母草药材精准鉴定与遗传多样性研究奠定了基础。
- 张慧何帅兵孔繁德陈海梅唐泰山徐淑菲苗丽刘昶
- 关键词：益母草叶绿体基因组系统进化
