王大伟
- 作品数:21 被引量:75H指数:6
- 供职机构:中国农业科学院烟草研究所更多>>
- 发文基金:中国烟草总公司科技项目国家高技术研究发展计划中国烟草总公司科技重大专项更多>>
- 相关领域:农业科学生物学轻工技术与工程更多>>
- 一种用于定位和克隆植物中控制同一性状的双隐性基因的方法
- 本发明公开了一种用于定位和克隆植物中控制同一性状的双隐性基因的方法。本发明提供用于定位和克隆植物中控制同一性状的双隐性基因的方法可以从普通常规材料出发,快速构建目标性状分离的定位群体,且本发明提供的方法不需要使用非常规材...
- 吴新儒龚达平刘贯山王大伟陈梦
- 马铃薯基因组编码区域SSR位点的分布、特征和所编码蛋白功能分析
- 2015年
- 在不同物种中,微卫星(simple sequence repeats,SSR)序列的数目、类型及其分布情况有很大差异。本研究利用Perl语言开发用于探寻编码区SSR位点的程序,并用SSRHunter软件验证,来分析马铃薯基因组编码区中SSR位点的分布情况。结果显示:在马铃薯的56 218条编码区序列中,检索到2 920条共含有3 512个SSR位点的序列,其中2 519条序列只含有一个SSR位点(占86%);含三核苷酸、六核苷酸重复单元的SSR数目最多,分别为2 358和1 075个,两者占总数的98%,其他类型的重复单元出现次数较少;构成微卫星序列的不同重复单元有603个;六个核苷酸的重复单元重复次数一般最少为三个,三核苷酸GAA重复单元重复次数最高,为193次。在自然选择规律下,编码区中SSR序列长度趋向于密码子的整数倍。运用Pfam数据库对含有SSR的编码序列进行功能分类,其中最多的是RPW8抗性蛋白功能。可利用SSR序列的特异性,筛选马铃薯不同物种的相关编码序列。
- 孙亭亭王大伟陈乐王卫峰龚达平陈雅琼孙玉合
- 关键词:马铃薯SSR简单重复序列基因编码区
- 玫瑰香韵烟草突变体代谢轮廓分析被引量:5
- 2019年
- 【背景和目的】利用甲基磺酸乙酯(EMS)对中烟100(ZY100)进行化学诱变,获得一个具有特征香韵的香气突变体(玫瑰香),为明确玫瑰香烟草突变体与ZY100在代谢产物和代谢途径方面的差异。【方法】采用GC-MS对玫瑰香突变体和ZY100烟芽的挥发性次生代谢产物和内在代谢产物进行分析。结合主成分分析(PCA)和偏最小二乘法-判别分析法(PLS-DA)筛选差异代谢物,并对差异代谢通路进行富集。【结果】(1)共检出挥发性代谢产物27种,包括醇类、醛类、酮类和烯烃类,突变体中挥发性物质种类多于对照,主要成分为反式-β-罗勒烯。(2)共鉴定内在代谢产物60种,包括氨基酸类、糖和醇类、有机酸类和其他次生代谢产物,筛选到差异代谢物27种。(3)玫瑰香突变体中与氨基酸合成、糖酵解、三羧酸循环、有机酸代谢、生物碱和萜类合成等相关的19条代谢通路发生极显著变化。【结论】差异代谢物和代谢通路的改变赋予了玫瑰香突变体特殊的花香香韵。
- 徐晓玲林樱楠曹鹏云刘贯山王大伟曹建敏邱军
- 关键词:烟叶突变体
- 普通烟草ATⅢ氨基转移酶家族序列鉴定与表达分析
- 2019年
- 氨基转移酶是5'-磷酸吡哆醛依赖酶,在植物的生长发育和非生物胁迫的反应中起重要作用。ATⅢ氨基转移酶家族(classⅢ aminotransferase family)是转氨酶家族中一个非常重要的亚家族。本研究利用普通烟草(Nicotiana tabacum)基因组序列信息,鉴定出26个ATⅢ家族成员,对烟草ATⅢ家族进行理化性质分析表明,普通烟草ATⅢ家族成员之间的理化性质差异较大;系统进化和结构域分析显示,烟草ATⅢ家族成员可形成4个分支,同一分支内ATⅢ家族成员的保守结构域的种类和组织形式高度一致;将19个家族成员定位在12条染色体上;分析普通烟草转录组数据,结果显示大多数家族成员在不同组织中都有表达,主要集中在叶脉、打顶后茎和叶、离体叶片等组织。对NtATⅢ1和NtATⅢ2基因的qRT-PCR分析显示,这两个基因主要在植物地上组织中表达。本研究为普通烟草ATⅢ基因的功能研究提供依据。
- 王晓王大伟夏菲李晓旭吴华姜山孙玉合
- 关键词:普通烟草生物信息学分析
- 一种用于定位和克隆植物中控制同一性状的双隐性基因的方法
- 本发明公开了一种用于定位和克隆植物中控制同一性状的双隐性基因的方法。本发明提供用于定位和克隆植物中控制同一性状的双隐性基因的方法可以从普通常规材料出发,快速构建目标性状分离的定位群体,且本发明提供的方法不需要使用非常规材...
- 吴新儒龚达平刘贯山王大伟陈梦
- 番茄C2H2型锌指蛋白的鉴定及生物信息学分析被引量:12
- 2018年
- 植物C2H2型锌指蛋白转录因子广泛参与植物的生长发育及对逆境应答反应等生命过程。为了更好地理解番茄中C2H2型锌指蛋白转录因子的种类和数量,利用番茄基因组数据库,鉴定出92条番茄C2H2型锌指蛋白。蛋白质理化分析结果表明,不同亚家族成员的氨基酸长度差异较大,且多为碱性氨基酸;进化树分析结果表明,所有C2H2家族成员被分为5个亚家族,每个亚家族成员数量差异较大;结构域分析显示每个成员都含有C2H2结构域,同一亚家族间结构域的数量、种类、分布具有一致性;染色体定位结果显示,有91个成员定位在12条染色体上;组织表达分析结果表明,C2H2转录因子基因家族成员在各个组织中都有表达,表达量具有差异性。本研究将为番茄C2H2型锌指蛋白的生物学功能分析提供参考。
- 胡军华王大伟杨明磊王新朱海朱佩刘贯山
- 关键词:C2H2型锌指蛋白番茄生物信息学进化树结构域染色体定位
- 金属蛋白酶WS1B在调控植物叶绿体代谢中的应用
- 本发明公开了金属蛋白酶WS1B在调控植物叶绿体代谢中的应用。本发明WS1B蛋白质是如下a)或b)或c)或d)的蛋白质:a)氨基酸序列是序列6所示的蛋白质;b)在序列6所示的蛋白质的N端和/或C端连接标签得到的融合蛋白质;...
- 夏菲吴新儒王大伟代常波王绍美
- 文献传递
- 普通烟草DREB转录因子的序列鉴定与表达分析被引量:4
- 2017年
- DREB转录因子含有一个保守的AP2/ERF结构域,在植物抗逆过程中起关键作用。利用生物信息学分析手段,以拟南芥DREB家族成员序列为参照,在普通烟草(Nicotiana tabacum)基因组公共数据库中鉴定出了68个DREB转录因子。对烟草DREB转录因子家族进行了理化性质、系统进化、保守结构域和表达分析。结果表明,普通烟草基因组编码68个DREB转录因子家族成员,氨基酸数目差异较大;系统发育分析表明,拟南芥和烟草的DREB转录因子共125个成员形成6个进化分支,其中烟草比拟南芥缺少A6分支;结构域分析表明,同一分支内的DREB转录因子的保守结构域以及motif具有高度的一致性;组织表达分析表明,大多数DREB家族基因在烟草中表达量较低,在衰老、干旱和病害胁迫下基因表达量较多。此研究将为烟草DREB转录因子的深入分析奠定了生物信息学基础。
- 胡军华王大伟杨明磊王新吴新儒吴华刘贯山
- 关键词:DREB转录因子普通烟草生物信息学
- 特征香韵烤烟新品种(系)多指标综合评价
- 2023年
- 特征香韵烤烟新品种(系)‘中烟特香301’、‘特5’、‘特18’是通过EMS(甲基磺酸乙酯)诱变烤烟品种‘中烟100’所得,具有优异的烟叶品质。为明晰‘中烟特香301’、‘特5’、‘特18’在山东烟区的推广应用价值,本试验以山东烟区主栽品种‘中烟100’为对照品种在山东省日照市莒县与诸城市开展品种比较试验,从大田生育期、植物学性状、农艺性状、田间主要病害、经济性状、原烟外观质量及原烟内在质量7个方面分析各品种(系)的性状特点。结果表明,与‘中烟100’相比,两地各品种(系)表现出以下特点:株高略矮、茎围较粗、节距略短、最大叶长较长;大田抗病性较好;总糖与还原糖含量较高,烟碱含量稍低;产量、产值、上等烟比例较高;原烟外观质量较好。综上特征香韵烤烟新品种(系)在山东省日照市和潍坊市具有良好的推广应用价值。
- 李功博吴新儒李志远王大伟晁江涛曹鹏云刘贯山
- 关键词:烤烟综合评价
- 烤烟新品种中烟特香301特征香气物质研究被引量:9
- 2022年
- 为从分子水平认识烤烟新品种中烟特香301特征香韵的香气物质基础,采用顶空-箭型固相微萃取-气相色谱质谱联用法(HS-SPME Arrow-GC/MS)测定了中烟特香301和对照品种中烟100中挥发、半挥发性香气成分,结合主成分分析(PCA)和偏最小二乘-判别分析(PLS-DA)方法分析了中烟特香301的特征香气成分。结果表明:①两个品种中共检测到香气物质102种,其中质体色素降解产物20种、美拉德反应产物32种、苯丙氨酸和木质素转化产物12种、西柏烷类降解转化产物2种、脂类代谢转化产物2种、氨基酸降解产物5种、其他来源降解产物29种;②中烟特香301与中烟100含量差异显著的香气物质有46种,包括质体色素降解产物9种、美拉德反应产物15种、苯丙氨酸和木质素转化产物4种、脂类代谢转化产物2种、氨基酸降解产物2种、其他类14种,其中41种香气物质含量增加。中烟特香301的特征香韵可能与其香气物质的大幅增加密切相关,质体色素降解产物尤其是类胡萝卜素降解产物对中烟特香301花香香韵的形成发挥主要作用。
- 曹建敏别瑞王玉华王丽丽霍光高加明李金海王大伟孔芳芳赵福彬邱军
- 关键词:烤烟特征香气