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国产MALDI-TOF MS系统Smart MS 5020对临床微生物的鉴定性能评估被引量：1: 2022年; 目的评估珠海迪尔Smart MS 5020型基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)系统及其2630种数据库(以下简称Smart MS 5020系统)对临床微生物的鉴定能力。方法共纳入2016—2020年浙江大学医学院附属第二医院留存的临床分离菌株913株,覆盖18个属52个种或复合群。采用直接涂抹法进行鉴定,比对仪器为德国布鲁克Biotyper MS系统及其DB2969数据库(以下简称Biotyper MS),对于两台质谱仪不一致的鉴定结果,采用16S rRNA扩增测序作为判定的金标准。针对复合群(鲍曼不动杆菌复合群、阴沟肠杆菌复合群以及肺炎克雷伯菌复合群),采用二代测序的鉴定结果作为金标准,统计学方法采用卡方检验。选取13株室内质控菌株作为重复性评估的检测样本,每株菌在Smart MS 5020系统上平行检测3次,判断其鉴定结果的一致性。结果对913株临床菌株,Biotyper MS系统种水平鉴定准确率为100%(913/913,95%CI:99.48%~99.58%),Smart MS 5020系统种水平鉴定准确率为99.78%(911/913,95%CI:99.12%~99.20%),2株表皮葡萄球菌鉴定为柯氏葡萄球菌;在临床微生物的鉴定能力方面,2种方法差异无统计学意义(P>0.05)。重复性评估结果显示,Smart MS 5020系统对13株室内质控菌株的鉴定结果完全一致。结论Smart MS 5020系统对临床常见微生物有很好的鉴定能力,包括复合群的鉴定能准确鉴定到复合群,对一些难区分菌如嗜血杆菌、链球菌等均能准确鉴定,但对复合群内具体种的细分能力有限,需要结合分子生物学、血清学或其他补充实验来准确鉴定。; 金丽黄永禄李佳萍蒋陈晨周宏伟张嵘胡燕燕; 关键词：基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱细菌酵母菌

MALDI-TOF MS在中段尿样本细菌直接检测中的应用被引量：12: 2015年; 目的运用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)鉴定系统对中段尿样本中的细菌进行直接快速检测,以建立快速的细菌检测方法便于临床应用。方法 692例中段尿样本接种于固体培养基上,利用MALDI-TOF MS和Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统(简称Vitek 2 Compact)对单个菌落进行鉴定;同时对尿液样本进行前处理后直接进行质谱分析。结果 692例中段尿样本中,98例单一菌感染且细菌数>104CFU/m L的样本应用MALDI-TOF MS直接检测出74株菌,检出率达75.5%,其中大肠埃希菌39株,检出率达79.6%;粪肠球菌23株,检出率为100.0%;摩根摩根菌5株,检出率为100.0%。64例样本为2种菌混合感染,采用MALDI-TOF MS直接检测出44例样本中的1种优势细菌。质谱直接检测尿液的鉴定结果与单菌落质谱鉴定结果及Vitek 2 Compact鉴定结果完全一致,符合率为100.0%。结论 MALDI-TOF MS可用于直接检测尿液样本中的细菌,检出率高,结果可靠;MALDI-TOF MS对混合菌感染的样本有一定鉴定能力;该方法可比常规尿培养鉴定方法提早42 h报告鉴定结果,是对临床尿液样本细菌鉴定的一大革命性进步。; 王琳李佳萍陈功祥张嵘; 关键词：中段尿

VITEK MS基质辅助激光解析电离飞行时间质谱在病原菌鉴定中的应用评价被引量：12: 2016年; 目的使用VITEK MS质谱鉴定系统对临床分离的病原菌进行鉴定,并评价其性能,为病原菌的快速鉴定提供新的方法。方法收集2014年4-7月医院临床分离病原菌共948株,经VITEK-2Compact细菌鉴定仪及16SrRNA、rpoB、hisA、ITS基因片段测序确认,使用VITEK MS基质辅助激光解析电离飞行时间质谱进行鉴定,并对8株真菌连续检测测试质谱仪稳定性。结果共分离到链球菌属191株、肠球菌属94株、葡萄球菌属144株、肠杆菌科细菌193株、非发酵革兰阴性菌170株、临床常见其他菌36株、酵母菌属102株和丝状真菌18株。VITEK MS对入选菌株的鉴定总准确率达97.10%,但其对沙门菌属和鲍氏不动复合群的鉴定仅能到菌属或复合群水平;对酵母菌属的准确鉴定率为100.00%,丝状真菌中除链格孢外(数据库未包含此菌),88.89%的丝状真菌得到准确鉴定;VITEK MS质谱仪对真菌连续5d检测结果一致,稳定性良好。结论 VITKE MS表现稳定、准确率高、耗时短,尤其在真菌的鉴定上凸显优势,可作为临床细菌快速鉴定的手段。; 邱炳峰张晓飞顾丹霞李佳萍周宏伟; 关键词：细菌鉴定

Bruker MS快速鉴别vanA和vanM基因型耐万古霉素肠球菌的评价: 目的:采用Bruker MS快速鉴别和区分万古霉素耐药肠球菌(vancomycin-resistant enterococci,VRE)和万古霉素敏感肠球菌(vancomycin-sensitive enterococc...; 李佳萍张嵘; 关键词：VANA; 文献传递

采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱快速检测产KPC大肠埃希菌ST131和ST405分型的研究被引量：6: 2016年; 目的采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)快速检测产KPC大肠埃希菌ST131、ST405,并对该方法的可行性进行评价。方法收集浙江省人民医院临床分离46株大肠埃希菌,扩增blaKPC耐药基因,采用多位点序列分型方法(MLST)进行分型。MALDI-TOF MS对大肠埃希菌进行鉴定并对不同克隆的峰图进行主成分分析和算法统计,获得分型区分的特征峰。结果 46株KPC型大肠埃希菌均携带KPC-2耐药基因,MLST方法检测到2种ST型,分别为ST131和ST405。主成分分析图显示ST131和ST405可分为2簇,其中2株ST131和3株ST405分类错误。ClinProTools软件4种算法结果基本相似,方法特异度和灵敏度分别为93.27%和97.92%。用于区分ST131和ST405的特征峰主要为8 331.84、4 166.44、4 860.21和2 783.66 Da。这4个峰区分具有统计学意义,有较高准确性。结论采用MALDI-TOF MS可快速区分产KPC大肠埃希菌ST131和ST405,具有操作简单、耗时短、区分灵敏度和特异度高以及成本低等优点,能用于大肠埃希菌克隆分型研究。; 黄永禄李佳萍顾丹霞林晓伟吕火烊张嵘; 关键词：大肠埃希菌多位点序列分型

一种替加环素耐药基因家族tmexCD-toprJ多重PCR检测试剂盒: 本发明公开了一种新型替加环素耐药基因家族tmexCD‑toprJ多重PCR检测试剂盒，所述试剂盒由快速PCR混合液，裂解液，超纯水，引物探针混合液，阳性对照品，阴性对照品组成，引物探针混合液包括tmexC引物对、tmex...; 张嵘李佳萍吴雨辰董宁周宏伟胡燕燕王汉宇

Bruker MS快速鉴别vanA和vanM基因型耐万古霉素肠球菌的评价: 目的采用Bruker MS快速鉴别和区分万古霉素耐药肠球菌(vancomycin-resistant enterococci,VRE)和万古霉素敏感肠球菌(vancomycin-sensitive enterococci...; 李佳萍张嵘; 文献传递

2套质谱系统临床微生物鉴定性能评估: 2022年; 目的评估ASTA MicroIDSys基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)系统及配套CoreDB数据库(简称MicroIDSys系统)和Biotyper MS系统及配套DB2969数据库(简称Biotyper系统)对临床微生物的鉴定能力。方法收集2012—2020年浙江大学医学院附属第二医院临床微生物实验室留存的934株临床分离菌株和5株标准菌株,覆盖28个属、70个种或种复合体。采用直接涂抹法平行使用2套质谱系统对纳入菌株进行菌种鉴定。当某1套或2套系统鉴定失败,或2套系统鉴定结果不一致时,以聚合酶链反应(PCR)和基因测序方法作为参考方法,判定2套质谱系统鉴定结果的准确性。结果MicroIDSys系统与Biotyper系统对5株标准菌株均能准确鉴定。对于临床菌株,MicroIDSys系统鉴定准确率为96.1%(898/934),有11株鉴定失败,有25株鉴定错误(鉴定为属内其他菌种);Biotyper系统鉴定准确率为98.3%(918/934),有6株可鉴定至属水平,2株溶血色杆菌无鉴定结果,有8株鉴定错误。结论MicroIDSys系统和Biotyper系统对临床常见微生物均有很好的鉴定能力,但对一些少见菌种和容易混淆的细菌鉴定能力有限。; 刘聪聪李佳萍周宏伟; 关键词：基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱临床微生物菌种鉴定性能评价

产NDM-1型碳青霉烯酶摩根摩根菌的分离及分子背景研究被引量：2: 2015年; 目的对发现的产新德里金属β内酰胺酶1（NDM-1）型碳青霉烯酶摩根摩根菌进行分子背景研究。方法两株碳青霉烯类抗生素耐药摩根摩根菌1和2分别于2013年10月4日和10月29日分离自浙江省嘉兴市第二医院。琼脂稀释法测定抗生素敏感性；脉冲场凝胶电泳（PFGE）分析两菌株同源性；特异性PCR扩增和序列分析、接合试验和耐药基因周围序列分析进行菌株耐药机制分子水平研究。结果2株菌对喹诺酮类和碳青霉烯类抗生素耐药，对氨曲南敏感；PFGE结果显示2株菌非同源；特异性PCR扩增和序列分析发现2株菌同时携带耐药基因blaNDM-1、blaSHV-12、qnrS1和aac（6’）-Ib-cr；接合子中同时携带blaNDM-1和qnrS1；耐药基因blaNDM-1周围序列分析发现，2株菌blaNDM-1周围序列blaNDM-1-bleMBL-trpF—dsbC-cutA1与国内已知肺炎克雷伯菌blaNDM-1基因周围序列一致。结论摩根摩根菌中blaNDM-1可能通过可转移的质粒从肺炎克雷伯菌中获得。; 王选吴晓燕李佳萍宋国蓉邱炳峰顾丹霞张嵘; 关键词：Β内酰胺酶类抗药性

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李佳萍

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