朱丹
- 作品数：2 被引量：16H指数：1
- 供职机构：四川大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 基于454 GS FLX高通量测序的四川山鹧鸪基因组微卫星特征分析被引量：16
- 2015年
- 为了有效地保护四川山鹧鸪Arborophila rufipectus这一中国特有珍稀濒危鸟类,本研究采用454 GS FLX对该物种基因组测序,首次利用微卫星搜索软件搜索并初步统计和分析基因组微卫星序列,共搜索到l^6个碱基重复类型的完美型微卫星335 263个。不同类型微卫星中,单碱基重复类型数目最多,为197 913个,约占总数的59.03%,其次是四碱基、三碱基、六碱基、二碱基和五碱基,分别约占微卫星总数的13.59%、8.39%、7.55%、6.49%和4.95%。单碱基微卫星中A重复类型数量最多,两碱基中AC最多,三碱基中AAC,四碱基中AAAC最多,五碱基中AAACA最多,六碱基中AGGGTT最多。A、AGGGTT、AAAC、AC、AAAT、AAC、C、AG、AAAG、AAACA、AAT、AGG、AT、AGC、AAGG、CCG是在所搜索到的四川山鹧鸪微卫星中数量最多的16种重复拷贝类型。本研究深化了对四川山鹧鸪基因组的认识和了解,并为以后开发和筛选大量高质量微卫星标记提供数据支持,也为利用微卫星标记研究更加有效地保护和管理四川山鹧鸪这一珍稀濒危动物奠定了基础。
- 黄杰周瑜刘与之朱丹宋旭颢陈本平张修月岳碧松
- 关键词：四川山鹧鸪基因组序列微卫星
- 基于454 GS FLX高通量测序的四川山鹧鸪基因组微卫星特征分析
- 四川山鹧鸪(Arborophila rufipectus),隶属鸡形目(Galliformes)雉科(Phasianidae)山鹧鸪属(Arborophila),是中国特有珍稀鸟类,国际自然保护联盟(IUCN)将其列为濒...
- 周瑜朱丹黄杰张修月岳碧松
- 关键词：四川山鹧鸪高通量测序微卫星
- 文献传递
