张跃博 作品数:22 被引量:57 H指数:5 供职机构: 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 更多>> 发文基金: 国家生猪现代产业技术体系建设项目 国家科技支撑计划 国家现代农业产业技术体系建设项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
大白猪哺乳期背膘损失对繁殖性能的影响 被引量:6 2018年 为了研究大白母猪哺乳期背膘损失对其繁殖性能的影响,试验选取大白母猪1 178头,统计6个胎次的总产仔数、产活仔数、健仔数、断奶窝重、断奶发情间隔、哺乳期背膘损失等性状,根据哺乳期的背膘损失情况将母猪分为6组:<0、0~1、1~2、3~4、5~6、>6mm,以断奶窝重为协变量,利用最小二乘检验开展组间总产仔数、产活仔数、健仔数、断奶发情间隔等性状的差异显著性分析。结果显示,大白母猪6个胎次平均总产仔数、产活仔数、健仔数、断奶窝重、断奶发情间隔和哺乳期背膘损失分别为13.67头、11.51头、10.32头、65.90kg、4.83d和2.89mm,大白母猪1~6胎产仔数在各组间存在显著差异(P<0.05)。综合全部6个胎次的结果可知,第4、5、6组间差异不显著(P>0.05),但均显著高于第1、2、3组(P<0.05);第4组总产仔数最高,达13.54头,比第1、2、3组分别高出1.90、2.29和1.63头(P<0.05)。虽然各胎次中各组间产活仔数和健仔数性状有时也出现显著差异,但综合分析6个胎次组间并未出现显著差异(P>0.05)。从断奶发情间隔性状来看,各组间均未出现显著差异(P>0.05)。结果表明,在大白猪生产中,将哺乳期母猪的背膘损失控制在3~4mm可以获得更高的总产仔数。 周伟伟 郭红洲 王立刚 张跃博 岳静伟 刘秋凤 王立贤 姚军 张有权 张龙超关键词:大白猪 产仔性能 拷贝数变异全基因组关联鉴定猪骨率性状候选基因 被引量:2 2019年 旨在挖掘影响猪骨率性状的全基因组范围内的拷贝数变异(copy number variations, CNVs),并对其所覆盖的基因的作用模式及机理进行研究。本研究利用基于测序深度的CNVcaller软件对大白×民猪F2群体的拷贝数变异进行检测,利用TASSEL软件中的混合线性模型(mixed-linear model, MLM)对骨率性状进行基因组关联分析;查找数据库对CNVs所覆盖基因进行深入分析,利用RNA重测序对75日龄大白猪腿软骨中4个显著CNVs的表达进行检测。结果表明,在F2代群体中,共检测到3 027个CNVs,其中,共有1 251个为缺失,987个为多拷贝,789个为缺失和多拷贝均存在。与骨率在基因组水平相关的CNVs共有4个,均位于7号染色体。4个变异中,有两个未与任何基因重叠。显著性最高的CNV4与骨髓分化相关标记(MYADM)基因重合。对75日龄猪腿软骨基因的表达研究发现,在后腿软骨中仅CNV2的表达丰度较高,推测CNV2通过影响其内部基因的表达量影响骨率,CNV4可能在胚胎发育期起调控作用。综上所述,本研究成功鉴定出影响猪骨率性状的4个CNVs,其中,CNV2和CNV4为影响骨率性状的主效CNVs,推测CNV2通过影响其内部基因的表达量影响骨率,CNV4可能在胚胎发育期起调控作用并最终影响骨率。本试验为今后骨率性状的调控机理研究奠定了理论基础,为猪骨率性状的育种提供了参考。 王立刚 张跃博 颜华 张龙超 侯欣华 刘欣 王立贤关键词:拷贝数变异 猪耳型性状全基因组关联分析及重要候选基因MSRB3的克隆分析 耳型是猪的重要品种特征之一,在品种鉴定中发挥重要作用。但是,目前对耳型基因定位研究较少,还未揭示其主效基因及因果突变位点。本研究利用Illumina的猪SNP60芯片,在大白猪×民猪F2资源群体中对耳型性状进行全基因组关... 张跃博关键词:全基因组关联分析 基因克隆 文献传递 TGFβ3基因多态位点及其与猪脊椎数性状的关联分析 被引量:4 2018年 本研究旨在探索转化生长因子β3(transforming growth factor beta 3,TGFβ3)基因在大白猪×民猪构建的F2代资源群体内的多态性,并分析其多态性与猪脊椎数性状的关系。试验采用PCR技术,以F0代个体的DNA为模板,筛选TGFβ3基因外显子区的SNP,并将筛选到的SNP在F2代群体中进行验证,进而分析SNP与猪脊椎数性状的关联性。结果发现,TGFβ3基因在F0代个体中仅筛选到1个SNP位点,即SSC7:105179474G>A,表现为两种基因型GG和GA。TGFβ3基因不同基因型与F2代个体脊椎数性状的关联分析表明,SSC7:105179474G>A与猪肋骨数、胸腰椎数之和呈极显著相关(P<0.01),与猪腰椎数无显著相关(P>0.05)。χ2适合性检验发现,该位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。综上所述,TGFβ3基因可能是影响猪脊椎数性状的主效基因或与主效基因连锁,SSC7:105179474G>A位点有望作为提高猪脊椎数性状的分子遗传标记。 岳静伟 郭红洲 周伟伟 刘欣 王立刚 高红梅 侯欣华 张跃博 颜华 魏霞 张龙超 王立贤关键词:单核苷酸多态性 猪ADAR1基因cDNA全长克隆、序列信息及组织表达分析 被引量:4 2019年 旨在克隆猪作用于RNA的腺苷脱氨酶1基因(ADAR1)cDNA全长序列,检测该基因在大白猪不同组织及不同日龄背膘中的表达情况。本研究利用RACE(rapid-amplification of cDNA ends)克隆大白猪ADAR1基因mRNA全长序列,并对其进行生物信息学分析;采用荧光定量PCR方法检测ADAR1在不同组织中的表达水平,并探究不同日龄背膘中ADAR1的表达规律。结果表明,猪ADAR1基因cDNA全长6259bp,编码1145个氨基酸,与人、黑猩猩、猕猴、长臂猿、黄牛、山羊和绵羊的氨基酸序列一致性均不低于85%。该基因编码的蛋白具有2个Zα结合结构域,3个双链RNA结合结构域和1个脱氨酶结构域。ADAR1在心、肝、脾、肺、肾、脑、肌肉、小肠和背部脂肪组织以及7、60、120和180日龄个体背膘组织中均表达,其表达量总体上表现出随个体发育先下降后上升的趋势。综上所述,本研究成功克隆了猪ADAR1基因cDNA全长序列,发现其在猪体内广泛表达,并且在不同日龄猪背膘组织中表达水平存在差异,为今后深入研究ADAR1的功能奠定了理论基础。 张跃博 欧阳峰正 王立刚 侯欣华 刘欣 颜华 张龙超 王立贤关键词:ADAR1 基因克隆 RACE 猪体尺性状全基因组关联分析 本研究采用GRAMMAR-GC(Genome-wide Rapid Association using the Mixed Modeland Regression-Genomic Control)方法,使用DMU软件和R... 王立刚 张龙超 颜华 刘欣 梁晶 张跃博 施辉毕 蒲蕾 张恬 赵克斌 王立贤关键词:体尺性状 文献传递 一种培育高饲料利用效率猪的方法 本发明公开了一种培育高饲料利用效率猪的方法。本发明提供的方法,是检测待测猪的国际猪基因组11.1版本参考序列13号染色体上第200546552位脱氧核糖核苷酸是A还是G,确定待测猪的基因型是AA还是GG,GG基因型的猪的... 张龙超 王立贤 王立刚 张跃博猪全基因组RNA编辑位点组织鉴定及其在背膘厚高低组中的差异分析 RNA编辑是一种重要的转录后调控机制,可改变氨基酸序列、影响可变剪接、导致内含子滞留、影响RNA稳定性等,为解释诸多复杂生命过程提供了一种方向。与人和鼠相比,对猪中RNA编辑的认识仍十分有限。本研究基于高通量测序技术对猪... 张跃博关键词:高通量测序 背膘厚 杜洛克猪饲料利用效率测定阶段及RFI校正公式研究 被引量:4 2019年 为了解决中国猪育种过程中饲料利用效率测定期长、无校正公式等问题,本研究对应用4种不同方法计算的杜洛克猪全期和不同生长阶段的剩余采食量(RFI)进行了Pearson相关性分析,以得到可代表全期RFI的测定阶段,进而缩短测定时间。应用不同体重RFI线性插值与达100 kg真实体重RFI对杜洛克猪达100 kg体重RFI校正公式参数进行拟合求解,以得到杜洛克猪达100 kg体重RFI校正系数。结果显示,4种方法计算的RFI均为105~180 d生长阶段和全期相关性最高,相关系数均在0.92以上,适配回归方程为:全期RFI=0.9786×(105~108 d测定阶段RFI)+0.0002,最高拟合度为0.9734。杜洛克公猪及母猪达100 kg体重RFI校正系数分别为0.0519和0.0179。在此系数下,公猪70~100 kg范围内校正准确性较高,母猪40~100 kg范围内校正均比较准确。本试验结果可直接用于制定育种方案,既可缩短RFI测定的时间,又可为更准确地计算RFI提供参考,为制定优良的育种方案提供有效数据。 张金山 王立刚 张跃博 张龙超 王立贤关键词:杜洛克猪 饲料利用效率 猪脊椎数性状全基因组关联研究及候选基因分析 引言中国地方猪种的胸-腰椎(脊椎)数一般有19 张龙超 王立刚 刘欣 岳静伟 颜华 赵克斌 梁晶 蒲蕾 张跃博 王立贤文献传递