赵莲
- 作品数：17 被引量：39H指数：4
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- 相关领域：农业科学生物学环境科学与工程更多>>
- 一种三疣梭子蟹微卫星种质鉴别技术
- 本发明是一种三疣梭子蟹微卫星种质鉴别技术，其特征是首先提取三疣梭子蟹基因组DNA，然后建立三疣梭子蟹富含微卫星的基因组文库，再对文库进行测序获得富含微卫星的序列；挑选出基因组文库中的一个编号为SZX-18的序列，并在其序...
- 高焕赵莲阎斌伦徐静陈建华赖晓芳
- 文献传递
- 脊尾白虾应答温度变化的5种因子活性分析被引量：4
- 2014年
- 测定了温度变化情况下,脊尾白虾血清中酸性磷酸酶(ACP)、碱性磷酸酶(AKP)、过氧化氢(H2O2)、过氧化物酶(POD)和总抗氧化能力(T-AOC)5种氧化还原相关因子的活性或浓度。结果表明,ACP在温度下降和升高阶段,其活性先升高后降低,这与AKP活性的变化规律相反,说明二者在应答温度变化中的作用不同甚至相反;H2O2浓度和POD活性的变化规律一致,说明二者可能存在着对应关系,即H2O2浓度的增加会危害机体,而POD活性的提高则增强机体抵抗此类危害的能力;T-AOC值在温度降低和升高的初始阶段都有所提高,说明无论是升温或降温,都会对机体产生氧化反应上的危害,因此需要提高T-AOC值以应答温度胁迫。
- 高焕薛蓓赵莲于飞赖晓芳阎斌伦董丽君孟梦
- 关键词：脊尾白虾温度活性分析
- 三疣梭子蟹线粒体基因组单核苷酸多态性被引量：2
- 2018年
- 为获得三疣梭子蟹线粒体全基因组(mt DNA)SNP突变位点,本研究针对其mt DNA全序列设计了179对引物,采用高分辨率熔解曲线(HRM)检测技术对SNP进行了筛查。在179对引物中,有89对引物具有特异性扩增结果;进一步研究表明,89对引物中共有22对引物的扩增区域含有SNP突变位点,共包含24个SNPs。统计结果显示,三疣梭子蟹线粒体基因组中的SNP分布频率为0.15/100 bp,其中转换突变比例为79.1%、颠换突变比例为16.6%;C/T(G/A)突变比率为79.1%、G/T(C/A)突变比率为8.3%、A/T突变与G/C突变的比率均各占4.16%。本研究中所获得的SNP位点分布于三疣梭子蟹线粒体基因组的11个区域,且分布不均。其中COX1基因区域的SNP数目最多,其次在D-LOOP、ND1基因区域分别为3和4个SNP位点;而t RNA、12S r RNA等其他区域尚未发现突变位点。本研究所建立的三疣梭子蟹线粒体全基因组SNP的快速筛查方法及发现的SNPs,为进一步开展三疣梭子蟹种质遗传资源多样性、增殖放流标记等方面的研究提供了分析工具。
- 赵莲李志辉李志辉薛蓓张培高焕薛蓓
- 关键词：三疣梭子蟹线粒体基因组SNP高分辨率熔解曲线
- 一种网箱套养三疣梭子蟹装置
- 一种网箱套养三疣梭子蟹装置，包括等边梯形轮胎截断、通水网片、顶盖、投饵门、绳套，所述等边梯形轮胎截断设为具有左、右和上面开口的装置，所述通水网片固定在等边梯形轮胎截断的左侧和右侧，所述顶盖覆盖在等边梯形轮胎截断的上面，所...
- 阎斌伦赵莲李志辉张培薛蓓赖晓芳高焕
- 文献传递
- 脊尾白虾基因组应答饥饿的甲基化特征初步分析
- 线粒体是细胞的"动力工厂"，但虾类在线粒体基因组水平如何参与能量代谢活动的情况不明。本研究在筛选适宜脊尾白虾线粒体基因组甲基化位点分析的BSP引物基础上，对不同饥饿期该虾线粒体基因组的甲基化特征进行了...
- 高焕薛蓓赵莲朱国华赖晓芳陈建华阎斌伦
- 关键词：脊尾白虾线粒体基因组甲基化饥饿
- 脊尾白虾不同发育期线粒体基因组甲基化特征分析被引量：2
- 2017年
- 为研究不同发育阶段脊尾白虾线粒体基因组表观遗传学特征,本研究在筛选硫化测序引物的基础上,对不同发育期的脊尾白虾线粒体基因组甲基化特征进行了分析。经引物筛选验证,选取了4对引物在脊尾白虾的受精卵、幼体期、仔虾期和成虾期共4个发育期进行甲基化特征的分析,结果表明,除ND5基因3′端序列(21#引物扩增区)无甲基化现象外,COX3基因的起始区序列(13#引物扩增区)、COX3基因的3′端序列(16#引物扩增区)和ND5基因5′端序列(19#引物扩增区)均存在不同程度的甲基化现象。其中,COX3基因的起始区序列仅在受精卵孵化期和幼体期存在甲基化现象,COX3基因3′端序列在除受精卵外的其他3个时期均存在甲基化现象,且以上甲基化率随个体发育阶段的提高呈下降趋势;ND5基因5′端序列在4个不同发育期均存在甲基化现象,但甲基化率无显著差异。甲基化主要发生在COX3基因和ND5基因位点上,推测脊尾白虾在生长发育过程中通过调节线粒体基因组甲基化来调节机体能量代谢过程。本研究首次从整个发育周期角度探讨了线粒体基因组甲基化特征,以期为进一步揭示甲壳类生长发育相关遗传机制提供帮助。
- 薛蓓张培张培赵莲李志辉阎斌伦赵莲
- 关键词：脊尾白虾线粒体基因组不同发育期甲基化
- 一种脊尾白虾线粒体基因组拷贝数的定量检测方法
- 本发明公开了一种脊尾白虾线粒体基因组拷贝数的定量检测方法，包括如下步骤：分别选择腺苷酸转移酶基因(ANT)和ATP6基因作为脊尾白虾细胞核基因组和线粒体基因组的单拷贝基因，设计适于ANT和ATP6基因实时定量PCR反应的...
- 高焕张培赖晓芳李志辉薛蓓赵莲阎斌伦
- 文献传递
- 三疣梭子蟹mtDNA SNP图谱构建及其在增殖放流中的应用
- 利用高分辨熔解曲线(HRM)技术对三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)线粒体基因组(mt DNA)的单核苷酸多态性(SNP)位点进行了筛选,首次构建了三疣梭子蟹mt DNA的SNP图谱,在基础上...
- 赵莲李志辉张培薛蓓赖晓芳高焕阎斌伦
- 关键词：SNPMTDNA三疣梭子蟹种质资源
- SNP分子标记技术在经济甲壳动物中的应用进展被引量：4
- 2017年
- 作为第三代分子标记,单核苷酸多态性标记(SNP)具有丰富度高、密度大、稳定性强、共显性等特点,成为目前虾、蟹等经济甲壳动物中应用最广泛的分子标记技术。本文对经济甲壳动物中SNP技术的发展及其在高密度遗传连锁图谱的构建、种质资源遗传多样性分析、分子辅助育种等方面的应用进展进行了综述,并提出了未来有待加强的研究方向,以期为经济甲壳动物种质资源的开发和利用提供理论指导。
- 赵莲薛蓓高焕阎斌伦
- 关键词：SNP种质资源
- 脊尾白虾GAPDH基因的克隆及其内参基因稳定性分析被引量：8
- 2017年
- 为比较甘油醛-3-磷酸脱氢酶(glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)、18S rRNA和β-actin基因在脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)作内参基因的优劣,本研究采用同源克隆和RACE技术,克隆了脊尾白虾GAPDH基因全长cDNA序列(GenBank登录号:KX893516),通过实时荧光定量PCR(quantative real-time PCR,qPT-PCR)技术,检测3种基因在脊尾白虾不同组织及不同蜕壳后时间点的表达量变化,在此基础上进行内参稳定性分析。结果显示,脊尾白虾GAPDH基因全长1514 bp,开放读码框1002 bp,编码333个氨基酸,二级结构预测显示GAPDH蛋白具有一个高度保守的NAD^+结合功能域(NAD binding domain)和行使糖运输和代谢的催化功能域。分析qRT-PCR结果并结合ge Norm、Norm Finder和Best Keeper 3种软件的分析发现,在不同组织和不同蜕壳后时间点,3种内参基因的稳定性由高到低依次为18S r RNA、GAPDH、β-actin。因此,在脊尾白虾不同组织和不同蜕壳后时间点的定量分析中,选取单内参基因时,推荐使用18S rRNA为内参基因,双内参时推荐18S rRNA和GAPDH,而18S rRNA、β-actin和GAPDH在其他生理条件下作内参基因的稳定性还有待进一步研究。
- 薛蓓张培李志辉赵莲赖晓芳高焕李健阎斌伦
- 关键词：脊尾白虾GAPDH内参基因
