郭晓敏
- 作品数:17 被引量:26H指数:3
- 供职机构:扬州大学动物科学与技术学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家科技支撑计划江苏省“六大人才高峰”高层次人才项目更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 鸡NLRC5启动子区转录调控序列的初步研究
- 2017年
- 为了探讨NLRC5启动子的潜在调控机制,将NLRC5基因启动子系列缺失片段插入到pGL3-basic载体,构建重组质粒,并转染DF1细胞系。通过双荧光素酶实验寻找核心调控区,然后用目标捕获测序检测27个鸡品种的NLRC5核心启动子区的SNPs,并利用TRANSFAC,JASPAR和Meth Primer预测该区域的转录因子结合位点和CpG岛。结果显示,NLRC5启动子有2个核心区域,分别是1—617和1448—2108。第一个核心区域内存在3个SNPs,其中SNP1影响转录因子Hic1的结合序列,但SNPs对CpG岛不产生影响,表明NLRC5基因的启动子区的调控可能受不同因素的影响,但SNPs并不在甲基化的水平上影响启动子的活性。
- 张莘郭晓敏常国斌朱鹏飞徐璐仇玲玲张扬徐琪陈国宏
- 关键词:SNPS转录因子结合位点CPG岛
- 雪山鸡A-FABP基因编码区SNPs与肌内脂肪酸含量关联分析被引量:2
- 2014年
- 本研究利用MALDI-TOF-MS技术对67只雪山鸡A-FABP基因编码区候选单核苷酸多态性(SNPs)位点进行扫描,进一步验证SNPs是否存在,并且与脂肪性状进行关联分析。结果表明:A-FABP基因在外显子1中存在同义突变:即T/C突变,得到3种基因型,T、C等位基因频率分别为0.239和0.761,并处于遗传平衡状态;TT型个体的腿肌中C16∶0脂肪酸含量显著高于CT和CC型个体(P<0.05)。初步认为A-FABP基因应是肌肉脂肪酸性状的候选标记。
- 郭晓敏王伟马腾李志腾万方张康宁袁青妍许盛海常国斌陈国宏
- 关键词:A-FABP基因SNPS
- 鸡NLRC5基因启动子多态性分析被引量:2
- 2015年
- 为了研究NLRC5基因启动子区的SNP及其对启动子功能元件的影响,采用目标捕获测序和PCR产物直接测序的方法对27个鸡品种和2种细胞的NLRC5基因启动子区进行SNP检测,总共检测到37个SNP位点,其中斗鸡未发现SNP存在,SNP9存在于除斗鸡以外的其他鸡种和细胞。生物信息学软件预测得到NLRC5基因启动子区转录因子结合位点和CpG岛,SNP位点对转录因子结合位点和CpG岛大小均有影响,表明NLRC5启动子区SNP可能通过不同方式影响基因表达调控。
- 郭晓敏刘向萍常国斌徐璐马腾王洪志李志腾陈静万方徐琪陈国宏
- 关键词:启动子SNP
- 澳系荷斯坦牛β-乳球蛋白多态性对泌乳性能的影响被引量:2
- 2015年
- 利用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)对海丰奶牛场935头澳系荷斯坦牛β-乳球蛋白多态性进行分型,并利用最小二乘法分析其多态性对泌乳性能的影响。结果表明:β-Lg有A、B两种等位基因,基因频率分别为0.477和0.523,优势基因型为AB型,频率为0.516。方差分析表明:β-Lg对乳脂率、总固体含量和305d脂肪产量有影响显著(P<0.05),对日产奶量、脂蛋白比、乳糖含量、305d产奶量和305d蛋白产量有极显著影响(P<0.01)。该结果为利用乳蛋白基因多态性提高荷斯坦牛泌乳性能提供了参考资料。
- 邢世宇朱小瑞王文强郭晓敏袁媛刘坤毛永江
- 关键词:Β-乳球蛋白泌乳性能
- 雪山鸡THRSPα基因5′-侧翼区SNPs与肌肉品质关联性被引量:3
- 2015年
- 通过MALDI-TOF-MS技术对雪山鸡甲状腺激素应答蛋白Spot 14(THRSP)α基因5′-侧翼区候选SNPs位点进行扫描,对SNPs的存在与否进行进一步验证,并对其与肌肉品质进行关联分析。结果表明:雪山鸡THRSPα基因5′-侧翼区中存在G637A突变,得到3种基因型,G、A等位基因频率分别为0.567和0.433,适合性检验处于遗传平衡状态;不同基因型个体间在pH值、肉色和嫩度等常规肉品质指标并无显著差异;但GA型个体胸肌肌内脂肪含量显著高于GG和AA型的个体(P<0.05)。GA个体腿肌的C16∶0含量、C18∶1n9c含量、C18∶2n6c含量均显著高于GG和AA型的个体(P<0.05),GG和AA型个体之间差异不显著。初步可以认为THRSPα基因应是肌肉脂肪性状含量的候选标记。
- 万方郭晓敏马腾王洪志陈静徐璐李志腾程立力张康宁袁青妍许盛海常国斌陈国宏
- 关键词:THRSPΑ基因SNPS
- REV感染对鸡NLRC5及其信号通路相关基因转录的影响被引量:1
- 2016年
- 为探讨鸡NLRC5信号通路相关基因在禽网状内皮组织增生病病毒(REV)刺激后转录水平的变化,通过REV刺激鸡胚成纤维细胞(CEF),在刺激后7天采集细胞,提取总RNA,并设计相关引物,应用荧光定量PCR方法检测NLRC5信号通路相关基因(NLRC5、MHC-I、IL-6、IL-18、STAT1、STAT3、NF-κB)m RNA表达变化规律。结果表明:REV感染后MHC-I、IL-18、STAT1和STAT3的转录水平高于未刺激组,差异显著(P<0.05),NLRC5、IL-6和NF-κB转录水平低于未刺激组,差异不显著(P>0.05),研究初步证实REV刺激能够引起CEF产生免疫应答反应,且对NLRC5基因及其信号通路产生影响,REV可能通过抑制NLRC5基因表达来抑制机体先天性免疫。
- 刘向萍仇玲玲郭晓敏王克华陈国宏
- 关键词:REV信号通路
- 不同鸡品种NFKB1基因SNPs筛选与进化分析被引量:2
- 2016年
- 以27个鸡品种为试验材料,通过目标捕获测序技术检测NFKB1基因SNPs位点多态性,分析鸡NFKB1基因的遗传效应;通过最大简约法进行系统进化树构建,探讨NFKB1基因的多态性与不同鸡品种的关系。结果表明:27个鸡品种的NFKB1基因上共存在233个突变位点,其中外显子存在6个突变位点,显示出丰富的基因多态性;外显子14上的SNPs位点特异性存在于隐性白羽鸡和AA鸡,并引起了相应的氨基酸变化,该位点可作为这一基因的特异性候选位点。同时,NFKB1基因在外来鸡品种与地方鸡品种、蛋用型与肉用型鸡品种间存在差异,为进一步研究不同鸡品种间的差异提供参考资料。
- 毕瑜林王洪志徐璐王莎莎李志腾郭晓敏万方刘向萍张亚妮张扬徐琪常国斌陈国宏
- 不同鸡种对白痢沙门菌的定植与免疫反应差异分析
- 本研究对狼山鸡和罗斯鸡肠道内的白痢沙门菌含量及相关免疫指标进行检测,探讨白痢沙门菌在鸡肠道内定植及其对鸡免疫性能的影响.选取狼山鸡、罗斯鸡各40只,分为攻毒组(30只),空白组(10只),攻毒组口服灌注0.5ml白痢沙门...
- 王洪志马腾徐璐陈静翟飞李志腾郭晓敏万方常国斌陈国宏
- 关键词:狼山鸡免疫性能
- 文献传递
- 雪山鸡GARS-GART-AIRS基因候选SNPs及其与IMP含量的关联分析被引量:4
- 2015年
- 以雪山鸡为试验材料,通过MALDI-TOF-MS技术检测雪山鸡GARS-GART-AIRS基因候选SNPs位点多态性,分析GARS-GART-AIRS基因的遗传效应,并对其与肌苷酸含量进行关联分析。结果表明:GARS-GART-AIRS基因SNP1、SNP2与胸肌肌苷酸含量呈显著相关,SNP1中CC型个体胸肌肌苷酸含量显著高于AC型和AA型个体,AC型与AA型个体差异不显著;SNP2中TT型个体胸肌肌苷酸含量极显著高于CT型和CC型个体,CT型与CC型个体差异不显著。腿肌肌苷酸含量与胸肌肌苷酸含量变化趋势一致,初步认为这些SNPs应是肌肉肌苷酸含量的主效QTL。
- 徐璐马腾夏明秀翟飞陈静王洪志刘璐李志腾郭晓敏万方常国斌
- 关键词:肌苷酸
- 不同品种鸡TAPBP基因序列分析被引量:1
- 2016年
- TAPBP是抗原呈递相关转运体(TAP)相关蛋白,在先天性和适应性免疫反应中均发挥着重要作用,与多种疾病的抗性或易感性相关。对25个不同品种鸡TAPBP基因序列进行目标捕获测序,利用MEGA软件对不同品种鸡序列进行比对分析,筛选不同品种鸡TAPBP基因上的SNPs及Indel位点,并根据基因序列进行系统进化树的构建。结果表明:TAPBP基因存在较多的SNPs和Indels位点,有着丰富的遗传多样性。不同地方鸡品种相对外来鸡品种呈现出高度多态性,可能与抗病性存在密切联系。青脚麻鸡、太湖鸡、如皋草鸡等抗性较好的鸡品种在系统进化树中拥有较高的亲缘系数。此外,固始鸡、如皋草鸡、安卡鸡等品种在第8外显子上存在特异性的插入缺失,且引起氨基酸变化,可作为鸡抗性研究的候选分子标记。
- 朱鹏飞毕榆林张扬郭晓敏李志腾万方徐璐仇玲玲鲁伟任立辰吴允常国斌徐琪陈国宏
- 关键词:SNP位点