唐小静
- 作品数：5 被引量：35H指数：3
- 供职机构：重庆医科大学公共卫生与管理学院更多>>
- 发文基金：重庆市卫生局科研项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 基于最大相关最小冗余朴素贝叶斯分类器的应用被引量：1
- 2015年
- 目的将基于最大相关最小冗余(maximum relevance minimum redundancy,MRMR)的朴素贝叶斯分类器(naive bayesian classifier,NBC)应用于基因表达数据并与经典NBC、随机森林(random forests,RF)进行比较。方法采用Matlab与R软件编程,应用结肠癌与肺癌基因表达数据集,分别采用上述三种方法进行比较研究,使用10-折交叉验证方法估计经典NBC与RF的分类准确率。结果应用MRMR-NBC分析结肠癌基因表达数据集显示,采用信息熵(mutual information quotient,M IQ)法,当特征m=11时分类准确率达93.55%;而采用信息差(mutual information difference,M ID)法时,当m=15时分类准确率达到95.16%。应用MRMR-NBC分析肺癌基因表达数据集显示,采用MIQ法,当m=14时分类准确率最高达98.63%,而采用MID法时当m=12时分类准确率达到97.26%。而采用经典NBC分析结肠癌与肺癌基因表达数据时,分类准确率分别为66.67%、80.00%;RF在分析结肠癌与肺癌基因表达数据时,分类准确率分别为81.89%、77.62%。结论 M RM R-NBC能在仅有极少属性参与分类时,得到较高的分类准确率,优于经典NBC与RF。
- 陈江鹏彭斌文雯曾庆唐小静胡珊文小焱阙萍
- 关键词：朴素贝叶斯分类器
- 重庆市2008-2012年手足口病空间聚集性及影响因素研究被引量：13
- 2014年
- 目的了解重庆市2008-2012年手足口病空间聚集性及其发病的影响因素。方法利用软件OpenGeoDa,对重庆市2008-2012年38个区(县)手足口病发病资料进行空间自相关和空间回归分析。结果 2008年重庆市手足口病发病率全局Moran’s I=0.133 2,P>0.05,不具有全局空间自相关性;2009-2012年重庆市手足口病发病率全局Moran’s I依次为0.458 7,0.567 5,0.398 6,0.606 0,均有P<0.01,表明从全局上看,重庆市2009-2012年手足口病发病有正向空间自相关性,呈现出空间聚集性分布状态。空间回归分析结果提示:手足口病发病与城镇化率呈正相关(β=1.667 6,P=0.001 6)、与每千人口中的卫生技术人员呈负相关(β=-0.000 2,P=0.019 8)。结论重庆市2008年手足口病发病呈随机性分布,2009-2012年手足口病发病有空间聚集性,重庆市2008-2012年手足口病发病受城镇化率及每千人口中的卫生技术人员数的影响,又以受城镇化率影响较大。
- 唐小静曾庆赵寒易娟李勤肖达勇夏宇杨荣刚方明金
- 关键词：手足口病空间自相关LISA空间滞后模型
- 微阵列数据中的先验信息对基于LASSO变量选择方法影响的模拟研究被引量：2
- 2015年
- 目的探讨微阵列数据中的先验信息对基于LASSO变量选择方法的影响。方法设置真实模型后,逐步融合先验信息,采用R、MATLAB软件编程,模拟比较先验信息对LASSO,group LASSO(简称为g LASSO)中的non-overlap group LASSO(简称为nog LASSO)和overlap group LASSO(简称为og LASSO)变量选择的影响。结果经典的LASSO、og LASSO变量选择方法在处理模拟微阵列数据时具有较好的预测精度(AUCLASSO=0.8915≈AUCog LASSO=0.8923>AUCnog LASSO=0.8396,MSEnog LASSO=0.1358>MSEog LASSO=0.0975≈MSELASSO=0.0928),LASSO可解释性最强(平均入选模型基因数分别为21.52、111.95、101.01)。nog LASSO在处理基因通路信息时,当[X295]被错分至第19个通路后,尽管未改变其效应值,但入选模型次数大为减少,预测精度下降较为明显,而og LASSO表现更稳健。结论融合微阵列数据中的先验信息并未提高基于LASSO变量选择方法的预测性能及效率,经典的LASSO变量选择方法仍为处理微阵列数据的有效方法。
- 陈江鹏彭斌文雯唐小静文小焱胡珊
- 重庆市手足口病流行特征及影响因素研究
- 目的: 自2008年卫生部将HFMD列入丙类法定传染病管理以来，发病率和死亡率一直居高不下，引起了医疗机构和防疫部门的高度重视，本研究旨在掌握重庆市HFMD流行特征和规律及了解死亡病例的可能危险因素，从宏观层面上掌握H...
- 唐小静
- 关键词：手足口病死亡率发病率空间聚集性
- 重庆市手足口病2008—2013年流行特征及趋势预测研究被引量：16
- 2014年
- 目的分析重庆市手足口病2008—2013年的流行特征及未来趋势。方法运用描述性流行病学方法,分析重庆市2008—2013年报告的手足口病发病资料,利用SAS/ETS的时间序列预测系统对重庆市2008—2013年手足口病发病进行建模与分析。结果 2008—2013年重庆市共报告手足口病例111 595例,死亡89例,年均发病率64.07/10万,死亡率0.51/10万;男性发病数多于女性;发病集中在0--5岁的儿童（96.56%）;各职业中,以散居儿童（58.97%）、幼托儿童（36.94%）为主;全市各区县均有病例报告,主城9区发病率高于远郊区县;发病有明显的季节性特点,2008—2011年发病数在3—8月呈单峰流行,2012年、2013年3—8月和10—12月出现两个流行峰,10—12月流行峰较3—8月更高。SAS/ETS时间序列预测系统自动筛选出的预测模型为季节性指数平滑模型,结果提示2014年手足口病发病有继续上升的趋势,在5—8月有一个发病高峰。结论重庆市2008—2013年手足口病发病存在明显的性别、年龄、职业、地区、季节差异,季节性指数平滑法能较好地模拟重庆市手足口病发病在时间序列上的变动趋势,对手足口病的防控具有重要的指导意义。
- 唐小静曾庆吴田勇李勤赵寒易娟肖达勇夏宇杨荣刚方明金
- 关键词：手足口病
