叶晓倩
- 作品数：2 被引量：7H指数：1
- 供职机构：浙江大学更多>>
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- 茶树“龙井43”叶绿体基因组的测定及其系统进化的分析
- 本文利用叶绿体基因结构的高度保守性，选用茶树品种“龙井43”为研究对象，用已测定的韩国茶树品种的叶绿体基因组序列为参考序列，利用高通量测序技术以及生物信息学手段对其叶片的叶绿体基因组进行测定，并比较“龙井43”与韩国茶树...
- 叶晓倩
- 关键词：茶树叶片叶绿体基因组亲缘关系
- 茶树“龙井43"叶绿体基因组测序及其系统进化(英文)被引量：7
- 2014年
- 利用高通量测序技术对中国茶树品种龙井43"叶绿体基因组的全序列进行测定,拼接补洞后再利用Sanger测序法对序列进行验证,最终得到龙井43"叶绿体基因组全序列(GenBank登录号:KF562708.1).该基因组大小为157 085bp,其中大单拷贝区的长度为86 642bp,小单拷贝区的长度为18 283bp,反向重复区的长度为26 080bp,共注释叶绿体基因134个.与韩国茶树品种叶绿体基因组序列比对,在编码区发现15个基因发生了非同义突变,在非编码区有100多个多态性位点,这些突变可作为茶树品种鉴定的DNA标记.同时,选取12个中国茶树品种,对其叶绿体基因组上的特异性片段(ycf1,psbA-trnH,psbK-psbI-psbI)进行测序比对并构建系统进化树.结果表明:12个茶树品种在进化树上分为2个亚群,其中凌云白毛茶"单独形成一支,其他11个品种形成一支;而11个品种中,龙井瓜子"龙井长叶"龙井圆叶"中茶102"形成一支,自展支持率为100%.表明利用叶绿体基因片段可有效区分茶树品种间的亲缘关系.
- 叶晓倩赵忠辉朱全武王营营林张翔叶楚玉樊龙江须海荣
- 关键词：龙井43叶绿体基因组系统发育树
