刘海波
- 作品数:25 被引量:111H指数:6
- 供职机构:北京市房山区疾病预防控制中心更多>>
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- 2015年北京市房山区乙型Yamagata系流感病毒HA基因特性分析被引量:1
- 2017年
- 目的了解北京市房山区2015年乙型Yamagata系流感病毒HA1基因变异情况。方法选取2015年流感病原学监测中分离到的乙型Yamaga/a系毒株共13株,采用RT-PCR法扩增病毒HA基因片段后进行序列测定,与WHO推荐的疫苗株进行比对并构建进化树。采用MEGA6软件对测序结果进行分析。结果2015年房山区乙型Yamagata系流感病毒HA1基因片段序列测定拼接后核苷酸长度为1059bp,编码氨基酸为353个,与2014—2015年的疫苗株B/Massachusetts/02/2012比较,13株毒株的氨基酸均在第123、131、165、180、187、196、211、217、244、313、327位点有变异;与2012-2013年的疫苗株B/Wiseonsin/01/2010比较,13株毒株的氨基酸在第187、313、327均有变异。做进化树分析,房山区2015年分离到的乙型Yamagata系流感病毒与疫苗株B/Wiseonsin/1/2010在同一个分支上,距离较近,与B/Massachusctts/2/2012不在一个分支上,距离较远。结论2015年北京市房山区乙型Yamagata系流感病毒HA1基因在抗原决定簇区已发生变异,但疫苗株B/Wiseonsin/01/2010有保护作用,应继续关注氨基酸的替换。
- 阚震刘海波刘颖史文凤黄少平
- 关键词:乙型流感病毒HA1基因进化树
- 2014—2015年北京市房山区H3N2亚型流感病毒基因特性
- 2017年
- 目的了解北京市房山区2014—2015年H3N2亚型流感病毒HA1基因变异情况。方法随机分别选择2014—2015年流感病原学监测中分离到的H3N2型毒株共26株,采用RT-PCR法扩增病毒目的基因片段后进行序列测定,与WHO推荐的北半球疫苗株及常见H3N2毒株进行比对并构建进化树。采用MEGA6软件对测序结果进行分析,同源性计算使用BLAST网站,利用NetNGlyc 1.0软件进行糖基化位点预测。结果 2014—2015年房山区H3N2亚型流感病毒HA1目的基因片段序列测定拼接后最长核苷酸片段为703 bp最短核苷酸片段为696 bp,没有核苷酸的丢失,编码氨基酸为232-234个;抗原表位A抗原表位和D抗原表位有变异;受体结合位点第228位由丙氨酸变为丝氨酸,第130位由丝氨酸变为苏氨酸;做进化树分析,发现该分析中的H3N2亚型流感病毒位于2个分支上,分别为A/Switzerland/9 715 293/2013和A/HongKong/5 738/2014,大部分与前者在一个分支。结论北京市房山区2014—2015年H3N2流感病毒的血凝素重链区HA1基因特性有部分变化,抗原表位A抗原表位和D抗原表位有变异,且在基因进化上与当年的疫苗株分属不同分支,具有一定的进化距离,相似度较低,可能导致H3N2流行。
- 刘海波刘颖史文凤黄少平阚震王云霞
- 关键词:基因测序进化树
- 北京市房山区腹泻病例分离副溶血性弧菌的分子流行病学特征被引量:8
- 2018年
- 目的了解2016年北京市房山区腹泻病例副溶血性弧菌分离株的血清型、毒力基因、耐药性及PFGE分子分型特征。方法依照GB 4789.7-2013《食品安全国家标准食品微生物学检验副容血性弧菌检验》进行副溶血性弧菌生化鉴定,使用玻片血清凝集法进行血清分型,实时荧光聚合酶链式反应(PCR)测定毒力基因,微量肉汤稀释法进行药敏试验,脉冲场凝胶电泳进行分子分型及聚类分析。结果在检出的20株副溶血性弧菌中,O3:K6血清型占60%。所有菌株均携带tlh、tdh基因,trh基因的携带率为10%,tdh^+trh^-为优势基因型。抗生素敏感性结果显示,90%的菌株对至少1种抗生素耐药,其中多重耐药菌株5株。耐药率高的前3种抗生素分别是:头孢唑林(85%)、庆大霉素(75%)、氨苄西林(30%)。PFGE分型共得到10种带型,5株菌的PFGE带型一致,为优势带型。副溶血弧菌的血清型和PFGE带型之间具有高度的一致性。结论本地区副溶血性弧菌以tdh^+,trh^-的O3:K6型别为主,对头孢唑林、庆大霉素、氨苄西林等早期用药耐药率高,应慎重使用。
- 王云霞刘颖刘海波张晓嫒史文凤
- 关键词:副溶血性弧菌毒力基因耐药分析脉冲场凝胶电泳
- 北京市房山区腹泻患者空肠弯曲菌感染及菌株分型耐药特征被引量:4
- 2019年
- 目的了解北京市房山区感染性腹泻患者空肠弯曲菌感染及分离株的病原学特征。方法2017年5—12月,收集2家医院腹泻患者的粪便标本,进行弯曲菌的分离、培养及鉴定。对分离的空肠弯曲菌进行11种抗生素的敏感性检测,并对菌株进行多位点序列分型。结果共检测标本286份,分离到弯曲菌31份,检出率为10.80%;经质谱鉴定28株为空肠弯曲菌,3株为结肠弯曲菌。空肠弯曲菌可分为23种不同的ST型,其中4株为ST22,2株为ST760,2株为ST6500,其他20株分别属于20种ST型别;研究发现3个新的ST型,分别为ST9253、ST9254和ST9255。28株空肠弯曲菌对萘啶酸、环丙沙星、四环素的耐药率达100.00%,对氟苯尼考的耐药率为39.29%,对红霉素、阿奇霉素、泰利霉素、克林霉素敏感。结论北京市房山区腹泻患者空肠弯曲菌感染率较高,对喹诺酮、氟喹诺酮类、四环素类药物耐药严重,对大环内酯类、酮内酯类和林可酰胺类药物敏感;菌株的ST型呈多样性分布。
- 刘海波刘颖王云霞张晓嫒史文凤
- 关键词:空肠弯曲菌腹泻抗生素敏感性多位点序列分型
- 2014年北京市房山区沙门菌血清学鉴定及耐药性分析被引量:5
- 2016年
- 目的分析2014年北京市房山区感染性腹泻患者中沙门菌的血清型及耐药情况,为本地沙门菌感染临床用药提供依据。方法收集房山区2家哨点医院感染性腹泻患者的肛拭子培养,进行沙门菌的生化鉴定和血清分型,用微量肉汤稀释法进行药物敏感性试验。结果共分离出19株沙门菌,检出9个血清型,其中前3位的为猪伤寒沙门菌、鼠伤寒沙门菌和布利丹沙门菌,构成比均为21.05%。药物敏感试验显示19株沙门菌对头孢西丁、头孢噻肟和庆大霉素敏感率较高,分别为100.00%、94.74%和89.47%。对萘啶酸和四环素耐药率较高,分别为63.16%和42.11%。结论北京市房山区2014年沙门菌优势血清型为猪伤寒沙门菌、鼠伤寒沙门菌和布利丹沙门菌,对头孢西丁、头孢噻肟和庆大霉素敏感率较高,临床治疗时可合理使用抗生素。
- 董梅史文凤黄少平阚震刘海波
- 关键词:沙门菌属血清学鉴定耐药性
- 2016年北京市房山区B型Victoria系流感病毒基因特性分析
- 2017年
- 目的了解北京市房山区2016年B型Victoria系流感病毒HA1基因变异情况。方法随机选择2016年流感病原学监测中分离到的B型Victoria系毒株共13株,采用反转录PCR(RT-PCR)法扩增病毒目的基因片段后进行序列测定,与WHO推荐的疫苗株进行比对并构建进化树。采用MEGA6软件对测序结果进行分析,同源性计算使用BLAST网站。结果 2016年房山区B型Victoria系流感病毒HA1目的基因片段序列测定拼接后最长核苷酸片段为1 081 bp,编码氨基酸为360个,与2015—2016年的疫苗株B/Brisbane/60/2008比较,13株流行株的氨基酸在第132、144位点有变异,其他位点的氨基酸变异呈散在性;与2008—2009年的疫苗株B/Florida/4/2006比较,13株流行株的氨基酸部分位点的变异具有普遍性。做进化树分析,房山区2016年分离到的B型Victoria系流感病毒与疫苗株B/Brisbane/60/2008在同一个分支上,距离较近。结论 2016年北京市房山区B型Victoria系流感病毒HA1基因在抗原决定簇区有一定的变异,但疫苗株B/Brisbane/60/2008有保护作用,应继续关注氨基酸的替换。
- 史文凤刘海波刘颖黄少平阚震
- 关键词:乙型流感病毒HA1基因进化树
- 2018年北京市房山区弯曲菌监测结果及耐药性分析被引量:6
- 2020年
- 目的了解2018年北京市房山区哨点医院腹泻患者和生禽鸡的弯曲菌感染情况及药物敏感情况,为弯曲菌防治工作提供依据。方法2018年1-12月在北京市房山区2家哨点医院收集未用抗生素的腹泻患者粪便标本进行弯曲菌、沙门菌、副溶血弧菌、志贺菌、5种致泻性大肠埃希菌及轮状病毒和诺如病毒的分离培养和鉴定;对生禽鸡进行弯曲菌、沙门菌和单增李斯特菌的分离、培养、鉴定;对分离到的空肠弯曲菌开展药物敏感试验。结果收集395例腹泻患者的粪便标本,男性212例,女性183例,其中16~45岁患者占66.08%。其中病原菌阳性的患者160例,阳性率为40.51%,检出病原菌共176株。弯曲菌检出53株,阳性率为13.41%;致泻大肠菌检出34株,阳性率为8.61%;沙门菌检出20株,阳性率为5.06%;副溶血性弧菌检出20株,阳性率为5.06%;志贺菌检出0株,阳性率为0%;轮状病毒检出26株,阳性率为6.58%;诺如病毒检出23株,阳性率为5.82%。人粪便标本检出弯曲菌的病例中37名男性和16名女性感染比较,差异有统计学意义(17.45%vs8.74%,χ^2=6.413,P<0.05)。40只生禽鸡中,共31只检出病原菌(77.5%),检出病原菌36株,其中沙门菌13株,弯曲菌23株。人粪便标本和生禽鸡检出的空肠弯曲菌对萘啶酸、环丙沙星、四环素的耐药率均大于80%,生禽鸡中的空肠弯曲菌对氟苯尼考的耐药率为90%,而人粪便标本中的空肠弯曲菌对氟苯尼考的耐药率为53.33%;红霉素、阿奇霉素、泰利霉素、克林霉素、链霉素和庆大霉素的敏感性大于80%。结论北京市房山区腹泻患者弯曲菌感染率高,空肠弯曲菌对萘啶酸、环丙沙星和四环素耐药严重;腹泻患者病原菌种类多,在继续加强监测的同时开展宣传教育。
- 刘海波刘颖王云霞史文凤黄少平阚震
- 关键词:腹泻空肠弯曲菌耐药性
- 新冠肺炎疫情常态化下房山区腹泻病例肠道病原体感染情况分析
- 2023年
- 目的了解新冠肺炎疫情常态化防控背景下,北京市房山区腹泻病例肠道病原体的感染情况,为肠道传染病的防治工作提供依据。方法2021年1月1日至2021年12月31日,收集北京市房山区某2家二级医院未使用抗生素治疗的腹泻病例的粪便标本,进行志贺菌、沙门菌、副溶血性弧菌、大肠埃希菌、弯曲菌、轮状病毒、诺如病毒、星状病毒、扎如病毒和腺病毒的分离培养鉴定。结果392例腹泻病例,男性219例,女性173例,以青年为主。至少一项病原体阳性的腹泻病例84例,检出肠道病原菌89株,检出率为22.70%,弯曲菌35株,诺如病毒18株,致泻性大肠埃希菌14株,沙门菌10株,副溶血性弧菌4株,轮状病毒4株,扎如病毒2株,肠道腺病毒2株。病原体检出高峰为4~10月。其可疑暴露食品主要为熟食冷荤31例,水果蔬菜9例和凉拌菜8例;食用方式主要为直接食用43例;食用地点主要为居家53例。结论2021年新冠肺炎疫情常态化防控背景下,北京市房山区腹泻病例病原体检出率有所下降,种类多样,以弯曲菌为主,应继续监测并开展多形式的宣传教育,以提升当地居民的食品安全意识。
- 董梅刘海波王云霞史文凤刘颖张冬然郭新慧张晓嫒
- 关键词:弯曲菌致泻性大肠埃希菌副溶血弧菌诺如病毒星状病毒
- 2015-2017年北京市房山区肠道门诊14岁以上腹泻病例轮状病毒和诺如病毒病原学监测结果被引量:3
- 2019年
- 目的监测北京市房山区腹泻患者中轮状病毒和诺如病毒的感染情况,为制订预防控制策略提供依据。方法 2015-01/2017-12收集北京市2家哨点医院肠道门诊14岁以上腹泻患者粪便标本590份,采用荧光PCR方法对A组轮状病毒和诺如病毒进行检测。结果 150份样本病毒检测阳性,轮状病毒检出率为6.10%(36/590),诺如病毒检出率为19.70%(116/590),诺如病毒检出率高于轮状病毒检出率,差异有统计学意义。轮状病毒检出的高峰月份为12月-次年3月。诺如病毒检出率较高的月份有2-7月、10-12月。14~20岁的患者轮状病毒阳性率为10.53%,诺如病毒阳性率为26.32%,均高于其他年龄组。二分类Logistic回归分析发现,小于20岁的人群病毒阳性的可能性是大于等于60岁人群的2.378倍(95%CI:1.147~4.932),夏季感染病毒的可能性是冬季感染病毒的0.219倍(95%CI:0.122~0.392),秋季感染病毒的可能性是冬季的0.275倍(95%CI:0.153~0.495),即冬季容易出现轮状病毒和诺如病毒的感染。结论目前诺如病毒是北京市房山区肠道门诊腹泻患者的重要病原之一,有暴发疫情的可能性,应继续关注并加强宣传以减少疾病的流行。
- 史文凤刘海波
- 关键词:腹泻轮状病毒诺如病毒
- 1起由产气荚膜梭菌引起的聚集性腹泻事件的病原学分析被引量:1
- 2023年
- 目的分析1起由产气荚膜梭菌引起的聚集性腹泻事件的病原学特征。方法采集腹泻事件患者的粪便标本,利用FilmArray快速检测和荧光定量PCR方法进行致病细菌初筛,根据初筛提示进行细菌分离培养,对分离株进行质谱鉴定分析、PFGE分析和全基因组测序分析。结果本起疫情共搜索到病例9例,采集25份样品,混合样多病原快速分析测试条(GI)初筛结果为阴性;食源性致病菌核酸多重实时荧光PCR检测,9份样品为阳性,阳性率36.00%。共分离到9株产气荚膜梭菌,其中7株A型产气荚膜梭菌,1株C型产气荚膜梭菌,1株F型产气荚膜梭菌。9株菌全基因测序结果显示泛基因的核心基因高度同源,且都携带耐药基因:其中1株仅携带mprF耐药基因,1株同时携带mprF和tetB(P)2种耐药基因,6株同时携带mprF、tetB(P)和tetA(P)3种耐药基因,1株同时携带mprF、tetB(P)、tetA(P)和ermQ4种耐药基因。结论此次聚集性腹泻事件是由食用被产气荚膜梭菌污染食品所致。9株菌高度同源,且存在多重耐药现象。未来应持续关注产气荚膜梭菌的耐药情况,并加强公众食品安全知识宣传普及。
- 刘海波王云霞刘颖史文凤张冬然赵霞
- 关键词:产气荚膜梭菌耐药性毒力基因