赵晓南
- 作品数：34 被引量：96H指数：7
- 供职机构：云南省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项云南省应用基础研究基金艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 昆明地区急性呼吸道感染病毒病原谱分析被引量：6
- 2013年
- 目的了解昆明地区急性呼吸道感染病毒病原谱.方法采集急性呼吸道感染患者鼻、咽拭子,采用多重RT-PCR法进行15种呼吸道病毒病原体检测.结果 600例样本中检出病毒144株,阳性率24%,阳性率最高的是RSV(49/600,8.2%),依次是PIV(32/600,5.3%)、HRV(27/600,4.5%)和IFV(27/600,4.5%);不同年龄组呼吸道病毒感染情况不同,≤1岁年龄组病毒检出率最高(72/216,33.3%);不同季节呼吸道病毒感染情况也不同,其中第一季度病毒检出率最高(85/144,59%).结论 2011年昆明地区急性呼吸道感染的主要病原是RSV,患者中儿童检出率最高;第一季度的病毒检出率高于其他季度.
- 李娟向以斌曹艺会赵晓南宁德明伏晓庆
- 关键词：急性呼吸道感染病毒病原学
- 云南省首例人感染H9N2禽流感病例发现与应对被引量：10
- 2017年
- 目的对云南省流感监测中发现的首例人感染H9N2禽流感病例进行调查分析,为进一步防治人禽流感疫情提供科学依据。方法对患者、密切接触者和活禽市场开展流行病学调查,并采集病例呼吸道标本和外环境标本进行实验室检测分析。结果病例有活禽市场暴露史,标本禽流感病毒核酸阳性结果表明,该病例为人感染H9N2禽流感确诊病例,未出现二代病例。病例暴露的活禽市场环境中存在大量禽流感病毒。结论医疗机构加强流感样病例监测和不明原因肺炎监测是及时发现人禽流感病例的重要手段。活禽交易市场定期消毒与休市是降低感染率的关键措施。
- 罗春蕊赵晓南宁德明李多徐闻
- 关键词：流感监测疫情处置
- 云南省陇川县本土新冠疫情溯源和病毒基因组变异解析被引量：1
- 2022年
- 2021年7月14日,云南省陇川县报告了新型冠状病毒肺炎(COVID-19)本土疫情。为了阐明本次德宏州陇川县本土疫情的感染来源和SARS-CoV-2变异情况,我们收集疫情期间采集的9例陇川疫情本土病例和2例陇川境外病例标本进行新冠病毒全基因组测序。通过一系列比较基因组学分析,发现9例陇川疫情本土病例和2例陇川境外病例病毒株基因组序列高度同源,均属Delta变异株(B.1.617.2进化分支),在系统发育树上单独成簇,为同一传播链。9例陇川疫情本土病例和2例境外病例病毒株基因组序列共享38个SNP突变位点和13个缺失。9例本土病例中的4例病毒株均额外增加了1个共享的SNP突变位点,其中2例本土病例病毒株新产生9个核苷酸缺失。这些病毒株S蛋白均发现L452R、T478K、P681R等可能影响病毒传播和免疫逃逸能力的关键性变异位点。该研究表明本次陇川疫情的暴发与发病前14天内德宏州陆路口岸输入病例以及瑞丽2021年7月14日疫情本土病例并无关联性,提示病毒传染源可能来自境外人员。因此,应持续加强边境从业人员和抵边村寨边民的病毒核酸检测以及本土/输入病例基因组变异规律的深入挖掘和监测。
- 张美玲伏晓庆刘照生赵晓南周洁楠
- 关键词：全基因组测序突变位点
- 2016年至2018年云南省住院严重急性呼吸道感染病例监测结果分析被引量：11
- 2020年
- 目的探讨云南省住院严重急性呼吸道感染(SARI)病例流行病学、临床和流感病原学变化特征。方法对2016年1月至2018年12月云南省哨点医院监测到的SARI病例进行流行病学和临床特征调查,并采集咽拭子标本开展流感等呼吸道病毒检测。结果2016年1月至2018年12月,云南省哨点医院SARI病例占同期住院病例的1.20%(717/59917)。检出流感核酸阳性率为4.60%(33/717)。随机抽取的流感阴性SARI病例中,检出其他呼吸道病毒感染阳性率为23.81%(30/126),主要包括呼吸道合胞病毒、副流感病毒和偏肺病毒等。SARI病例主要来源于呼吸内科和儿内科,以青壮年和婴幼儿为主。流感确诊病例以青壮年儿童和老年人为主。并发症主要包括肺炎、呼吸衰竭和急性呼吸窘迫综合征等。SARI病例和确诊流感病例均主要集中于冬春季。SARI%和ILI%变化趋势相似。结论SARI监测作为流感样病例(ILI)监测的有效补充,建议加强呼吸道传染病防控知识的健康宣教,对重点人群推广接种流感疫苗,开展呼吸道多病原检测。
- 赵晓南李多周洁楠张美玲陈瑶瑶孙艳红罗春蕊
- 关键词：流感病毒
- 云南省一起人感染H7N9禽流感疫情调查分析被引量：8
- 2018年
- 目的对2017年6—7月云南省一起人感染H7N9禽流感疫情进行调查分析,为进一步防制人禽流感提供科学依据。方法对患者、密切接触者和活禽市场开展流行病学调查,并采集病例呼吸道标本和外环境标本进行检测分析。结果 2017年6—7月云南省文山壮族苗族自治州文山市共报告人感染H7N9禽流感确诊病例5例,分别为流感样病例监测2例、不明原因肺炎加强监测2例和密切接触者调查1例,其中女性3例、男性2例,中位年龄34(4.5～55)岁,4例病例发病前有活禽市场暴露史;5例病例发病至首诊平均时间为2 d,入院3 d,确诊9 d,抗病毒治疗7 d;对病例采取隔离治疗、密切接触者医学观察、阳性活禽市场休市等综合措施后,疫情得到有效控制。结论医疗机构加强流感样病例监测和不明原因肺炎监测是及时发现人禽流感病例的重要手段。活禽交易市场定期消毒与休市为降低感染率的关键措施。
- 罗春蕊周雪花赵晓南李多周洁楠宁德明任瑞琦
- 关键词：流行病学
- 昆明市2009～2013年B型流感病毒血凝素及耐药基因分析被引量：1
- 2016年
- 目的研究B型流感病毒HA、NA全基因序列,为流感防控提供支持。方法从云南省疾病预防控制中心流感实验室分离毒株中挑选代表株进行HA和NA全基因序列分析。结果发现Bv型毒株和标准株比有K129N、K80R、K48E的变异,其中K129N在120环区域,除2009年分离株外,其他Bv株均有75位点的变异。By毒株HA基因相同突变位点比较多,如N116K、S150I、N165Y、S229D、D196N等,云南分离株都有D196N的变异位点,增加了糖基化位点的可能性。研究发现所有的NA基因没有发生耐药性基因的突变,同源性相对比较高,但有基因重组毒株生成。结论云南分离株B型流感病毒突变位点多,并且有重组毒株生成,说明加强监测耐药株的重要性。
- 曹亿会李娟蒋立赵晓南宁德明罗春蕊徐闻
- 关键词：B型流感病毒神经氨酸酶血凝素突变
- 2017年云南省外环境禽流感监测结果分析被引量：4
- 2019年
- 目的通过分析云南省2017年外环境禽流感监测结果,为禽流感防控工作提供科学依据。方法采用real-timePCR方法对标本进行流感病毒A型、H5、H7、H9亚型检测,数据分析使用SPSS21.0软件。结果2017年云南省共采集外环境标本5692份,流感病毒检出总阳性率为25.07%。活禽批发市场阳性率最高,为38.19%,5类监测场所的禽流感病毒阳性率差异有统计学意义(χ2=732.02,P<0.01)。不同标本类型检测结果显示,清洗禽类污水标本的病毒阳性率最高,达43.33%,不同标本类型的病毒阳性率差异有统计学意义(χ2=319.67,P<0.01)。保山市阳性率最高(48.00%),大理州最低(11.11%),云南省16个州(市)病毒阳性率差异有统计学意义(χ2=336.29,P<0.01)。结论云南省外环境禽流感病毒阳性率较高,型别多样,活禽批发市场和城乡活禽市场应作为重点监测场所,预防禽流感病毒从禽、环境到人的传播。
- 陈瑶瑶赵晓南李多周洁楠
- 关键词：禽流感
- 2018—2019年昆明地区严重急性呼吸道感染病例病原学分析被引量：11
- 2020年
- 目的通过分析昆明市住院严重急性呼吸道感染(severe acute respiratory infection,SARI)病例病毒病原谱构成及其流行病学特征,为SARI临床诊治及预防控制提供病原学依据。方法实时荧光定量PCR的方法检测多种呼吸道病毒,结果采用软件SPSS20.0进行统计分析。结果2018年1月至2019年3月共检测了291份SARI病例咽拭子标本,检测出86份阳性标本,阳性率达29.55%。检出率最高的单病原分别为人甲型流感病毒(11.34%)、人偏肺病毒(3.44%)及人呼吸道合胞病毒(3.09%),有6份标本出现了两种病毒的混合感染,混合感染率为2.06%。男性病例病毒检出率高于女性病毒检出率(χ^2=6.183,P=0.013),2~5岁年龄组病例病毒检出阳性率最高,呼吸道病毒检出阳性高峰在第4季度和第1季度,病毒阳性组和病毒阴性组的比较,除咳痰(χ^2=5.107,P=0.024)及流涕(χ^2=4.683,P=0.030)两个症状外,其余临床症状及体征、并发症和基础疾病在两组间差异均不具有统计学意义。结论2018—2019年流感病毒为昆明市SARI病例最主要的感染病原体,检出的病原体在不同年龄段、季节有一定的流行规律。
- 周洁楠赵晓南孙艳红陈瑶瑶
- 关键词：住院病例
- 2016-2017年云南省禽类相关外环境禽流感病毒监测结果分析被引量：12
- 2018年
- 目的对2016—2017年度云南省5类场所禽流感病毒监测结果进行分析,了解禽流感病毒分布情况,同时评估人感染禽流感病毒的风险,为云南省禽流感防控工作提供依据。方法选取全省16个市(州)共139个监测点,采集6类环境标本827份,采用荧光定量PCR方法对标本进行甲型及H5、H7、H9亚型流感病毒检测,χ2检验用于结果分析,同时对甲型流感阳性标本进行病毒分离及亚型鉴定工作。结果 827份外坏境标本中,共检出甲型流感阳性样本221份,阳性率26.27%,H5亚型阳性5份,阳性率0.60%,H9亚型阳性182份,阳性率22.00%,H5、H9亚型混合阳性7份,阳性率0.85%,甲型未分型27份,阳性率3.26%。不同地区之间甲型流感病毒阳性率差异有统计学意义(χ2=122.043,P<0.001),位居前3的依次为文山州(70.00%)、保山市(58.49%)和怒江州(47.83%);鸡胚分离到禽流感病毒亚型有H5N1、H5N2、H9N2等,其中H9N2毒株107株,占95.53%,H5N2毒株2株,H5N6毒株2株,各占1.79%,H5N1毒株1株占0.89%;不同监测场所之间甲型流感病毒阳性率差异有统计学意义(χ2=127.920,P<0.001),其中以城乡活禽市场环境禽流感病毒阳性率高,活禽批发市场次之;不同标本类型之间甲型流感病毒阳性率差异有统计学意义(χ2=51.689,P<0.001),其中清洗禽类的污水阳性最高,宰杀或摆放禽肉案板表面的擦拭标本次之。结论云南省外环境中禽流感病毒以H9亚型为主,H5亚型少量存在,混合感染多见,应积极采取综合性预防控制措施。
- 康显虎赵晓南周洁楠宁德明李多
- 关键词：禽流感
- 云南省2009年至2014年B型流感毒株血凝素基因进化分析被引量：1
- 2016年
- 目的了解云南省2009年至2014年B型流感病毒血凝素(HA1)基因突变及其抗原变异情况.方法将云南省2009年至2014年流感哨点监测医院采集的流感样病例咽拭子进行病毒分离,随机抽取12株B型流感病毒进行HA1基因序列测定,并对测序产物进行分析,通过MEGA软件进行同源性比对、构建HA基因进化树.结果云南省流感毒株血清型和基因型鉴定有差异,可能是由于基因变异后量的积累量不够引起.在HA1蛋白的抗原决定簇的3个重要区域120环,150环和160环都有氨基酸的变异.云南省流感毒株在120环的131位置氨基酸变异为N131K,137位置B-Victoria系氨基酸发生了N137H的变异,187位置有2株发生了P187S的变异.结论云南省的B型流感毒株在血凝素基因重要位置发生了多处变异,有和疫苗株相同的变异,也有不同于疫苗株的变异.
- 曹亿会李娟赵晓南宁德明罗春蕊徐闻
- 关键词：B型流感病毒血凝素进化分析
