赵敏
- 作品数：10 被引量：2H指数：1
- 供职机构：哈尔滨医科大学更多>>
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- 相关领域：医药卫生社会学经济管理更多>>
- 基于ESPCA模型的结肠癌差异基因筛选研究
- 2021年
- 目的验证ESPCA模型降维及变量选择的效果优于SPCA;利用ESPCA模型分析结肠癌基因数据,寻找不同主成分的通路信息,筛选结肠癌的差异基因。方法模拟实验比较ESPCA模型与SPCA的降维及变量选择能力,通过灵敏度、特异度、准确度评价其变量筛选效果;收集TCGA结肠癌基因数据,利用ESPCA模型对结肠癌基因数据进行降维及变量筛选。结果模拟实验获得的ESPCA模型具有较高的灵敏度、特异度和准确度,降维及变量选择效果优于SPCA。结肠癌数据分析结果显示:降维后ESPCA模型第一主成分中基因与18条GO-BP通路及7条KEGG通路有关,ESPCA模型第二主成分中基因与19条GO-BP通路有关;根据度中心性及中介中心性对主成分基因排序筛选出6个差异基因:MYC、CD44、PKM、FBL、PSMA7、RPS2,经GSE137327数据集验证具有较高的AUC值。结论ESPCA模型在降维过程中既考虑数据本身信息,又考虑了生物网络信息,具有良好的降维及变量选择效果。结肠癌数据分析中ESPCA第一主成分中基因参与癌症相关的通路;ESPCA第二主成分中基因参与的通路与免疫相关;通路中基因参与癌症的发生发展过程、可能通过免疫反应相关通路调节结肠癌的发生发展过程;获得的6个结肠癌差异基因可为研究疾病发生机制和鉴别诊断提供依据。
- 李称张秋菊孙琳丛雨欣赵敏刘美娜
- 关键词：降维方法
- 基于lncRNA-mRNA共表达网络筛选胃癌分期相关的lncRNA被引量：2
- 2021年
- 目的构建lncRNA-mRNA共表达网络,探索与胃癌分期相关的lncRNA及其调控关系,为研究胃癌的进展机制及寻找胃癌治疗的潜在靶点提供依据。方法利用TCGA数据库,收集胃癌RNA-seq数据及临床信息数据;采用表达数量性状位点(eQTL)分析与加权基因共表达网络分析(WGCNA)相结合的方法,构建lncRNA-mRNA共表达网络模块,结合临床信息筛选与胃癌分期相关的模块;采用Kruskal-Wallis秩和检验筛选模块内胃癌不同分期差异表达的lncRNA。结果获得286例胃癌组织和30例癌旁对照组织样本的RNA-seq数据;eQTL分析得到5118对顺式作用和1 953 109对反式作用lncRNA-mRNA;2 999个lncRNA和3 884个mRNA纳入WGCNA,产生25个共表达模块,其中与胃癌分期高度相关的模块有3个;模块midnightblue、orange内18个枢纽lncRNA中有14个lncRNA在胃癌不同分期差异表达。结论本研究筛选出14个与胃癌分期相关的lncRNA,这14个lncRNA可能通过调控mRNA的表达影响胃癌的进展,分析其对应的网络调控关系,为研究lncRNA-mRNA调控机制及探索胃癌治疗靶点提供了参考和方向。
- 丛雨欣张秋菊田伟张奇李称赵敏刘美娜
- 关键词：胃癌EQTLMRNA
- 甲亢合并男性乳腺增生症一例
- 1989年
- 病历摘要患者,男,53岁,1988年4月26日入院。病人于1988年元月曾在外院诊断为甲亢,接受他巴唑治疗。入院前2周发现双乳房肿胀,有触痛。无特殊服药史,家族中无类似情况。查体:略消瘦,语多兴奋,皮肤湿润。
- 刘晓民赵敏阴会清梁兆光
- 关键词：甲亢乳腺增生症
- 基于sigFeature结合集成特征选择技术的小麦不耐受差异表达蛋白筛选研究
- 背景及目的:小麦不耐受是指免疫系统将小麦中的某些成分识别为有害物质,机体产生过度的保护性免疫反应,诱发III型变态反应,使机体多个系统出现临床病理症状。目前,小麦不耐受的研究多为检测人群中食物特异性抗体阳性率,或从植物中...
- 赵敏
- 关键词：蛋白质组学
- 骨髓单个核细胞移植联合G-CSF治疗大鼠急性心肌梗死的实验研究
- 目的：利用骨髓单个核细胞移植联合粒细胞集落刺激因子(G-CSF)治疗急性心肌梗死，观察心肌梗死后大鼠心功能改善，心肌细胞及血管再生的情况。
方法：将60只大鼠用结扎冠状动脉前降支的方法制成心肌梗死模型后，随机分...
- 赵敏
- 关键词：骨髓单个核细胞骨髓移植G-CSF治疗心肌梗死
- 文献传递
- 老年及老年前期高渗性非酮症性糖尿病昏迷20例临床分析
- 1989年
- 高渗性非酮症性糖尿病昏迷(NHDC)是糖尿病的严重并发症之一。我院1978～1988年共收治20例50岁以上的NHDC病人,年龄51～76岁,诱因主要为感染。20例中均有不同程度的意识改变及脱水,血糖均在33.31mmol/L以上。
- 阴慧清梁兆光解汝娟刘晓民赵敏陈兆凤毛广芬赵学义崔自为
- 关键词：老年前期高渗状态普通胰岛素血浆渗透压
- 基于sigFeature方法的小麦不耐受患者差异蛋白筛选及通路研究
- 2022年
- 目的 应用蛋白质组学技术,基于sigFeature变量筛选方法,获得小麦不耐受患者血清差异表达蛋白;利用富集分析获得差异蛋白生物学解释,为小麦不耐受发病机制的研究提供依据。方法 收集小麦不耐受患者和对照组血清样本;应用TMT标记定量蛋白质组学技术获得蛋白表达数据、sigFeature方法筛选差异表达蛋白;进行差异蛋白GO功能注释和KEGG富集分析,外部数据集进行差异蛋白验证。结果 TMT技术鉴定蛋白849个,sigFeature筛选获得差异蛋白22个。富集分析结果:GO富集分析发现差异蛋白参与血小板脱颗粒、急性期反应等生物学过程;KEGG富集分析发现差异蛋白参与补体与凝血级联通路。外部验证结果:ITIH2蛋白的ROC曲线下面积最大,AUC值为0.8673。结论 补体系统抑制和脂质代谢过程的改变是小麦不耐受发生的重要环节;ITIH2蛋白可能是小麦不耐受的关键蛋白;本研究从人体血清蛋白质组学的角度,为探究小麦不耐受的发生和调控机制提供依据。
- 赵敏张薇孙琳王玉鹏刘美娜
- 关键词：差异表达蛋白
- 绒毛膜促性腺激素对男性低促性腺激素性性功能减退症的疗效
- 1989年
- 本文对经6个月HCG治疗的4例HH病人进行了临床分析。4例病人治疗3个月时出现了第二性征,睾丸酮水平升至正常男性睾酮水平低值。睾丸体积及体力明显增加,性功能有所改善。
- 刘丽君赵敏解汝娟
- 关键词：HCG睾酮
- 基于动态代谢组学数据通路信息校正的混合效应模型建立及模拟研究
- 2020年
- 目的建立基于代谢通路信息校正的混合效应模型,通过模拟实验评价模型筛选动态代谢标志物的效果,为动态代谢组学生物标志物筛选提供方法。方法通过条件自回归模型,利用代谢物在通路中的位置关系,结合一阶自回归模型,建立基于代谢通路信息校正的混合效应模型并进行模拟研究;利用模型实现代谢标志物相关关系和时间因素的拟合,结合处理因素回归系数的95%可信区间获得动态代谢标志物。结果建立了基于代谢通路信息校正的混合效应模型;在各种模拟条件下,模型对动态代谢标志物的筛选均有较高灵敏度,特异度以及准确率;动态时间点数和代谢物自身噪声水平对模型的灵敏度有较大影响;通过模拟实验发现时间点数大于5时模型已有较高的拟合精度;样本量是影响模型拟合效果的重要因素,当样本量大于30时,模型筛选差异标志物的灵敏度已大于90%。结论基于通路信息校正的混合效应模型,能够很好地应对动态代谢组学数据分析的各种复杂情况,是动态代谢组生物标志物筛选研究的可选方法之一。
- 田伟张秋菊侯小文李称丛雨欣赵敏刘美娜
- 关键词：混合效应模型代谢通路标志物
- 基于联合稀疏典型相关的泛癌CNVs与mRNA联合分析
- 2020年
- 目的利用联合稀疏典型相关方法进行泛癌拷贝数变异(CNVs)与mRNA数据融合分析,探讨拷贝数对基因表达的影响,识别分子机制的同质性和特异性,为癌症的分子机制研究提供依据。方法通过联合稀疏典型相关方法进行泛癌CNVs和mRNA数据融合分析,提取泛癌中共存CNVs及其相关的mRNA建立相关模块;在此基础上利用联合稀疏精确矩阵估计算法筛选具有直接关系的CNVs-mRNA对,并分析CNVs与不同肿瘤分期的相关性。结果提取的相关模块中CNVs和mRNA变量数分别为195和177个,其中13个mRNA存在于全部癌症,38个mRNA特异性存在于单一癌症中;共筛选出16对具有直接相关关系的CNVs-mRNA对,包括11个CNVs位点,对应基因EYA2、NNAT已在多种癌症中被发现;相关性检验显示全部11个基因拷贝数与结肠癌的T、N期,肾透明细胞癌的T、M期,浸润性乳腺癌的T期相关。结论CNVs-mRNA相关关系在泛癌间存在同质性和特异性,同质性关系可用于识别泛癌药物作用靶点,特异性关系可以为研究癌症遗传变异对基因表达的特异性影响提供线索;CNVs-mRNA直接相关对中部分基因拷贝数与肿瘤分期相关,相应CNVs可能对基因表达有较强影响。
- 侯小文张秋菊田伟李称丛雨欣赵敏刘美娜
- 关键词：拷贝数变异MRNA
