赵剑虹
- 作品数:43 被引量:193H指数:9
- 供职机构:北京市朝阳区疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:北京市朝阳区科技计划项目国家科技重大专项北京市卫生系统高层次卫生技术人才培养项目更多>>
- 相关领域:医药卫生环境科学与工程文化科学更多>>
- 北京朝阳区2015年麻疹疑似病例实验室检测结果分析被引量:9
- 2016年
- 目的分析北京市朝阳区麻疹疑似病例的实验室检测情况,评价目前麻疹防控中病例的诊断方法。方法采用酶联免疫法(ELISA)对北京市朝阳区2015年麻疹疑似病例血清标本进行麻疹和风疹IgM抗体检测,对检测结果按照不同人群进行统计分析。其中64个病例同时采集了咽拭子进行核酸检测,并且对部分核酸与血清学结果不一致的标本及双份血均为阴性的标本进行了麻疹IgG和风疹IgG抗体的检测。结果综合实验室的血清学及病原学结果,253例“疑似麻疹病例”中确诊麻疹病例119例,阳性率47.04%,确诊风疹病例25例,阳性率9.88%。麻疹、风疹病例性别分布差异无统计学意义(P〉0.05)。麻疹和风疹发病主要分布在15~39岁年龄段。对于同时检测核酸和抗体的标本,35例麻疹结果不一致,为抗体阴性核酸阳性,7例风疹结果不一致,表现为6例抗体阴性核酸阳性,1例抗体阳性核酸阴性;麻疹和风疹IgG的结果显示,35例血清麻疹IgM阴性但麻疹核酸阳性的病例中,IgG抗体阳性率91.43%,22名采集双份血IgM均为阴性的病人,麻疹IgG阳性率81.82%,风疹IgG阳性率77.27%。结论对于麻疹疑似病例应综合核酸和IgM及IgG抗体的检测,及早并准确地确诊病例。
- 刘洁高艳李丽王珊赵剑虹李书明
- 关键词:麻疹风疹IGM抗体IGG抗体核酸
- 实时逆转录环介导等温扩增检测GⅡ.4型诺如病毒的研究被引量:3
- 2018年
- 目的建立快速检测诺如病毒GⅡ.4型的实时逆转录环介导等温扩增方法(RT-LAMP)。方法选取GⅡ.4型诺如病毒的ORF1与ORF2接头处较为保守的基因序列设计RT-LAMP引物并进行筛选,优化反应条件,分析方法的灵敏度、分析特异性和稳定性,采用优化的方法检测40例临床病毒性腹泻样本,结果与实时荧光逆转录PCR(RT-PCR)比较。结果该研究建立的诺如病毒GⅡ.4型RT-LAMP的最佳反应温度为65℃;该方法检测GⅠ型和GⅡ非诺如病毒4型、轮状病毒、札如病毒、星状病毒、腺病毒、CA16、EV71、CA6和CA10等常见10种其他腹泻病毒的结果为阴性;该方法对诺如病毒GⅡ.4型的检测能力与实时荧光RT-PCR相当;与实时荧光RT-PCR相比,该研究建立的RT-LAMP法检测诺如病毒GⅡ.4型阳性样本和诺如病毒阴性样本的符合率为100%。结论该研究建立的诺如病毒GⅡ.4型RT-LAMP快速检测方法灵敏度高,特异性好,为建立诺如病毒其他基因型的RT-LAMP检测方法奠定了基础。
- 赵剑虹张登城高艳焦洋张士尧李书明
- 北京市朝阳区1例输入性SARS-CoV-2全基因组序列分析被引量:1
- 2020年
- 北京市朝阳区在连续40d没有新增本土COVID-19确诊病例的情况下,出现了1例潜伏期超过14d的境外回国COVID-19确诊病例。为分析北京市朝阳区1例COVID-19患者是否为输入病例,进行了全基因组序列测定和遗传特性分析,本研究采用高通量测序技术配合Ion Torrent系列仪器和试剂对患者咽拭子中的SARS-CoV-2进行测序,同时应用对应插件或软件分析其全基因组同源性和变异情况。结果显示,该病例标本中测得1株SARS-CoV-2毒株,共29 876 bp,BLAST结果显示与其他国家和地区分离株的相似性高于与中国分离株的相似性。系统进化树中该毒株与2003年感染人的SARS冠状病毒和蝙蝠中分离的SARS冠状病毒明显不同,分处不同进化分支;该毒株与中国分离株分处不同的簇,而和美国分离株聚集在一簇。另外,突变分析显示存在3个改变氨基酸性质的非同义突变。本研究提示,该病例为美国输入的SARS-CoV-2感染病例,应注意境外输入性COVID-19的传播,并适当延长隔离观察期限;该毒株在患者的1例关联病例中发生了部分核苷酸突变,对SARS-CoV-2的致病力等的影响有待进一步研究。
- 韩桃利王海滨焦洋雷娜高艳赵剑虹田甜董歧段杉孙灵利
- 关键词:高通量测序输入病例
- 酶底物法与过滤培养法检测非饮用水中嗜肺军团菌的比较被引量:5
- 2020年
- 水体中嗜肺军团菌可引起军团菌病。酶底物法定量检测水体中嗜肺军团菌是一种新方法。文中应用酶底物法与过滤培养法检测非饮用水中嗜肺军团菌,使用SPSS软件进行统计分析。两种方法灵敏度分别为89.29%(25/28)和64.29%(18/28)。定性结果经McNemar检验,差异无统计学意义(P=0.092),定量结果具有相关性(皮尔逊相关系数为0.718,P=0.000)。结果显示,酶底物法和过滤培养法对非饮用水中嗜肺军团菌的检出结果具有一致性。酶底物法灵敏度更高,操作流程简单,具有很好的应用前景。
- 高艳李啸段杉刘丹顾琳赵剑虹孙灵利
- 关键词:酶底物法嗜肺军团菌非饮用水
- 北京市朝阳区腹泻人群沙门菌基因组特征分析
- 2024年
- 目的 用全基因组测序技术分析2021年北京市朝阳区人源39株沙门菌血清型、耐药基因和毒力基因携带情况。方法 应用常规检测法,对2021年北京市朝阳区疾病预防控制中心微生物检验科检出的39株沙门菌进行血清分型和药敏实验;同时对分离菌株进行全基因组测序,应用SeqSero、CARD和VFDB数据库分别进行血清型、耐药性和毒力基因携带情况的预测,对常规检测法和全基因组序列分析法得到的血清型数据进行比较;分析耐药基因和毒力基因的携带情况。结果 2021年北京市朝阳区腹泻患者粪便中检出的沙门菌血清型主要为肠炎沙门(51.28%)和鼠伤寒沙门菌i相变种(17.95%);39株沙门菌共检测到10类44种耐药基因,多重耐药外排泵蛋白抗性基因MdtK和多重耐药调控基因SdiA携带率100%;VFDB数据库毒力因子预测共发现120种3867个毒力因子。20株肠炎沙门菌中检出的毒力因子种类、数目高于其他血清型沙门菌。结论 全基因组测序有助于沙门菌罕见血清型的鉴定。2021年北京市朝阳区沙门菌多重耐药情况严重,携带的耐药基因和毒力因子种类多且复杂,在疾病防控工作中需要持续监测。
- 黄平高艳刘丹赵剑虹
- 关键词:全基因组测序沙门菌耐药基因毒力基因
- 北京市朝阳区2011-2017年5岁以下腹泻患儿星状病毒感染的分子流行病学特征被引量:6
- 2019年
- 目的分析北京市朝阳区5岁以下儿童腹泻患者星状病毒感染的分子流行病学特征,为该地区制定相应的疾病防控策略提供依据。方法收集2011-2017年北京市朝阳区首都儿科研究所送检的1 451份5岁以下婴幼儿腹泻粪便监测样本和流行病学信息,利用逆转录-聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)进行星状病毒核酸检测,对阳性PCR产物测序并进行系统进化分析。结果星状病毒检出的阳性率为4.76%(69/1 451)。对69份星状病毒阳性标本进行测序,获得36株序列。入托前(3岁以下)年龄段所检出的星状病毒占全部检出病毒株的80.56%(29/36)。系统进化分析结果显示,31株(86.11%,31/36)为经典的HAstV-1型星状病毒,同时检测到3株HAstV-4型星状病毒,2株HAstV-5型星状病毒,其他型未检出。HAstV-1型呈现典型的冬春季流行特点,HAstV-4和5型只在夏季和/或冬季检出。结论星状病毒是北京市朝阳区5岁以下儿童腹泻的重要病原体之一,主要感染3岁以下儿童;HAstV-1型是流行优势株,且不同基因型具有不同的季节流行特点。
- 焦洋孙灵利高艳齐啸张士尧顾琳张玉松赵剑虹张越马建新赵伟
- 关键词:星状病毒病毒性腹泻分子流行病学
- 北京发现ST4821克隆群B群脑膜炎奈瑟菌被引量:11
- 2014年
- 目的对2013年1月北京市1例流行性脑脊髓膜炎(流脑)死亡病例标本进行脑膜炎奈瑟菌检测,了解感染病原及分离菌株的分子流行病学特征。方法对患者脑脊液标本进行细菌分离培养,通过常规细菌学试验对分离菌株进行脑膜炎奈瑟菌鉴定、实时荧光定量-聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative PCR)方法检测患者脑脊液和抗凝血中脑膜炎奈瑟菌核酸,同时对鉴定的菌株进行多位点序列分型(MLST)分析、外膜蛋白PorA分型和FetA分型,以及体外药物敏感试验。结果从患者脑脊液和抗凝血标本中均检测到脑膜炎奈瑟菌种特异基因ctrA和血清群B特异基因siaD。从患者脑脊液中分离到1株可疑阳性菌,经实验确诊为B群脑膜炎奈瑟菌。PorA为P1.20,23-9,FetA为F1-91;多位点序列分型分析显示基因型为ST10051,属于ST4821序列群。该菌株对复方新诺明为中等耐药,对环丙沙星和四环素耐药,对青霉素、头孢噻肟、头孢曲松、左氧氟沙星、美罗培南、氯霉素、利福平等药物均敏感。从密切接触者咽拭子中未分离到脑膜炎奈瑟菌。结论该菌株经鉴定为B:P1.20,23-9:F1-91:ST10051(ST4821序列群)。北京地区人群中已经存在高致病性ST4821克隆群B群脑膜炎奈瑟菌,并引发死亡病例,提示应全面掌握本地区脑膜炎奈瑟菌健康人群携带情况及病例菌株分子流行病学资料,为流脑的预防控制提供实验室数据支撑。
- 董梅赵剑虹王恒伟曾阳黄芳吴疆
- 关键词:流行性脑脊髓膜炎死亡病例
- 北京市2007-2014年O1群霍乱弧菌病原学特征分析被引量:10
- 2016年
- 目的分析北京市2007-2014年分离到的O1群霍乱弧菌的病原学特征。方法对霍乱感染者、水产品和外环境来源的O1群霍乱弧菌,采用血清分型、荧光定量PCR检测霍乱毒素基因ctxAB、K-B法8种药物(多西环素、环丙沙星、诺氟沙星、复方新诺明、丁胺卡那霉素、庆大霉素、头孢曲松和呋喃妥因)进行敏感性试验和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型方法,研究不同来源菌株在各方面的异同。结果北京市2007-2014年共分离得到不同来源O1群霍乱弧菌125株(感染者75株,水产品37株,外环境涂抹13株),小川型96株,稻叶型29株。其中16株菌ctxAB基因阳性(感染者5株,水产品9株,外环境涂抹2株),其他ctxAB基因阴性(感染者70株,水产品28株,外环境涂抹11株);小川型ctxAB基因阴性霍乱弧菌占70.40%(88/125);125株菌对庆大霉素、头孢曲松和呋喃妥因完全敏感,其中25株菌(感染者10株,水产品11株,外环境4株)对5种抗菌药物出现7种耐药型别,有6株来自感染者和水产品的菌株产生双重或三重耐药,而4株外环境的耐药菌株均为单一耐药。PFGE分子分型结果显示,125株菌株经NotⅠ酶切后可分为91种型别,7起聚集性疫情中分离到的37株菌全部为小川型,可分为6个聚类,29株稻叶型菌株可分为3个聚类。结论北京市2007-2014年O1群霍乱弧菌病原学特征复杂多样,在产毒株引起霍乱弧菌疫情减少的情况下,应关注非产毒霍乱弧菌导致的疫情。
- 黄瑛赵剑虹严寒秋曲梅张新吕冰梁志超阚飙陈丽娟王全意
- 关键词:霍乱弧菌药物敏感试验毒力基因脉冲场凝胶电泳
- 北京市朝阳区2012-2015年柯萨奇A2型肠道病毒的基因特征分析被引量:1
- 2019年
- 目的了解北京市朝阳区手足口病相关柯萨奇A2型肠道病毒(coxsackievirus A2,CV-A2)的基因特征。方法采用5′端非编码区(5′UTR)和VP2基因测序的方法鉴定CV-A2病毒;对所有CV-A2病毒进行VP1全序列测序,对部分毒株进行编码蛋白全序列测序,并将测得的序列与NCBI数据库中国内外的序列进行比对,构建系统进化树,进行基因特征及分子流行病学分析。结果 2012-2015年本地区共计检出6株CV-A2病毒。基于VP1分型,6条本研究的序列分别为D1亚型(5条)和D2亚型(1条)。6条VP1序列的核苷酸一致性为93.4%~98.5%,与原型株Fleetwood (基因库编号:AY421760)的核苷酸一致性为80.5%~81.6%。与国外VP1氨基酸序列比对显示有6个主要变异位点。在编码蛋白序列的P2和P3区发现与CV-A16、CV-A4和CV-A14型肠道病毒有基因重组。结论 2012-2015年北京市朝阳区CV-A2病毒有2种基因亚型,以D1亚型为主。本地区的CV-A2病毒发生了亚型转换和基因重组,应加强CV-A2病毒的持续监测和基因特征分析。
- 祖伟王海滨刘倩雷娜仲一赵剑虹孙灵利
- 关键词:基因特征
- 2017年—2020年北京市朝阳区健康人群携带脑膜炎奈瑟菌分子特征分析
- 2023年
- 目的 对北京市朝阳区健康人群携带的脑膜炎奈瑟菌进行血清基因型和多位点序列分型研究,了解菌群病原学特征。方法 收集2017年—2020年北京市朝阳区健康人群咽拭子标本中分离的21株脑膜炎奈瑟菌,进行生化鉴定和种特异性基因复核,并采用real-time PCR方法进行血清基因分群,采用多位点序列分型方法对菌株进行分子分型,使用MEGA5.1软件构建系统进化树,分析分离株与全球高致病性克隆群的关系。结果 经鉴定21株菌均为脑膜炎奈瑟菌,血清群结果为B群11株,X群3株,不可分群7株。21株脑膜炎奈瑟菌共有16种序列型,其中14株属于4个已定义的克隆群,cc4821 (8株)、cc5(2株)、cc198(2株)、cc175 (2株),7株为无序列群,分别是ST-7962(2株)、ST-5586(3株)、ST-5613(1株)、ST-5863(1株)。基于管家基因序列的系统发生树,结果表明分离株ST型别多样化,存在全球高致病性克隆群cc4821和cc5,以B群cc4821为优势克隆。划为无序列群的2株B群的ST-7962分离株与cc4821关系较近,可能与B群分离株ST-4897(cc4821)存在局部进化。结论 2017年—2020年北京市朝阳区健康人群分离的脑膜炎奈瑟菌主要为B群,各年散在分布,且存在高致病性克隆,需加强关注脑膜炎奈瑟菌的菌群变迁,及早发现疫情,对公众的健康潜在危害应予以关注,并为免疫政策提供参考。
- 刘丹段杉高艳赵剑虹
- 关键词:脑膜炎奈瑟菌多位点序列分型血清群