黄海泉
- 作品数：114 被引量：254H指数：8
- 供职机构：西南林业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金云南省教育厅科学研究基金云南省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学建筑科学轻工技术与工程更多>>
- 濒危植物峨眉凤仙花叶绿体基因组分析被引量：3
- 2023年
- [目的]对峨眉凤仙花(Impatiens omeiana Hook.f.)叶绿体基因组的结构特征及系统发育进行研究,为其资源保护及开发利用提供理论依据。[方法]基于峨眉凤仙花叶绿体基因组序列,利用生物信息学软件,对叶绿体基因组进行组装、注释、基因特征、序列重复和系统发育分析。[结果]峨眉凤仙花完整的叶绿体基因组长度为152 527bp,共有130个基因,包括86个蛋白质编码基因、8个rRNA基因和36个tRNA基因,GC含量为37%,且具有保守的四分体结构,包括大单拷贝区、小单拷贝区各1个和2个相同的反向重复区域,其长度分别为83 150、17 903、25 737 bp,其中13个基因有1个内含子,2个基因有2个内含子。特征分析表明:峨眉凤仙花叶绿体全基因组中共检测到76个SSR序列,且多以A/T单核苷酸序列为主,其长度为10-91 bp;检测到50 842个密码子,其中以亮氨酸(Leu)最多,色氨酸(Tyr)最少;密码子偏好性分析显示33个RSCU≥1的密码子多数以A/U结尾。通过邻接法(NJ)构建系统发育树发现,峨眉凤仙花与贵州凤仙花亲缘关系最近,均属于棒凤仙花亚属植物。[结论]峨眉凤仙花叶绿体基因组呈典型的四分体结构,SSR序列以A/T单碱基为主;系统发育分析结果将其归为棒凤仙花亚属,上述结果为峨眉凤仙花系统发育学地位及物种鉴定工作提供了重要的分子信息。
- 赵秋燕曹孟会李新艺周敏魏春梅张茜瞿素萍黄海泉黄美娟
- 关键词：叶绿体基因组系统发育
- 滇水金凤花距发育相关基因TCP4的克隆及表达分析
- 2023年
- 为探究滇水金凤(Impatiens uliginosa)TCP4基因(IuTCP4)对花距发育的调控作用,通过反转录聚合酶链反应技术克隆其cDNA全长,对其序列进行生物信息学分析,并采用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescent quantitative polymerase chain reaction, qRT-PCR)技术探讨IuTCP4基因在花距的不同发育阶段及不同组织部位的时空表达模式。结果表明:滇水金凤IuTCP4基因2个拷贝(IuTCP4.1和IuTCP4.2)的cDNA全长分别为1 194、1 173 bp,各编码397个和390个氨基酸,且均不包含内含子;IuTCP4.1和IuTCP4.2所编码的蛋白均为不稳定的亲水性蛋白,且均不存在信号肽和跨膜结构域,两者与茶(Camellia sinensis)、苦瓜(Momordica charantia)等15个物种TCP4蛋白的同源性达到66.11%。在系统发育树中这2个拷贝聚为一支,推测它们为旁系同源基因。qRT-PCR结果显示:IuTCP4.1在初期、开花期的花距和檐部存在差异性表达,且在初期的檐部表达量最高;IuTCP4.2在3个发育时期的花距和檐部均存在差异性表达,且在初期的花距中表达量最高。综上所述,IuTCP4基因在花距发育过程中具有一定的调控作用,且主要在花距发育初期发挥作用。上述结果为凤仙花花距发育机制、花形改良和新品种培育提供了一定的理论依据。
- 李洋李凡孟丹晨李林菊魏春梅黄美娟黄海泉
- 关键词：基因克隆
- 滇水金凤花距发育相关基因TIP的克隆及表达分析被引量：2
- 2022年
- 本文通过对滇水金凤(Impatiens uliginosa)花距发育相关基因TIP的克隆与表达分析,探讨其对滇水金凤花距发育的分子机理。本研究运用RT-PCR技术成功克隆了滇水金凤花距发育相关基因TIP的3个片段,其cDNA全长为777、762和750 bp,分别编码258、253和249 aa,命名为IuTIP1-1、IuTIP1-2和IuTIP2-1,其蛋白均具有MIP(major intrinsic protein)超家族典型的2个NPA(Asn-Pro-A1a)保守结构域。同源性分析表明,滇水金凤TIP基因的氨基酸序列与雷蒙德氏棉(XP_012440576.1)、橡胶树(XP_021686336.1)同源性达77.95%左右;系统进化分析表明,IuTIP1-1与IuTIP1-2聚为一大支,IuTIP2-1单独成一支,三者为旁系同源关系。q RTPCR分析表明,3个基因在滇水金凤花距发育的3个时期及2个不同部位均有表达,其中IuTIP1-1在花苞期檐部的表达量最高,其次是IuTIP2-1在盛花期檐部表达量最高,随着花距的发育,两者在花距距部的表达逐渐下调;而IuTIP1-2在花距檐部的表达随花距发育逐渐下调,但在花距距部的表达逐渐上升,盛花期达到最高,可能与IuTIP1-2对花距距部发育起主要作用有关。根据以上结果,推测滇水金凤的3个TIP基因为旁系同源关系,IuTIP1-1和IuTIP2-1对花距檐部发育起主要作用,而IuTIP1-2对花距距部发育起主要作用。
- 魏春梅李洋孟丹晨李泽凤李新艺黄美娟黄海泉
- 关键词：基因克隆
- 绿萼凤仙花MYB4的克隆及表达分析被引量：1
- 2023年
- MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)是调控植物木质素合成的转录因子之一。为探讨绿萼凤仙花木质素合成调控的分子机制,本试验克隆了绿萼凤仙花MYB4基因,对其进行生物信息学分析,并利用qRT-PCR技术分析其表达模式。结果表明:(1)成功克隆到绿萼凤仙花MYB4基因的3个片段,其cDNA全长分别为666、888、771 bp,编码221、295、256 aa,命名为IcMYB4-1、IcMYB4-2和IcMYB4-3。(2)3个IcMYB4基因都含有MYB家族的DNA结合结构域(R2和R3)以及抑制型的保守基序EAR,其氨基酸序列与其他物种具有较高的相似性,同源性达62%左右。IcMYB4-1和IcMYB4-2氨基酸处于一个分支,推测其为直系同源关系;IcMYB4-3与前两者分属两个分支,推测其为旁系同源关系。(3)qRT-PCR结果表明,3个IcMYB4基因在绿萼凤仙花的不同部位均有表达,其中IcMYB4-1在绿萼凤仙花不同部位的表达均为最低,以根部表达量最高;IcMYB4-2和IcMYB4-3基因在绿萼凤仙花的根、茎和叶中的表达量依次升高,推测其对绿萼凤仙花木质素合成起负调控作用。综上所述,IcMYB4基因在绿萼凤仙花不同部位的作用机理存在一定差异,但均在绿萼凤仙花的木质素合成调控中发挥了重要作用。该结果为增加凤仙花的木质化程度以及品种改良提供了基础数据。
- 李泽凤向南星魏春梅李新艺孟丹晨黄海泉黄美娟
- 关键词：木质素基因克隆
- 烟草胞质雄性不育性与花蕾组织内源激素的平衡关系被引量：16
- 2006年
- 对烟草雄性不育系和相应的保持系花蕾内源激素含量比值进行了分析。结果表明:从小花蕾、中花蕾至大花蕾,不育系各发育时期花蕾的IAA/ABA、GA3/ABA、ZT/ABA值均高于相应的保持系,且不育系花蕾中的IAA/ABA、GA3/ABA、ZT/ABA比值变化起伏较大,而各保持系花蕾中的IAA/ABA、GA3/ABA、ZT/ABA比值变化则比较平稳,说明不育系花蕾中几种内源激素的平衡关系出现了异常,这可能与雄性不育有关。
- 刘齐元刘飞虎黄海泉何宽信朱肖文
- 关键词：烟草雄性不育花蕾内源激素
- 东方百合‘Seberia’AGAMOUS同源基因的克隆及表达分析
- 2021年
- 为了解决东方百合花型单一、花粉量大、污染花瓣影响美观以及引起部分人群花粉过敏等问题,本研究以东方百合‘Siberia’为材料,提取其雌蕊总RNA,通过RT-PCR方法克隆得到2个cDNA片段,其全长分别为795 bp和678 bp,分别编码264 aa和225 aa,GC含量分别为46.7%和43.2%,这两个基因片段与其他百合属AG基因同源性分别在85%和70%以上,且发现两个蛋白均属于碱性不稳定疏水蛋白。此外,2个基因均具有保守的MADS-box区、K区及典型的AGⅠ和AGⅡ区,进一步说明2个基因均属于MADS-box基因家族的AG基因(即C类基因)。通过基因表达分析再次证明上述两个基因仅在花的雄蕊及雌蕊中表达,并完全符合经典的花发育ABC模型理论。这2个AG基因在同一部位的不同发育阶段的表达特性存在显著差异,即存在一定的时空表达差异性。本研究结果为后期百合花发育、遗传转化及无花粉百合新品种培育等研究提供了一定的基础数据和科学依据。
- 黄武略李洋王博罗超李新艺黄美娟黄海泉
- 关键词：基因克隆
- 阴沟肠杆菌ACC脱氨酶基因的克隆和载体构建
- 2005年
- 黄海泉刘飞虎刘齐元黄美娟
- 关键词：阴沟肠杆菌ACC脱氨酶基因克隆乙烯
- 观赏植物育种研究进展被引量：6
- 2007年
- 育种一直是丰富园林观赏植物种质资源的重要手段。作者综述了植物的常规育种方法和生物技术育种方法,并重点阐述了基因育种现状及发展趋势,分析了我国的育种现状和战略。
- 赵丽荣吴迪林萍黄海泉吴亮何铃
- 关键词：观赏植物常规育种生物技术育种基因育种
- 川西凤仙花属植物资源调查与评价
- 2024年
- 以20种川西凤仙花属植物为试材,采用实地调查和AHP层次分析法,研究了凤仙花属植物形态特征与资源评价对凤仙花属植物开发利用和分类学的影响,以期为四川凤仙花属植物研究提供参考依据。结果表明:川西南地区凤仙花属植物种类多于川西北地区,其主要分布于海拔1000~2000 m,占总数的70%;花色丰富,有黄色、红色、白色等颜色,以黄色为主,占总数的40%;叶片形状有卵形、长卵形和椭圆形等,叶长5.75~18.30 cm,叶宽1.69~5.91 cm,叶片面积3.85~38.32 cm^(2);种子长2.24~3.93 mm,宽1.18~2.46 mm,千粒质量1.02~4.41 g。此外,采用AHP层次分析法对其进行了综合评价,发现Ⅰ级(>3.5)资源有6种,可直接开发并加以应用;Ⅱ级(3.0~3.5)资源有10种,可驯化后予以开发;Ⅲ级(<3.0)资源有4种,可作为杂交亲本等予以开发。综上所述,川西地区凤仙花属植物资源丰富,并具有较高观赏价值和开发利用价值。
- 潘俊桥张茜石万磊黄海泉黄美娟
- 关键词：AHP层次分析法资源评价
- 滇水金凤CHI基因的克隆及表达分析被引量：2
- 2020年
- 【目的】查尔酮异构酶(chalcone isomerase,CHI)是花青素合成途径中的关键酶之一。通过克隆滇水金凤(Impatiens uliginosa)CHI基因并对其进行表达分析,进而探究滇水金凤花色形成及变异机理,为凤仙花花色改良及新品种培育奠定了一定的基础。【方法】利用RT-PCR和RACE技术进行基因克隆,利用DNAMAN和MEGA-X软件对所克隆基因的蛋白序列进行同源性分析和系统进化分析,利用qRT-PCR分析CHI基因的表达模式。【结果】克隆得到滇水金凤CHI基因的2个片段,命名为IuCHI1和IuCHI2,其cDNA全长序列分别为741 bp和636 bp。同源性分析表明,滇水金凤CHI基因的氨基酸序列与茶(ASU87415.1)、橄榄(AEO36936.1)等12个物种的序列同源性达到55.99%。系统进化分析表明,滇水金凤CHI1和CHI2均单独成一枝。表达分析表明,在红色滇水金凤中,2个CHI基因在4个花发育时期的表达量均呈逐渐上升趋势,而在白色滇水金凤中的表达量在第3时期最高,在其它几个时期则相对较少。【结论】推测滇水金凤的2个CHI基因为旁系亲缘关系,其在白色花和红色花的4个花发育时期的表达模式显示出一致性。
- 李洋黄武略林福永罗超李新艺刘应丽朱佳鹏冯志熙黄美娟黄海泉
- 关键词：基因克隆
