黄建东
- 作品数：25 被引量：37H指数：3
- 供职机构：中国科学院深圳先进技术研究院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金深圳市科技计划项目中国博士后科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生理学农业科学更多>>
- 合成微生物群落的构建与应用被引量：12
- 2021年
- 自然界中微生物群落的生态网络结构非常复杂,并且难以进行可重复、可控的扰动实验.在实验室里通过“自下而上”的方式构建起来的合成群落具有适中的复杂度和较高的可控性,可以作为数学模型和复杂生态系统研究之间的桥梁.合成微生物群落的研究方法遵循“设计-构建-测试-学习”为核心的合成生物学理念,以人工设计和构建的群落为实验对象,结合定量模型和基因组测序等组学技术,探索微生物生态学的基本规律.在应用方面,基于合成群落的研究对于如何控制和改造复杂的微生物生态系统具有重要的指导意义,目标是通过构建具有可控功能和稳定性的微生物群落来解决人体健康、农业和工业生产、环境治理等重要问题.
- 陈沫先韦中田亮谭扬黄建东黄建东
- 关键词：数学模型高通量测序相互作用
- 自动化合成生物技术与工程化设施平台被引量：13
- 2021年
- 合成生物学采用工程化设计理念,对生物体进行有目标的设计、改造,甚至从头合成具有特定功能的“人造生命”,用于探索生命活动规律和进行生物技术创新.由于生命系统高度复杂,人工设计的合成生命体很难完全按照预期工作,往往需要长时间的反复调谐.目前,“试错”过程主要依靠研究者手动完成,存在通量低、重复性差、迭代慢等局限.针对这一难题,自动化合成生物技术通过低成本、多循环地完成海量工程试错性实验,提高研究通量和效率,大幅增加实验设计的复杂度和系统性,从而快速实现特定功能,揭示人工生命体的设计原理.近年来,在合成生物学“设计-构建-测试-学习”的各个研究环节,自动化技术正在以前所未有的速度加速发展.与此对应,在全球范围内已建成或在建多个大型工程化平台,用于支撑相关研究和应用.本文旨在对自动合成生物技术的关键要素进行总结,并对合成生物研究基础设施的发展情况和未来方向进行讨论.
- 唐婷付立豪郭二鹏张振坤王子宁马辰飞张智彧张建志黄建东司同
- 关键词：合成生物学高通量
- 代谢工程改造酿酒酵母底盘细胞被引量：6
- 2021年
- 酿酒酵母是合成多种天然产物的微生物细胞工厂,合理利用酿酒酵母底盘细胞内源的代谢途径可生产高附加值的生物医药、食品保健和精细化学品类产物.如何精细调控和优化酿酒酵母胞内代谢流是实现目标化学物高产量、高产率和高转化的关键问题.乙酰辅酶A是中心代谢和天然产物合成的基本前体,精细调控乙酰辅酶A的合成是实现目标化合物高产的重要策略;改造酿酒酵母的甲羟戊酸途径,引入外源途径酶,表达萜类合成酶生产不同种类的萜类化合物;优化脂肪酸合成途径合成特定链长的脂肪酸及脂肪酸衍生物.本文总结了强化酿酒酵母中乙酰辅酶A积累的代谢工程策略,重构甲羟戊酸途径、脂肪酸途径从头合成天然萜类化合物和脂肪酸衍生物的研究进展,为利用酿酒酵母底盘细胞生产天然产物的相关研究提供代谢工程改造策略.
- 张云丰何丹卢欢黄建东罗小舟
- 关键词：酿酒酵母合成生物学乙酰辅酶A萜类脂肪酸
- 一种用于免疫接种的组合物及其制备方法
- 本发明公开了一种用于免疫接种的组合物及其制备方法，所述组合物包括至少两种多肽，每种多肽均不相同，且均为用于免疫接种各种肺炎克雷伯菌的外膜多肽；其中，所述多肽包括第一多肽、第二多肽、第三多肽、第四多肽、第五多肽以及第六多肽...
- 张宝中黄建东胡丹玉窦颖胡景初
- 文献传递
- 工程菌在肿瘤治疗方面的应用进展被引量：1
- 2023年
- 肿瘤的细菌治疗最早可以追溯到19世纪,人们第一次利用链球菌(Streptococcus pyogenes)成功治疗了患有无法手术切除的肉瘤患者。此后,细菌在肿瘤治疗上的研究越来越多,并取得了令人期待的结果。与其他肿瘤治疗方法相比,细菌治疗肿瘤具有许多独特的优点。随着合成生物学的发展,人们对细菌进行改造后大大增强了其在肿瘤治疗中的运用。本文介绍了细菌改造策略和应用进展,特别是鼠伤寒沙门氏菌治疗肿瘤的研究。在动物模型中,工程菌可以选择性定植到肿瘤组织中并抑制肿瘤的生长。此外,介绍了工程菌治疗肿瘤的新策略——表达抗肿瘤分子来提高肿瘤治疗的效果。最后,讨论了工程菌治疗肿瘤运用于临床还有一些需要解决的问题,如何平衡细菌毒力和抗肿瘤能力是一个关键点,需要设计更精巧的基因线路来对细菌进行改造。在减弱细菌毒力的同时,还要增强细菌靶向到肿瘤组织的能力,以减少对其他正常组织的影响。细菌的遗传不稳定性也是一个潜在的问题,因为突变可能会产生无效或有害的表型。但是,随着合成生物学的发展,在不久的将来,上述问题将会得到解决,细菌治疗将会是一种具有巨大潜力的肿瘤治疗的方法。
- 陈家文黄建东黄建东
- 关键词：工程菌肿瘤
- KIF5B过表达和干扰慢病毒载体的构建及对结直肠癌细胞增殖的影响
- 2021年
- 目的构建马达蛋白KIF5B基因重组慢病毒过表达和RNA干扰载体并进一步构建稳定转染结直肠癌细胞模型,检测敲低KIF5B蛋白对结直肠癌细胞增殖的影响。方法将PCR扩增的人KIF5B基因序列和设计合成的shRNA序列分别插入GV-358和GV-248表达载体。采用慢病毒三质粒包装系统共转染HEK293T细胞,进行病毒包装和扩增。重组慢病毒感染结直肠癌细胞,荧光显微镜观察绿色荧光强度,Western blot法检测KIF5B过表达和沉默效率。CCK-8检测KIF5B干扰后HCT116和SW480细胞的增殖,并检测细胞内周期相关蛋白的表达。结果KIF5B过表达及shRNA载体测序与原设计序列完全符合。重组病毒感染结直肠癌细胞中,可见绿色荧光蛋白表达。KIF5B过表达组细胞中KIF5B-FLAG蛋白大量表达,KIF5B沉默细胞中,KIF5B的蛋白表达量显著下降。KIF5B被敲低后,HCT116和SW480细胞增殖加快,细胞内p21、p16两种蛋白表达下调。结论成功建立了KIF5B过表达和沉默的结直肠癌细胞模型,并且发现KIF5B表达被干扰后,可能会抑制p21与p16蛋白的表达,加速细胞周期,从而促进结直肠癌细胞增殖。
- 霍达刘晶晶范国庆曾律滔刘媛媛蔡剑平黄建东崔菊
- 关键词：结直肠癌细胞增殖
- OprJ-N-M融合基因及其融合蛋白、融合蛋白制备方法以及用途
- 本申请涉及生物技术领域，本申请提供一种OprJ‑N‑M融合基因及其融合蛋白、融合蛋白制备方法以及用途，该OprJ‑N‑M融合基因的碱基序列如SEQ ID NO:1所示。通过动物实验验证，由该OprJ‑N‑M融合基因表达的...
- 黄建东张宝中李文君
- 文献传递
- 一种靶向治疗用人工趋磁细菌及其构建方法和应用
- 本发明公开了一种靶向治疗用人工趋磁细菌及其构建方法和应用，所述人工趋磁细菌内包含能够在细菌表面表达出定位蛋白的基因结构，以及密度感应元件控制的治疗基因表达序列，所述细菌表面表达有所述定位蛋白，所述定位蛋白通过生物亲和作用...
- 刘陈立赖旺生沈玥黄建东
- 文献传递
- 合成生物学在活体功能材料构建上的应用被引量：3
- 2021年
- 材料是人类赖以生存与发展的物质基础,代表了一个时代科学技术成果的最前沿.近年来飞速发展的合成生物学,通过改进现有系统或构建全新的生物体系,极大地促进了对生物本身的了解,拓宽了生命科学的应用范围.将构建的生物体系进一步结合材料科学中的设计工具及方法,便诞生了活体功能材料这一概念及领域.与传统材料不同,活体功能材料以活体细胞为结构单体组装材料,活体细胞本身成为材料的工程化设计工具以及技术设想和实现途径的基本单元.将编程后的工程活细胞组装、裁剪成具有生物系统特性的活体功能材料,将活体细胞的自我修复能力等特性融入材料,进一步拓展了原有材料的性能.本文将着重介绍活体功能材料的产生、发展及近年来取得的相关成果,在此基础上对活体功能材料未来的发展进行展望.
- 张曦李鹏程黄建东戴卓君
- 关键词：合成生物学生物材料
- 以非天然核酸为遗传物质的人工生命构建被引量：1
- 2021年
- 合成生物学/工程生物学通过设计、搭建生物部件甚至生物系统来构建具有新功能的人工生命.其研究内容主要分为3个层次:(1)将现有的天然生物模块进行设计和组装,构建不同于天然存在的调控网络,从而实现新功能;(2)通过人工基因组DNA的全合成进行新生命的构建;(3)通过化学合成部件(修饰核酸、蛋白质、脂类等)创建全新的生物系统乃至生命体.第3个层次的研究也称为化学合成生物学,本文主要集中讨论化学合成生物学中将非天然核酸替代DNA作为遗传物质从而构建人工生命的研究,简要介绍了非天然核酸化学修饰对其遗传物质功能的影响,及以其为基础的人工生命构建的研究现状.这将为我们探讨生命起源、进化甚至外星生命等问题提供新的思路.
- 白艳芬聂朋熊成鹤温骏林甘海云马晴胡政李雪飞于涛黄建东梅辉
- 关键词：合成生物学人工生命
