张利达
- 作品数：41 被引量：128H指数：6
- 供职机构：上海交通大学农业与生物学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市自然科学基金上海市基础研究重大（重点）项目更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学生物学轻工技术与工程更多>>
- 构建植物蛋白质互作网络的方法
- 一种构建植物蛋白质互作网络的方法，该方法将蛋白质结构与非结构特征相结合，利用随机森林算法训练蛋白质互作模型，并用训练后的蛋白质互作分类器对植物蛋白质相互作用关系进行预测，而后构建植物蛋白质相互作用关系网络。与现有方法相比...
- 张利达刘诗薇刘奕慧
- 文献传递
- 盐胁迫下两个甜瓜品种转录因子的转录组分析被引量：26
- 2014年
- 利用新一代高通量测序手段——转录组测序(RNA-Seq)技术研究在300 mmol·L-1 NaCl胁迫下两个甜瓜(Cucumis melo L.)品种‘玉露’和‘冰雪脆’的转录因子基因表达变化。这两个甜瓜品种在叶绿素荧光参数上的差异表明其在盐胁迫下有不同的生理反应。转录组测序结果表明,盐胁迫与对照相比,‘玉露’共有属于19个转录因子家族的56个转录因子基因表达发生变化(在转录水平,属于7个转录因子家族的22个转录因子上调表达,属于14个转录因子家族的34个转录因子下调表达)。‘冰雪脆’有属于20个转录因子家族的47个转录因子基因表达发生变化(在转录水平上,属于5个转录因子家族的17个转录因子上调表达,属于17个转录因子家族的30个转录因子下调表达)。盐胁迫下,两个甜瓜品种差异表达的转录因子既表现特异性,也存在部分重叠。‘玉露’有29个转录因子特异响应,‘冰雪脆’有20个特异响应。盐胁迫响应重叠的转录因子有27个,其中9个上调表达,18个下调表达。采用实时荧光定量PCR对几个转录因子进行了盐胁迫下的表达检测,其趋势与转录组分析结果基本一致。
- 陈嘉贝张芙蓉黄丹枫张利达张屹东
- 关键词：甜瓜盐胁迫高通量测序转录因子
- 植物抗旱基因模块发掘方法
- 一种植物抗旱基因模块发掘方法，该方法基于基因相互作用网络，采用马尔可夫聚类算法对基因互作网络进行模块化分析，并利用基因芯片与全基因组关联数据对基因模块的抗旱作用大小进行评估。根据各个基因模块的抗旱贡献大小，筛选关键抗旱基...
- 张利达刘奕慧刘诗薇
- 文献传递
- 转CHI基因提高青蒿中青蒿素含量的方法
- 本发明是一种生物技术领域的转CHI基因提高青蒿中青蒿素含量的方法。本发明从青蒿中克隆查尔酮异构酶CHI基因，构建含CHI基因的植物表达载体，用根癌农杆菌介导，将CHI基因转入青蒿并再生出植株，PCR检测外源目的基因CHI...
- 赵静雅王路尧张颖付雪晴张婷婷张利达钱虹妹唐克轩
- 文献传递
- 甘蓝型油菜细胞分裂原激活的蛋白激酶的激酶1蛋白编码序列
- 一种用于基因工程技术领域甘蓝型油菜细胞分裂原激活的蛋白激酶的激酶1蛋白编码序列。所分离出的DNA分子，该分子包括：编码具有甘蓝型油菜BnMKK1蛋白质活性的多肽的核苷酸序列，而且该核苷酸序列与SEQ ID NO.3中从核...
- 余舜武张利达唐东芹左开井唐克轩
- 文献传递
- 食品中沙门氏菌分子检测靶点的筛选与评价被引量：17
- 2008年
- 【目的】发掘新的沙门氏菌分子检测靶点,筛选检测性能优秀的引物。【方法】利用BLAST程序比较沙门氏菌属内基因组DNA序列的同源性以及沙门氏菌与非沙门氏菌基因组DNA序列之间的特异性,发掘出100多个检测沙门氏菌属的特异性片段,并从中随机挑选出15个片段作为候选靶点,一共设计了27对引物(FS1～FS27),对它们的特异性、灵敏度加以评价,从中筛选检测性能最好的引物。【结果】在27对引物中,检测性能最优的引物为FS23,采用该引物对供试菌株的相应检测靶点进行PCR扩增,44株沙门氏菌都能扩增到一条492bp特异性片段,而22株非沙门氏菌则不能扩增出这一特异性片段。以FS23为引物建立PCR方法检测猪霍乱沙门氏菌基因组DNA的灵敏度为11.9fg/μL,细菌纯培养物灵敏度为4.9×102cfu/mL;用猪霍乱沙门氏菌人工污染牛奶样品,如果接种起始菌量为100cfu/25mL时,只需要增菌5h,采用上述方法即能检测出沙门氏菌。【结论】引物FS23对应的基因序列是一个性能优良的新分子检测靶点,具备很高的特异性和灵敏性,能够广泛应用于食品中沙门氏菌的快速检测。
- 向雪菲刘斌张利达史贤明
- 关键词：沙门氏菌PCR靶点
- 甘蓝型油菜抗旱耐盐转录因子BnHB6蛋白编码序列
- 一种甘蓝型油菜抗旱耐盐转录因子BnHB6蛋白编码序列，属于基因工程领域。包括：编码具有甘蓝型油菜BnHB6蛋白质活性的多肽的核苷酸序列，而且所述的核苷酸序列与SEQ ID NO.3中从核苷酸第207－1142位的核苷酸序...
- 余舜武张利达左开井唐东芹唐克轩
- 文献传递
- 利用酶催化半合成紫杉醇的方法
- 一种利用酶催化半合成紫杉醇的方法属于分子生物工程与生物化学工程领域。紫杉醇的酶催化半合成以红豆杉中含量相对丰富的10去乙酰巴卡亭三为底物，对紫杉醇三环二萜骨架修饰过程中采用酶催化的方法，直接对10位和13位进行特异性酰化...
- 苗志奇唐克轩张利达
- 文献传递
- 楸树内生真菌抗癌性能研究被引量：7
- 2012年
- 在新抗癌药物筛选过程中获得一种具有明显抗癌能力的楸树内生真菌,命名为FSN002。采用形态学和分子生物学方法判断该内生真菌为短枝木霉。FSN002发酵产物能够有效抑制肝癌、肺癌等多种癌症细胞,同时对正常肝细胞几乎没有明显的细胞毒性。FSN002发酵产物的有效抗癌成分为一种次生代谢物小分子楸灵素,有望开发成一种拥有自主知识产权的高效低毒抗癌药物。
- 于湘莉赵静雅张利达苗志奇
- 关键词：内生真菌抗癌药物次生代谢物
- 植物EST-SSR标记开发及其应用被引量：51
- 2010年
- 随着生物科技的进步,大量的植物表达序列标签(expressed sequence tags,ESTs)已经成为开发SSR标记的重要资源。EST-SSR作为一种新型分子标记,其多态性可能与基因功能直接相关,而且在相近植物间具有良好通用性,使得EST-SSR标记在实际应用中更具价值。采用计算机方法大规模发掘EST-SSR多态性位点极大地提高了SSR标记开发效率。尤其随着新一代测序技术的成熟以及测序成本的急剧下降,利用新一代测序技术产生大量的转录组数据进行EST-SSR多态性标记的计算机大规模发掘将对SSR标记的开发带来深远影响。本文简要介绍了植物EST-SSR分布特点,并对EST-SSR标记开发现状以及相关应用作了综合评述,此外,还对EST-SSR标记的计算机开发新策略进行了展望。
- 张利达唐克轩
- 关键词：EST-SSRS
