燕清丽
- 作品数：72 被引量：133H指数：6
- 供职机构：淮安市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家质检总局科技计划项目国家科技重大专项淮安市科技计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学自动化与计算机技术生物学更多>>
- 用于同时检测刚果热病毒、库波热病毒1和2型三种病毒的核酸、试剂盒及方法
- 本发明涉及一组用于同时检测刚果热病毒、库波热病毒1型和库波热病毒2型的三种病毒的核酸、试剂盒和检测方法，其中，用于多重PCR同时检测三种病毒的核酸包括刚果热病毒、库波热病毒1型和库波热病毒2型的三种病毒的上、下游引物；用...
- 燕清丽杨鹏飞侯海燕李兵兵唐丽赵怀荣姚海波何南江
- 文献传递
- 一种TaqMan探针实时荧光RT-PCR检测黄病毒的非诊断性方法
- 本发明公开了一种TaqMan探针实时荧光RT-PCR检测黄病毒的非诊断性方法，该非诊断性方法包括一对引物和探针对待检样本进行实时定量检测，旨在针对黄病毒属成员多、检测繁琐，给新发虫媒病毒监测检测带来不便的问题。该非诊断性...
- 孙肖红郭金金燕清丽方艳辉杨鹏飞
- 淮安市艾滋病异性性传播方式及分子流行病学研究被引量：1
- 2015年
- 目的了解淮安市经异性性传播感染的HIV/AIDS人群的性传播构成方式以及病毒亚型分布情况。方法对艾滋病病例报告系统中,现住址为淮安市的经异性性传播病例进行面对面问卷调查,内容包括社会人口学特征和高危行为史。从经异性性传播感染的HIV/AIDS病例血液中提取DNA或RNA,用巢式PCR或RT-PCR方法扩增gag、env基因区片段,测定序列并分析。结果共调查HIV/AIDS病例166例,经商业异性性传播者占38.0%,经婚内或者固定性伴侣性传播者占40.4%,经非婚非商业异性性传播者占21.7%。结合gag和env 2个基因片段,最终确定了103分样本的基因亚型,发现有6种HIV-1亚型和重组型,其中,CRF01_AE占52.4%、CRF07_BC占20.4%、CRF08_BC占11.7%、B'(泰国B)占9.7%、B(欧美B)占3.9%、CRF55_01B占1.9%。结论淮安市HIV经异性性传播方式以经婚内或固定性伴传播为主;感染HIV-1流行株较为复杂,存在6种亚型和重组型,其中CRF01_AE重组型是主要流行株。
- 范炜燕清丽还锡萍
- 关键词：艾滋病异性性传播分子流行病学
- 黄病毒属TaqMan探针荧光定量RT-PCR检测方法建立被引量：4
- 2012年
- 目的建立用于检测黄病毒属的TaqMan探针荧光定量RT-PCR方法。方法从GenBank中检索黄病毒属代表株的全基因序列,通过DNAstar进行序列比对和blast进行保守序列搜索和分析,用Beacon Designer 7.0软件进行引物和TaqMan探针设计,以乙脑毒株MB090509 RNA为模板,优化反应条件并应用于现场蚊虫标本检测。结果确定黄病毒属TaqMan探针荧光定量RT-PCR反应条件为:45℃15 min,95℃10 min,95℃10 s→54℃45 s,40次循环,引物和探针终浓度为200 nmol/L。灵敏度为常规RT-PCR方法 100倍,检出限2.9×10-3噬斑形成单位(PFU)/mL,与甲病毒属、东南亚十二节段RNA病毒属、布尼亚病毒属均无交叉反应。从161份现场蚊虫标本中检测出11份阳性标本,经病毒分离、测序均被证实为乙脑病毒。结论本研究建立的黄病毒属TaqMan探针荧光定量RT-PCR方法具有广泛应用价值。
- 郭金金孙肖红燕清丽方艳辉杨鹏飞魏莲张晓龙姚李四
- 关键词：黄病毒属
- 淮安市男男性行为人群HIV感染情况及影响因素分析被引量：4
- 2017年
- 目的分析淮安市男男性行为者HIV感染情况及其影响因素,为制订防治对策和干预措施提供依据。方法采用滚雪球、网络等方法招募对象,由经过专业培训的调查员对其进行面对面的问卷调查,并采血样进行艾滋病病毒(HIV)抗体检测。结果共监测男男性行为者1752人,其中艾滋病知晓率为91.64%,HIV阳性率为5.19%。最近6个月有肛交行为的占61.36%,最近1次发生肛交没有使用安全套的占33.93%,最近6个月发生同性商业性行为3.10%,最近1次商业性行为时没有使用安全套占28.13%。吸毒的占1.90%,没有研究对象与别人共用过针头。干预服务接受率为74.35%,同伴教育接受率为60.17%。除最近6个月是否有肛交行为(χ2=6.85,P<0.05),其他情况下HIV抗体检测阳性率差异均无统计学意义(P>0.05)。结论应继续加强淮安市男男性行为人群的健康教育和干预措施。
- 侯海燕邢亚东范炜燕清丽吴丽萍
- 关键词：男男性行为者艾滋病影响因素
- 淮安市长角血蜱遗传多样性的线粒体基因COⅠ分析
- 2019年
- 目的 本研究旨在了解淮安市长角血蜱(Haemaphysalis longicornis)的遗传多样性,比较不同地理种群间的进化关系,为本市H.longicornis及蜱传病的预防提供理论基础。方法 在淮安市盱眙县山区采集游离蜱和羊寄生蜱,PCR法扩增细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(mt COⅠ)基因并测序。对mt COⅠ基因序列进行系统进化分析和种群遗传多样性分析。结果 JS-XY种群的mt COⅠ基因的核苷酸同源性为97.00～100.00%,JS-XY种群在进化枝上属于"Compound"进化谱系枝。JS-XY种群共有3单倍型,单倍型多样性Hd=0.439,核苷酸多样性为π=0.001,多态性位点S=2,Tajima's D值为-0.849 71。结论 研究表明,淮安地区的优势蜱种为长角血蜱,H.longicornis JS-XY种群近期可能经历过种群扩张。
- 何芳杨鹏飞唐丽燕清丽刘纯成赵怀荣姚海波何南江
- 关键词：长角血蜱DNA条形码系统进化树种群遗传多样性
- 荧光定量PCR检测新型甲型H1N1病毒试剂盒及检测方法
- 本发明公开了一种检测新型甲型流感病毒荧光定量PCR试剂盒，由引物和探针、Taqman 2×Universal PCR Master Mix、40×Multi Scribe<Sup>TM </Sup>and RNase I...
- 姚李四胡孔新燕清丽孙肖红杨鹏飞王静
- 文献传递
- 一株新蝇媒病原菌分离鉴定及分子系统发育被引量：1
- 2013年
- Wohlfahrtiimonaschitiniclastica由匈牙利的T6th等首次从黑须污蝇（Wohlfahrtiamagnifica）肠道中分离、命名。有文献报道，W．chitiniclastica曾引起法国东南部流浪者菌血症与南美洲阿根廷个体的暴发性脓毒症。本文作者根据其宿主为黑须污蝇Wohlfahrtiamagnifica以及分解几丁质的特征而将其命名为污蝇解壳杆菌。
- 陈拓曹晓梅祁军姚李四张晓龙燕清丽邓耀华
- 关键词：病原菌系统发育
- 江苏省淮安市啮齿动物感染正汉城病毒的基因特征研究
- 2019年
- 目的了解淮安市啮齿动物携带正汉城病毒(Seoul orthohantavirus,SEOV)的分布特点及SEOV的种群遗传多样性特征,为肾综合征出血热防治提供科学依据。方法用夹夜法采集啮齿动物,提取肺组织RNA,采用PCR法扩增SEOV的S基因,对S基因序列进行系统进化及遗传多样性分析。结果在淮安市捕获鼠类4种125只,褐家鼠(Rattus norvegicus)为优势鼠种,构成比为62.4%。褐家鼠携带的SEOV(XuyiRn43、XuyiRn68)S基因片段的核苷酸序列同源性为98.1%,推导的氨基酸序列同源性为97.5%,与江苏省赣榆株(GanyuRn20、GanyuRn66及GanyuRn137)的核苷酸序列同源性为98.4%~98.7%,推导的氨基酸序列同源性为96.7%~99.2%。系统进化分析显示淮安市褐家鼠携带的SEOV的基因亚型为S1型,有2个单倍型。结论褐家鼠为淮安市优势鼠种,携带的SEOV为S1基因亚型。
- 燕清丽行岳真李兵兵庞艺秀何芳刘纯成赵怀荣杨鹏飞姚海波何南江
- 关键词：啮齿动物褐家鼠基因分型
- 江苏省淮安市蚊虫感染沃尔巴克氏体的调查被引量：1
- 2018年
- 目的了解淮安市蚊种自然感染沃尔巴克氏体Wolbachia的特点及Wolbachia种群遗传多样性研究,为蚊媒及蚊媒传染病的生物防治提供科学依据。方法用诱蚊灯法采集蚊虫,对采集的蚊种进行DNA提取,采用PCR扩增细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(mt COI)基因及wsp基因、测序及系统进化分析。结果在淮安市捕获蚊种5种共计1 640只,Wolbachia在蚊虫样本组的总感染率为28. 05%(23/82)。淮安市蚊种携带的Wolbachia的核苷酸序列相似性为71. 5%~99. 9%,氨基酸序列相似性为70. 7%~99. 9%。系统进化分析显示淮安蚊种携带的Wolbachia被划分为Mors、Dei和Pip组。淮安蚊种携带的Wolbachia种群有4个单倍型,Wolbachia的单倍型多样性Hd=0. 597,核苷酸多样性π=0. 120,多态性位点S=151。结论淮安市蚊虫普遍存在Wolbachia的感染,其基因型为Mors、Dei和Pip。
- 燕清丽行岳真杨鹏飞曹晓梅李兵兵刘纯成蔡蓉赵怀荣姚海波何南江
- 关键词：蚊虫沃尔巴克氏体基因分型种群遗传多样性
