李晓嫘 作品数:24 被引量:162 H指数:8 供职机构: 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 更多>> 发文基金: World Health Organization 国家科技重大专项 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 自动化与计算机技术 更多>>
2018年新疆维吾尔自治区外环境污水中分离到1株II型疫苗衍生脊髓灰质炎病毒 被引量:16 2019年 目的对新疆维吾尔自治区外环境污水中分离到的1株Ⅱ型疫苗衍生脊髓灰质炎(脊灰)病毒(Vaccine derived poliovirus,VDPV)进行鉴定和分析。方法 2018年4-9月对新疆乌鲁木齐市每月定期采集的环境污水标本进行病毒分离,对脊灰病毒(Poliovirus,PV)分离株采用实时荧光定量RT-PCR方法进行型内鉴定,对非疫苗类似株PV进行VP1区核苷酸序列分析。结果 2018年4-9月共采集乌鲁木齐市环境污水标本12份,从6份标本中分离到54株PV,其中4月份1株PV鉴定为Ⅱ型VDPV,与中国既往发现的Ⅱ型VDPV序列和GenBank中Ⅱ型VDPV序列均不同源。连续3个月的环境污水监测没有发现遗传学相关的VDPV,该Ⅱ型VDPV最终分类为来源不确定的VDPV。启动Ⅱ型VDPV事件的三级应急响应后,后期的连续监测未再检测到Ⅱ型PV,应急响应终止。结论新疆环境污水中检出Ⅱ型VDPV表明环境监测对于维持无脊灰的重要性,为及时发现VDPV和脊灰野病毒的输入提供了预测预警。 唐海淑 李晓嫘 凯塞尔·吾斯曼 崔惠 严冬梅 宁静 王东艳 祝双利 温宁 张勇 许文波关键词:环境监测 无脊髓灰质炎状态 肠道病毒C组96型(EV-C96)新疆株的全基因组序列分析 被引量:1 2022年 肠道病毒C组96型(EV-C96)是C组肠道病毒的一种新型肠道病毒,在临床上多与急性弛缓性麻痹等疾病相关联,世界分布较广,近年来陆续在中国、芬兰等多个国家的急性弛缓性麻痹患者、腹泻患者、健康人群或环境标本中分离到。为探究在我国新疆地区流行的EV-C96毒株的基因特征与进化特征,本研究对2011年从我国新疆地区一名急性弛缓性麻痹病例及一名接触者中分离到的两株EV-C96进行了全基因组序列测定,随后与全球EV-C96流行株以及C组肠道病毒原型株进行进化分析,与C组肠道病毒代表株进行核苷酸和氨基酸相似性分析和重组分析。结果显示,两株新疆EV-C96毒株与原型株以及1991年在我国山东地区分离的毒株等早期流行株分布于两个分支,且在基因组结构的多个区域核苷酸差异性较大,同时其非结构蛋白区域与其它型别的C组肠道病毒之间存在重组。EV-C96可能通过重组方式发生毒力改变,需加强C组肠道病毒在我国的监测,提升对其所导致的暴发疫情进行应急处置的能力。本研究揭示了EV-C96的起源进化,证实了C组肠道病毒多个型别之间的重组关系,为我国肠道病毒的防控提供科学依据。 孙强 刘莹 唐海淑 李晓嫘 严冬梅 祝双利 王东艳 崔惠 许文波 许文波关键词:全基因组序列 基因特征 基因重组 中国2014年脊髓灰质炎实验室网络的运转与评价 被引量:13 2017年 目的评价中国(未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区,下同)2014年脊髓灰质炎(脊灰)实验室网络(Polio Laboratory Network,PLN)运转情况,为中国维持无脊灰状态提供病毒学依据。方法对中国急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例监测信息报告管理系统中31个省份报告的AFP病例和国家脊灰实验室(National Polio Laboratory,NPL)的监测数据进行分析,对PLN的各项运转指标进行评价。结果 2014年中国PLN共报告5 751例AFP病例,收到5 688例AFP病例的11 363份粪便标本;14天内双份粪便标本的采集率为92.16%,合格粪便标本采集率为91.65%,病毒分离结果 18天内反馈率为97.62%。从5 688例粪便标本中132例(2.32%)分离到脊灰病毒(Poliovirus,PV);590例(10.37%)分离到非脊灰肠道病毒(NPEV)。2014年NPL收到省级脊灰实验室送检的分离自AFP病例及其接触者、非AFP病例、健康人的292株L20 B细胞阳性分离物,262株为PV,21株为NPEV,9株为非肠道病毒(Non-enterovirus,NEV)。262株PV中,7株为疫苗衍生脊灰病毒(Vaccine-derived poliovirus,VDPV),来自内蒙古、山西、河北和湖南;未发现脊灰野病毒(Wild poliovirus,WPV)。从脊灰病毒外环境监测采集的污水标本中分离到4株VDPV。2014年NPL和31个省级CDC脊灰实验室都通过了世界卫生组织(WHO)粪便标本肠道病毒的新检测流程的能力验证标本考核。NPL和8个省级CDC脊灰实验室接受并通过了WHO现场评估认证,其他省级实验室接受了信函认证。结论中国PLN 2014年运转正常,未发现WPV,为维持中国无脊灰状态、早期发现VDPV或VDPV病例、早期采取应对措施阻断其传播提供了重要的病毒学依据。 祝双利 朱晖 范钦 张勇 王东艳 严冬梅 李晓嫘 樊春祥 许文波中国脊髓灰质炎实验室网络开展细胞系支原体检测及现状分析 被引量:13 2017年 目的通过对中国脊髓灰质炎(脊灰)实验室网络(China Polio Laboratory Network,CPLN)开展细胞系支原体检测(Cell mycoplasma detection,CMD),评价CMD在细胞质量控制中的作用,探讨其与脊灰病毒分离率的联系。方法采用巢式聚合酶链反应(Nested polymerase chain reaction,n PCR)法对CPLN常规使用的RD、L20B细胞系进行支原体检测。结果 2013年8月至2016年8月,在CPLN中除西藏外的30个省级脊灰实验室已正式开展CMD,并按时向国家脊灰实验室上报结果。CMD结果显示,30个省级脊灰实验室所用的每个批次的L20 B和RD细胞,支原体检测结果均为阴性。结论三年间CPLN 30个省级脊灰实验室用于脊灰病毒分离的细胞系均未出现支原体污染,细胞系质量正常且稳定;CMD作为CPLN细胞质量控制的重要组成部分,为CPLN运转质量提供可靠的数据支撑。 王东艳 祝双利 张勇 严冬梅 朱晖 李晓嫘 宋洋 黄克强 许文波四川省2009年Ⅱ型疫苗高变异脊髓灰质炎病毒潜在流行的病毒学分析 被引量:6 2015年 目的分析四川省2009年Ⅱ型(Type 2)疫苗高变异脊髓灰质炎(脊灰)病毒[Vaccine High-mutant Poliovirus(PV),VHMPVⅡ]的病毒学特征。方法对2009年5-6月从四川省泸州和成都市的2例急性弛缓性麻痹(Acute Flaccid Paralysis,AFP)病例中分离到的2株PVⅡ进行全基因组序列测定。结果全基因组序列测定结果显示,2株VHMPVⅡ全长7439个碱基(base pair,bp),共编码2207个氨基酸。与赛宾(Sabin)Ⅱ型疫苗株病毒相比,2株VHMPVⅡ不存在bp的插入和缺失,VP1编码区核苷酸(nucleotide,nt)变异数分别为5个和7个,均属于VHMPVⅡ。2株病毒在VP1编码区共享5个nt变异,全长共享13个nt变异,提示已经发生了潜在流行。2株VHMPVⅡ均未发生型内或型间重组,在已知的2个减毒位点5'非编码区nt481和VP1衣壳蛋白编码区nt2909位点上均发生回复突变。VP1编码区基因进化树分析表明,2株VHMPVⅡ处于同一传播链,该传播链病毒的进化独立于国内外至今发现的循环的Ⅱ型疫苗衍生脊灰病毒(Circulating Vaccine-derived)PV(c VDPVⅡ),按照PV已知的基因进化速率估算该传播链已在人群中流行约260天。结论本研究结果表明,与VDPV类似,VHMPV同样可以在人群中发生流行,同时再次证明中国脊灰实验室网络监测具有高度的敏感性,能够及时发现VHMPV的传播,防止其衍变为cVDPV。 严冬梅 陈娜 张勇 祝双利 王东艳 童文彬 朱晖 李晓嫘 许文波关键词:基因特征 2007~2012年山东省临沂市手足口病流行病学和肠道病毒71型基因特征分析 被引量:8 2014年 为了分析山东省临沂市2007~2012年手足口病(Hand, foot, and mouth disease, HFMD)的流行病学和肠道病毒71型(Enterovirus A71, EV-A71)的基因特征,采用描述流行病学方法,对国家传染病监测信息报告管理系统中的HFMD疫情资料进行统计分析;对2007~2012年山东省临沂市HFMD病例的EV-A71分离株的VP1编码区进行逆转录-聚合酶链反应,并对扩增产物进行核苷酸序列测定,使用MEGA 5.0软件分析VP1区基因变异特征以及基因亲缘关系。结果显示,2007~2012年山东临沂市每年均有HFMD报告,其中2009年发病例数和死亡病例数最多,分别为14697例和9例,报告发病率为140.28/10万,死亡率为0.086/10万。发病高峰主要发生在4~7月,5月份最高;其中散居儿童发病数占77.37%~92.00%。2007~2009年发病高峰在2.5岁,2010~2012年发病高峰在1.5岁。连续6年实验室确诊HFMD共计1365例,占总病例数比例为2.98%;其中EV-A71构成比为44.18%,柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16, CVA16)为46.59%。2007~2012年在山东省临沂市分离到的EV-A71均属于C4基因亚型中C4a进化分支。2007~2012年山东省临沂市均有HFMD暴发流行,各区县发病率有明显差异,发病高峰在每年的4~7月。发病年龄集中在3岁以下儿童,散居儿童构成比例最高。各年份引起HFMD的病原体均以EV-A71和CVA16共循环为主。自2007年在山东省临沂市发现EV-A71 C4基因亚型的C4a引起的HFMD疫情以来,C4a在临沂市已经持续传播和流行了6年。 张盛 张勇 檀晓娟 林艺 王连森 祝双利 李晓嫘 王东艳 徐爱强 裴耀文 王显军 许文波关键词:手足口病 流行病学 中国2012年脊髓灰质炎实验室网络的运转与评价 被引量:12 2014年 目的通过对中国2012年脊髓灰质炎(脊灰)实验室网络(Polio Laboratory Network,PLN)监测数据(未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区,下同)进行统计分析,评估其运转情况,为中国重新恢复无脊灰状态提供实验室依据。方法分析中国免疫规划监测信息管理系统数据库中,31个省(自治区、直辖市,下同)报告的急性弛缓性麻痹(Acute Flaccid Paralysis,AFP)病例个案调查表和中国疾病预防控制中心(Center for Disease Control and Prevention,CDC)病毒病预防控制所国家脊灰实验室(National Polio Laboratory,NPL)的监测数据库,总结PLN运转中的质量控制,评价PLN的各项运转指标。结果中国2012年PLN共收集了6163例AFP病例的12 204份粪便标本,14d内双份粪便标本采集率为92.6%,合格粪便标本采集率为92.1%。按世界卫生组织(World Health Organization,WHO)第4版《脊灰实验室手册》的要求进行病毒分离和鉴定,试验结果28d内及时反馈率为99%。2012年,在116例AFP病例粪便标本中分离到脊灰病毒(Poliovirus,PV),分离率为2.10%(116/5534);在680例AFP病例粪便标本中分离到非脊灰肠道病毒(Non-polio Enterovirus,NPEV),分离率为12.29%(680/5534)。2012年,NPL收到PLN送检的283株PV,对375株单血清型PV采用衣壳蛋白(Capsid Protein)VP1编码区核苷酸序列测定与分析进行型内鉴定(Intratypic Differentiation,ITD),发现7例(共计25株)疫苗衍生(Vaccine-derived)PV(VDPV),其中Ⅰ型2株,Ⅱ型16株,Ⅲ型7株,未发现野生型(Wild Type)PV(WPV)。2012年,NPL收到环境监测送检的314株PV,全部采用VP1编码区核苷酸序列测定与分析进行ITD,在山东省发现1株VDPV。2012年8月,NPL作为WHO西太平洋区脊灰参比实验室接受并以优异的成绩通过了WHO的年度现场认证;2012年10月,NPL以满分的成绩通过了荧光定量聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)和VDPV筛查的职能考核;2012年12月,又以满分通过了WHO核苷酸序列测定和分析的第一� 王东艳 祝双利 张勇 朱晖 张波 李晓嫘 严冬梅 安洪秋 檀晓娟 许文波山西省2014年Ⅱ型疫苗衍生脊髓灰质炎病毒的基因特性分析 被引量:6 2015年 2010年世界卫生组织(World Health Organization,WHO)对Ⅱ型疫苗衍生脊髓灰质炎(脊灰)病毒(Vaccinederived Poliovirus,VDPV)定义进行了修订,为研究新定义的Ⅱ型VDPV的基因特征及进化,本研究对山西省2014年1例急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例中分离到的1株Ⅱ型VDPV进行全基因组序列测定和分析。测序显示毒株的基因全长为7 439个碱基,共编码2207个氨基酸,与Sabin2疫苗株相比不存在碱基的插入和缺失。该毒株在已知的减毒位点5′非编码区nt481上发生了回复突变,而在另一个减毒位点VP1衣壳编码区nt2909位点上未发生核苷酸变异。毒株与Sabin1发生重组,重组位点位于3D非结构编码区的nt6 247~6 281之间。VP1编码区基因进化树分析表明山西Ⅱ型VDPV的进化独立于国内外至今发现的其它Ⅱ型VDPVs,按照脊灰已知的基因进化速率估算该毒株已在人群中循环约176d。本研究再次证明了中国脊灰实验室网络监测的敏感性,能够及时准确地发现VDPV,在中国维持无脊灰状态过程中发挥重要作用。 严冬梅 李晓嫘 张勇 杨建芳 祝双利 王东燕 张创业 朱晖 许文波关键词:疫苗衍生脊髓灰质炎病毒 基因特征 中国2013年脊髓灰质炎实验室网络的运转状况与评价 被引量:8 2015年 目的通过对中国(未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区,下同)2013年脊髓灰质炎(脊灰)实验室网络(Polio Laboratory Network,PLN)监测数据和各项监测指标的分析和评估,为维持我国无脊灰状态提供病毒学依据。方法对中国免疫规划监测信息管理系统数据库中,31个省(自治区、直辖市,下同)报告的急性弛缓性麻痹(Acute Flaccid Paralysis,AFP)病例个案调查表和中国疾病预防控制中心(Center for Disease Control and Prevention,CDC)病毒病预防控制所国家脊灰实验室(National Polio Laboratory,NPL)的监测数据库进行统计分析,对PLN的各项运转指标进行评价。结果中国2013年PLN收集到5623例AFP病例的11 126份粪便标本,14天内双份粪便标本采集率为92.78%,合格粪便标本采集率为92.35%,鉴定结果 28天内反馈率为99.10%。2013年从5623例粪便标本中有111例分离到脊灰病毒(Poliovirus,PV),分离率为1.97%;606例粪便标本分离到非脊灰肠道病毒(Non-polio Enterovirus,NPEV),分离率为10.78%。2013年,NPL收到PLN送检的237份PV分离物,按单个血清型定型统计共计304株,其中19株为疫苗衍生(Vaccine-derived)PV(VDPV),1株来源于1例非AFP病例,另18株来源于1例免疫缺陷相关的(Immunodeficiency-associated)VDPV(i VDPV)病例;未发现野生型(Wild)PV(WPV)。2013年,NPL和31个省CDC脊灰实验室都通过了世界卫生组织(World Health Organization)粪便标本PV等EV的新检测流程的盲样标本考核,NPL和其中8个省CDC脊灰实验室接受并通过了WHO现场评估认证,其他省级CDC脊灰实验室通过信函认证表格认证。结论中国PLN 2013年运转正常,未发现WPV或WPV病例,为维持我国无脊灰状态,早期发现VDPV或VDPV病例,早期采取应对措施阻断其传播提供了重要的病毒学依据。 朱晖 祝双利 张勇 王东艳 严冬梅 李晓嫘 安洪秋 许文波关键词:脊髓灰质炎病毒 疫苗衍生脊髓灰质炎病毒 广西壮族自治区四个县0~15岁人群肠道病毒71型中和抗体水平调查 被引量:3 2015年 目的了解广西壮族自治区(广西)4个县0~15岁人群的肠道病毒71型(Enterovirus Type 71,EV71)中和抗体(Neutralizing Antibody,NA)水平,为制定EV71疫苗免疫程序提供参考。方法选取广西4个县作为研究现场,在每个县选取2个乡,对调查现场的0~15岁人群采集静脉血标本。结果≤6月龄各月龄组研究对象血清EV71 NA阳性率随年龄的增长而迅速下降;直到9~11月龄仍维持在较低水平(20.0%),≥1岁各年龄组NA阳性率迅速上升,其中5岁组的EV71 NA阳性率最高(87.0%)。0~15岁人群的EV71 NA几何平均滴度(Geometric Mean Titer,GMT)为1∶18.24,新生儿EV71 NA GMT较高(1∶23.12),随着月龄增长,EV71 NA GMT逐渐下降,至5月龄降至最低(1∶5.46),≥1岁各年龄组的NA GMT迅速上升,5岁组最高(1∶95.68)。4个县及不同性别的分年龄组EV71 NA阳性率及GMT与EV71总的NA阳性率及GMT相似。结论 5~6月龄婴儿EV71 NA阳性率及GMT均降至最低水平,为确定EV71疫苗接种起始月龄提供参考。 李燕 祝双利 刘燕敏 李荣成 殷大鹏 夏伟 李艳萍 萁兆军 王东艳 李晓嫘 严冬梅 王慧玲 许文波 王华庆关键词:肠道病毒71型 中和抗体