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酿酒酵母基因重要性与基因表达水平关系的进一步研究: 基因重要性对于我们理解物种进化、细胞生理以及疾病发生有很大帮助。近年来的高通量数据如:蛋白质与蛋白质互作、基因重复性、基因表达水平以及进化速率等数据的出现极大地促进了基因重要性的预测。但是关于基因重要性和基因表达水平关系...; 曹君霞; 关键词：基因表达水平酿酒酵母; 文献传递

生物信息方法预测高粱miRNA及其靶基因被引量：5: 2010年; miRNAs是新发现的一类长约21个碱基对的非编码RNAs.它们在转录后基因调控中起着重要作用.它们的靶目标涉及许多生物进程,如发育、新陈代谢、胁迫应答等.尽管已经有大量物种的miRNAs报道,然而关于高粱miRNAs的相关报道却十分有限.本研究通过基于基因组勘测序列(GSS)的同源序列搜索和miRNAs的二级结构分析,总共发现17条新的miRNAs.它们不均等的分布于11个miRNAs家族中.一些miRNAs的基因存在多位点并且不仅仅存在于单一基因位点上.大多数miRNAs存在同一生物界的保守性,但是我们发现,高粱sbi-miR127和sbi-miR466分别表现出与人类(H.sapiens)和家鼠(M.musculus)具有高度序列相似性.通过靶基因预测软件MiRU对miRNAs的分析表明,它们可能调节64种靶基因,其中多数涉及RNA加工、新陈代谢、细胞周期、蛋白质降解、胁迫应答及转录.在11个miRNAs家族中至少有7个miRNAs的靶目标是NADPH-细胞色素p450还原酶、核苷二磷酸激酶、超氧化物歧化酶等一些在新陈代谢和胁迫应答中必要的蛋白,说明miRNAs在这些过程中起着十分重要的作用.; 杜江峰武永军方晓峰曹君霞赵亮陶士珩; 关键词：微小RNA 高粱靶标

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曹君霞