张名媛
- 作品数：13 被引量：38H指数：4
- 供职机构：广西大学动物科学技术学院更多>>
- 发文基金：广西青年科学基金国家现代农业产业技术体系建设项目国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 广西巴马小型猪miR-148b慢病毒制备及靶基因通路预测分析被引量：6
- 2019年
- 【目的】构建广西巴马小型猪miR-148b慢病毒表达载体并对其靶基因进行预测及相关通路分析,为揭示miR-148b的作用机制打下基础。【方法】以广西巴马小型猪血液基因组DNA为模板,扩增miR-148b的前体及部分侧翼序列,使用T4连接酶将目的片段连接至pLV-CMV-MCS-EF1载体上,构建获得pLV-miR-148b慢病毒表达载体;以pLVmiR-148b慢病毒表达载体转染293T细胞48 h后进行表达验证;利用miRDB、miRWalk 2.0和TargetScan 7.2三大数据库预测分析广西巴马小型猪miR-148b的靶基因,并以MirPath v.3分析miR-148b靶基因相关通路。【结果】广西巴马小型猪miR-148b片段大小为385 bp,与miRBase 21.0网站上已发布猪miR-148b成熟序列(前体和侧翼序列)的同源性达100%。构建获得的pLV-miR-148b慢病毒表达载体能在293T细胞中成功表达,且相对表达量极显著高于pLV-GFP慢病毒空载质粒转染组(P<0.01)。数据库预测分析得到18个广西巴马小型猪miR-148b的靶基因,分别为CLOCK(时间昼夜调控因子)、MIER1(转录调控因子)、MECP2(甲基化CpG结合蛋白)、ZNF704(锌指蛋白)、SPTY2D1(SPT2染色质蛋白)、QKI(RNA结合蛋白)、ZBTB20(锌指蛋白)、MGAT4A(钠/磷酸转运蛋白)、UHMK1(编码蛋白激酶)、PIK3C2A(磷酸肌醇-3-激酶2α肽)、C6orf62(6号染色体开放阅读框62抗体)、HECW2(E3泛素蛋白连接酶)、MAP1B(微管相关蛋白)、NHS(NHS肌动蛋白调节因子)、B4GALT6(β-1,4-半乳糖基转移酶)、ATP2A2(肌浆ATP酶/内质网Ca2+转运酶)、AP4E1(蛋白复合物接头分子)和BBX(锌指蛋白);且发现有11条靶基因相关通路,其中与疾病相关的通路有脂肪酸合成通路、细胞外基质受体相互作用通路、癌症的蛋白聚糖通路、神经胶质瘤通路、癌症的小分子核糖核酸通路、肾细胞癌通路、N-聚糖生物合成通路和致心律失常性右室心肌病通路。【结论】广西巴马小型猪miR-148b慢病毒表达载体能在293T细胞中成功表达,miR-148b存
- 张名媛张名媛孙晴超郭晓萍兰干球郭亚芬兰干球
- 关键词：广西巴马小型猪慢病毒载体靶基因
- 广西巴马小型猪ApoA1基因克隆及其生物信息学分析被引量：4
- 2019年
- 【目的】克隆广西巴马小型猪载脂蛋白A1(ApoA1)基因并进行生物信息学分析,为后续开展ApoA1基因研究提供基础数据,同时为制作广西巴马小型猪动脉粥样硬化疾病模型打下基础。【方法】以提取的广西巴马小型猪肝脏组织总RNA为模板,运用RT-PCR克隆广西巴马小型猪ApoA1基因序列,以实时荧光定量PCR(qPCR)检测ApoA1基因在广西巴马小型猪心脏、肝脏、脾脏、肺脏和肾脏组织中的表达情况,并利用MegAlign、ProtParam、SOPMA、Net-Phos、SignalP和SWISS-MODEL等在线分析软件对广西巴马小型猪ApoA1基因进行生物信息学分析及构建系统发育进化树。【结果】广西巴马小型猪ApoA1基因编码区(CDS)序列长795bp,与普通猪ApoA1基因序列的同源性为99.9%,仅第630处有1个碱基发生同义突变。ApoA1基因在广西巴马小型猪心脏、肝脏、脾脏、肺脏和肾脏组织中均有表达,且以肝脏中的相对表达量最高、脾脏中的相对表达量最低。广西巴马小型猪ApoA1由264个氨基酸残基构成,其分子式为C1343H2136N376O409S5,蛋白分子量为30254.31Da,理论等电点(pI)为5.47,属于亲水性蛋白,存在跨膜结构,不存在信号肽,有18处磷酸化位点(丝氨酸磷酸化位点有10处,苏氨酸磷酸化位点有6处,络氨酸磷酸化位点有2处)。广西巴马小型猪ApoA1的二级结构中,α-螺旋占79.92%,β-折叠占2.65%,无规则卷曲占11.12%,延伸链占6.31%,属于全α类蛋白。广西巴马小型猪ApoA1氨基酸序列与普通猪的同源性最高,达99.6%;由基于ApoA1氨基酸序列同源性构建的系统发育进化树也可看出,广西巴马小型猪与普通猪的亲缘关系最近。【结论】广西巴马小型猪ApoA1基因保守性强,以在肝脏中的表达量最高,是广西巴马小型猪抗动脉粥样硬化的重要因子,通过敲除该基因可制作广西巴马小型猪动脉粥样硬化疾病模型。
- 张名媛张名媛司景磊郭晓萍崔悦悦郭晓萍綦文晶兰干球郭亚芬
- 关键词：广西巴马小型猪克隆生物信息学分析
- 广西巴马小型猪Presenilin-2基因真核表达载体的构建及其在小鼠N2a细胞中的表达验证被引量：8
- 2015年
- 本研究的目的是构建广西巴马小型猪Presenilin-2真核表达载体并在细胞水平对其进行验证。利用RT-PCR的方法扩增并克隆Presenilin-2基因,再将Presenilin-2亚克隆到p EGFP-N1,通过脂质体转染方法将p EGFP-PS2-N1转至N2a细胞,48 h后在荧光显微镜下观察细胞是否表达绿色荧光蛋白。结果显示,本研究成功构建了阅读框架正确的广西巴马小型猪Presenilin-2基因真核表达载体,转染p EGFP-PS2-N1后,N2a细胞有绿色荧光蛋白的表达。该研究将为下一步研究Presenilin-2基因的功能和生产转Presenilin-2基因猪奠定基础。
- 吴延军陈秋明杨秀荣兰干球张名媛李艳君郭亚芬蒋钦杨
- 关键词：广西巴马小型猪N2A细胞阿尔茨海默病转基因猪
- 广西巴马小型猪MyoG基因克隆及外显子3多态性分析被引量：4
- 2012年
- 为了解RT-PCR扩增广西巴马小型猪肌细胞生成素(MyoG)cDNA序列,并分析与其他物种间的聚类关系,试验采用PCR-SSCP技术分析广西巴马小型猪、长白猪、杜洛克猪、大约克猪MyoG基因外显子3多态性,根据GenBank中已发表的猪MyoG基因序列设计PCR引物,以广西巴马小型猪肌肉组织总RNA为模板进行RT-PCR,所得目的片段经纯化、克隆、鉴定和测序;从4个猪种的耳组织中分别提取30个个体的基因组DNA,采用PCR的方法扩增出外显子3并进行SSCP分析。结果表明:克隆得到广西巴马小型猪MyoG基因编码区长675 bp,与四川野猪、人、奶牛、小鼠同源序列相似性分别为99.7%、93.8%、91.7%、90.5%,且不同物种间保守性较强;与四川野猪相比,克隆得到的广西巴马小型猪MyoG cDNA序列在第233位点及第642位点上发生基因突变;广西巴马小型猪MyoG基因的基因型只有AA型,而长白猪、杜洛克猪、大约克猪MyoG基因的基因型只有AB型,各群体内无多态性。
- 张名媛韦珏郭亚芬蒋钦杨陈时锦兰干球蒋和生
- 关键词：广西巴马小型猪
- 陆川猪TLR2基因的克隆与相关生物信息学分析
- 目的 对陆川猪Toll样受体2(toll-like receptor 2,TLR2)基因进行克隆及相关生物信息学分析.方法 根据GenBank已公布的猪TLR2基因序列设计引物,以陆川猪肺脏组织总RNA为模板,RT-PC...
- 申玉建何剑雄司景磊徐文文张名媛梁晶兰干球郭亚芬蒋和生
- 关键词：陆川猪克隆
- 广西巴马小型猪psp-intron-appa载体的构建及在细胞上的鉴定
- 引言随着畜牧业的迅速发展,我国畜禽养殖业特别是集约化畜禽养殖业的粪污已成为我国环境污染的主要来源之一。饲料中70%以上的总磷为植酸磷,而猪鸡等单胃动物不能分泌植酸酶,所以不能利用饲料中的植酸磷,大量的磷从粪中排出,严重影...
- 张名媛陈时锦陈宝剑蒋钦杨郭亚芬兰干球韦英明蒋和生
- 文献传递
- 广西巴马小型猪MCP-1基因克隆及序列分析被引量：3
- 2014年
- 【目的】研究广西巴马小型猪单核细胞趋化蛋白-1(MCP-1)基因CDs区的序列特点,为建立广西巴马小型猪动脉粥样硬化模型及揭示动脉粥样硬化的发生、发展机理提供理论依据。【方法】从广西巴马小型猪动脉血管组织中扩增MCP-1基因CDs区全长序列,与人类及其他易建立动脉粥样硬化模型动物的序列进行比对分析,并预测其蛋白质信号肽位点及结构域。【结果】广西巴马小型猪MCP-1基因CDs区全长300 bp,编码99个氨基酸;与人类MCP-1基因CDs区(S71513.1)的同源性最高,为84.4%。广西巴马小型猪MCP-1蛋白的前23位氨基酸为信号肽,后76位氨基酸为成熟肽,等电点(pI)9.51,蛋白质分子量10976.04kDa,信号肽位置有一段跨膜结构;广西巴马小型猪与人类MCP-1蛋白在形成二级结构时,保守半胱氨酸参与形成二硫键的位置一致,分别在第11、12、36和52号(除信号肽片段)位上排列为Cys-Cys,且是第11号位与第36号位形成二硫键,第12号位与第52号位形成二硫键。【结论】以广西巴马小型猪构建动脉粥样硬化模型时,MCP-1基因表达量可作为判断动脉血管疾病的一个辅助指标。
- 宋少锐吴延军蒋世强张名媛郭亚芬兰干球蒋钦杨
- 关键词：广西巴马小型猪MCP-1基因克隆动脉粥样硬化
- 大豆卵磷脂替代卵黄对德保矮马精液冷冻保存效果的影响
- 引言卵黄作为动物精液冷冻稀释液的组分已经被广泛的用于各种动物精液的冷冻保存,卵黄能为精子提供冷冻保护和提供营养物质,但同时也存在着含有动物源性的病原微生物及被分解后产生对精子有毒害的物质等问题。本研究的目的是通过在德保矮...
- 郑自华陈宝剑赵海峰陈东峰蒋钦杨陈集成张名媛韦英明
- 文献传递
- 山羊产羔性状相关基因研究进展被引量：11
- 2018年
- 随着生活水平的不断提高,人们膳食营养结构也发生了很大的改变,对肉类制品的种类和数量的需求也逐渐加大。山羊肉因其营养价值高、纤维细嫩而逐渐受到人们的喜爱。山羊的产羔性状是山羊繁殖性状中重要的经济性状,直接关系到养羊产业的经济收益,但肉羊生产的繁殖成本较高,且产羔数普遍偏低,严重制约着养羊产业的发展,因此通过有效的育种技术提高山羊的产羔数是山羊育种工作的重点。山羊产羔性状是由多基因控制的数量性状,遗传力较低,采用传统的育种技术对其改良的效率低、准确性差、成本高、耗时长,很难取得显著的效果。而分子辅助育种技术因对单核苷酸多态性位点（SNP）的筛选操作简便,统计检验效率和准确率高,结果便于实践应用且适用范围广,被国内外许多育种学家所热衷。文章对近年来国内外学者报道的羊多羔性状相关基因及其分子标记进行概述,为后续通过分子辅助育种技术培育多羔的山羊品种提供参考。
- 邹辉崔悦悦夏琴程晓芳吴延军张名媛廖顺连韦英明蒋钦杨
- 关键词：山羊产羔性状分子育种
- 陆川猪黑皮质激素受体4基因克隆及序列分析被引量：3
- 2018年
- 试验旨在对陆川猪黑皮质激素受体4(melanocortin-4receptor,MC4R)基因进行克隆及相关信息学分析。通过提取陆川猪背最长肌总RNA,采用RT-PCR、克隆等方法获得含目的基因MC4R的质粒pMD18-T-MC4R,经菌落PCR和测序鉴定正确后,应用相关生物信息学软件对陆川猪MC4R基因的理化性质、蛋白质的结构、修饰结构和亚细胞定位等进行预测分析。结果表明,MC4R基因CDS区长999bp,编码332个氨基酸,与NCBI上公布的野猪MC4R基因序列中的CDS区存在4个碱基差异,其中175和906bp处为同义突变,110和278bp处为错义突变,分别引起第37位谷氨酸变为甘氨酸和第93位缬氨酸变为丙氨酸。同源性比对结果发现,MC4R基因在不同物种及进化的过程中具有较高的保守性。陆川猪MC4R蛋白有明显的疏水区域,不存在信号肽,但有7个跨膜结构域,其编码蛋白的二级结构元件有α-螺旋、延伸链、β-转角和无规则卷曲。修饰结构预测表明,MC4R蛋白存在多处N糖基化位点,但无O糖基化位点,可能主要分布于内质网和囊泡。本研究成功克隆了陆川猪MC4R基因,为更好地开发利用地方品种陆川猪及其繁育奠定理论基础。
- 谢婉刘明君何剑雄申玉建陈宝剑关志惠张名媛郭亚芬郭亚芬兰干球蒋钦杨杨秀荣梁晶
- 关键词：陆川猪MC4R基因克隆
