吴恋娟
- 作品数:4 被引量:7H指数:2
- 供职机构:中国地质大学环境学院生物地质与环境地质国家重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金中国科学院脊椎动物进化系统学重点实验室开放课题基金更多>>
- 相关领域:生物学文化科学天文地球更多>>
- 古DNA实时荧光定量PCR实验中标准品的制备被引量:2
- 2010年
- 实时荧光定量PCR技术通过对PCR每一循环扩增产物的实时检测,可对模板的精确拷贝数进行绝对定量,从而用于古DNA实验中提取和扩增条件的比较和优化.本研究采用异硫氰酸胍碱裂解-SiO2吸附的方法,从采自黑龙江省的晚更新世斑鬣狗化石材料中提取得到了斑鬣狗线粒体基因组古DNA.经常规PCR扩增后,将纯化的扩增产物克隆到微生物体内使其大量复制,再用M13通用引物扩增出含少量外源DNA的古DNA目标片段,从而建立了适用于古DNA荧光定量PCR扩增的标准品的制备方法.经检测分析,运用该方法制备的标准品性质稳定,能够准确地指示反应体系中较为精确的古DNA模板拷贝数,从而反映古DNA的提取和扩增效率,用于比较并优化古DNA提取和扩增条件.
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- 关键词:古DNA实时荧光定量PCR标准品
- 基于线粒体COI基因序列探讨鸭嘴舌形贝地理分布被引量:1
- 2010年
- 从河北秦皇岛采集的用无水乙醇保存的鸭嘴舌形贝(Lingula anatina)样品中提取了DNA,经PCR扩增后进行克隆,得到了2条长度为682 bp的线粒体细胞色素C氧化酶第I亚基(COI)基因片段。调用GenBank中日本有明海和中国香港的鸭嘴舌形贝同源序列,用邻接法和贝叶斯法构建了系统发育树,结果表明:秦皇岛地区的鸭嘴舌形贝与日本有明海的鸭嘴舌形贝形成姊妹群,具有较近的亲缘关系,与香港的鸭嘴舌形贝亲缘关系较远。初步分析认为西太平洋地区鸭嘴舌形贝现有的地理分布并不是由浮游幼虫的扩散引起的,不同地区鸭嘴舌形贝的差异可能跟地理隔离有关。
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- 关键词:线粒体COI基因地理隔离
- 湖北石首麋鹿粪便DNA的提取及系统发育分析被引量:4
- 2009年
- 利用非损伤取样方法,从湖北石首麋鹿的粪便样品中提取得到其线粒体基因组Cyt b基因的部分序列,并对其进行了系统发育分析.结果表明:现有的麋鹿是遗传多样性高度特化的物种;在分歧时间上,麋鹿属较黇鹿属更晚从鹿亚科中分化独立出来,与鹿属中的坡鹿有着较近的进化关系.此外,还对有关糜鹿归属的古生物学和分子系统学研究结果出现矛盾的原因进行了初步分析,认为通过对我国多地点不同年代地层中麋鹿化石或亚化石进行古DNA研究,可弥补现有分子系统学研究中由于奠基者效应带来的取样误差,得到更有说服力的分析结果.
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- 关键词:分子系统学麋鹿线粒体DNA系统发育分析
- 我国北方地区斑鬣狗化石的古DNA初步分析
- 鬣狗科(Hyaenidae)动物约于2000万年前的中新世晚期从食肉目猫型超科动物分离而出开始独立演化,并在晚中新世至上新世初期达到其演化的鼎盛时期,分布区遍布欧洲、亚洲和非洲,也曾通过白令海峡入侵到北美洲。到晚更新世鬣...
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- 关键词:斑鬣狗晚更新世
- 文献传递