何坤
- 作品数：6 被引量：25H指数：2
- 供职机构：北京大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：中国博士后科学基金国家自然科学基金北京市科委基金更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术农业科学更多>>
- 基因组数据库简介被引量：2
- 2003年
- 本文以北京大学生物信息中心安装的3个国际著名基因组数据库GDB、GenoList和Ensembl为基础,介绍目前常用的基因组数据库,包括这些数据数据库的内容、数据格式、使用方法,以及用于构建上述数据库的数据库管理系统。
- 方刚陈蕴佳高歌刘翟何坤吴昕顾孝诚罗静初
- 关键词：微生物基因组人类基因组数据库系统生物信息
- 高等植物光形态建成过程中基因调控的生物信息学分析——转录调控及表观遗传调控分析
- 转录调控(tanscriptionalregulation)和表观遗传调控(epigeneticregulation)是真核生物基因调控的两种主要途径。本论文的工作内容为：利用生物信息学手段分析生物实验室提供的数据分别对...
- 何坤
- 关键词：MYBHY5组蛋白修饰
- 文献传递
- DNA芯片技术简介被引量：3
- 2006年
- 1990年，著名的人类基因组测序计划（Human Genome Project，HGP）正式启动，从此揭开了基因组时代的序幕。截至2006年8月，美国国立生物技术信息中心（NCBI，National Centerfor Biotechnology Information）收录的已完成基因组测序的物种数目为389个，正在进行序列拼接且测序完成的有341个，另外还有463个物种正在进行测序。
- 何坤高歌
- 关键词：DNA芯片技术人类基因组测序生物技术
- 植物转录因子分类、预测和数据库构建被引量：20
- 2015年
- 转录因子在植物生长发育和应对胁迫等过程中具有重要调控作用,基因组水平上系统预测植物转录因子是研究其功能和演化的基础。通过深入全面的文献调研,总结了一套完整的植物转录因子家族分类规则,开发了转录因子预测流程,构建了转录因子预测平台。基于该流程,从83种绿色植物中预测到129 288个转录因子,分属58个家族。对预测到的转录因子,从家族和个体两个层次进行了详尽注释,构建了植物转录因子数据库Plant TFDB(http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn)。Plant TFDB提供了覆盖绿色植物主要谱系的转录因子,其中大部分为具有重要经济价值的单子叶和双子叶植物,已成为植物转录因子功能和演化研究的重要信息资源和分析平台。
- 靳进朴郭安源何坤张禾朱其慧陈新高歌罗静初
- 关键词：转录因子
- 高等植物光形态建成过程中基因调控的生物信息学分析
- 何坤
- 关键词：植物基因工程基因转录调节基因
