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陆媛

作品数：3 被引量：9H指数：2
供职机构：江南大学物联网工程学院更多>>
发文基金：国家自然科学基金上海市科学技术委员会资助项目江苏省高技术研究计划项目更多>>
相关领域：自动化与计算机技术更多>>

合作作者

文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 3篇自动化与计算...

主题

  • 3篇聚类
  • 3篇基因表达
  • 3篇基因表达数据
  • 1篇样本聚类
  • 1篇去噪
  • 1篇小波
  • 1篇小波变换
  • 1篇小波去噪
  • 1篇模糊相似关系
  • 1篇聚类方法
  • 1篇聚类分析方法
  • 1篇聚类中心
  • 1篇类方
  • 1篇基因表达数据...
  • 1篇分析方法
  • 1篇波变换

机构

  • 3篇江南大学
  • 1篇北华大学

作者

  • 3篇杨慧中
  • 3篇陆媛
  • 1篇姜永森
  • 1篇陈刚

传媒

  • 2篇计算机工程与...
  • 1篇计算机与应用...

年份

  • 2篇2011
  • 1篇2008
共 3 条 记 录，以下是 1-3
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排序方式：
基于小波去噪和改进的FCM算法的基因表达数据分析被引量：3
2011年
模糊c均值算法是一种局部搜索迭代法,易陷入局部最小解,而且算法未考虑样本对聚类的贡献程度。针对传统的模糊c均值(FCM)算法的不足和基因表达数据高噪声的特点,提出了一种基于小波变换和改进的FCM聚类模型,最后将该模型应用于白血病基因数据分析。根据Xie-Beni指数,在没有先验知识的条件下,确定了最佳聚类个数。为了体现文中提到的算法对样本聚类的准确性,本文分别采用传统的FCM聚类算法和分层聚类的方法在同样的试验条件下进行试验。样本聚类的结果表明:该方法能得到高准确度的样本分型结果。
陈刚陆媛杨慧中
关键词：基因表达数据小波变换样本聚类
基于代表熵的基因表达数据聚类分析方法被引量：4
2008年
针对基因表达数据样本少,维数高的特点,尤其是在样本分型缺乏先验知识的情况下,结合自组织特征映射的优点提出了基于代表熵的双向聚类算法。该算法首先通过自组织特征映射网络(SOM)对基因聚类,根据波动系数挑选特征基因。然后根据代表熵的大小判断基因聚类的好坏,并确定网络的神经元个数。最后采用FCM(Fuzzy C Means)聚类算法对挑选出的特征基因集进行样本分型。将该算法用于两组公开的基因表达数据集,实验结果表明该算法在降低特征维数的同时,得出了较高的聚类准确率。
陆媛杨慧中
关键词：基因表达数据
一种模糊相似关系的基因表达数据聚类方法被引量：2
2011年
对于时间序列的基因表达数据,传统的聚类算法都是以距离为相似性度量标准,没有考虑基因随时间变化的相似趋势。从基因变化的趋势出发,构造了一种新的模糊相似关系矩阵,提出了改进的基于模糊相似关系的聚类算法,并以该算法计算FCM的初始聚类中心。将该方法应用在酵母菌基因表达数据中,实验结果表明该算法不仅克服了FCM算法易陷入局部极小值、对初值敏感的缺点,而且能够发现一些表达模式变化趋势相似的共调控基因。
姜永森陆媛杨慧中
关键词：聚类中心
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共1页<1>
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