邢孟欣
- 作品数:2 被引量:13H指数:2
- 供职机构:中国科学院海洋研究所更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生更多>>
- 养殖大菱鲆肠道微生物多样性及功能分析
- 本课题是利用分子手段和传统培养手段对养殖大菱鲆肠道菌群结构及功能特征进行研究。首先,利用宏基因组测序技术及16S rRNA分析技术对大菱鲆肠道菌群结构进行研究,共得到33,998条拼接序列(contigs)和95条操作分...
- 邢孟欣
- 关键词:大菱鲆肠道宏基因组
- 文献传递
- 不同大菱鲆(Scophthalmus maximus)个体肠道菌群结构差异研究被引量:5
- 2014年
- 目的:肠道微生物能够帮助宿主完成多种生理生化功能,对宿主的健康生长也起到非常重要的作用。大菱鲆(Scophthalmus maximus)是我国北方最重要的海水养殖品种之一。然而,细菌性疾病的频发造成大规模的鱼类死亡。此外,许多大菱鲆致病菌也被证实是人类潜在的致病菌。因此鉴定成年养殖大菱鲆肠道中所包含的核心菌群,并筛选可能与大菱鲆或人类健康密切相关的细菌尤为重要。方法:构建三个大菱鲆个体肠道16S rRNA文库,利用限制性片段长度多态性分析(RFLP)及生物信息学技术研究三个大菱鲆个体肠道菌群结构及多样性。结果:共得到758个阳性克隆,16个OTU类型。分类分析显示,变形菌门在大菱鲆肠道中占优势地位。进一步将细菌按属来分类显示,弧菌属所占的比例最高,约为95.3%。韦恩图显示大菱鲆三个个体共有的OTU类型数量为3,分别占三个大菱鲆个体肠道文库中阳性克隆总数的94.9%、96.7%以及93.5%。分类结果显示它们分别属于条件致病菌哈氏弧菌、副溶血弧菌和创伤弧菌。结论:大菱鲆的核心肠道菌群为弧菌属,它的主要成员哈氏弧菌、副溶血弧菌和创伤弧菌对大菱鲆及人类的健康起到关键的作用。在水产养殖过程中,通过监控这些弧菌种类的浓度变化能够及时对养殖环境进行评价,并及时调整温度、水质等因素,这为预防大菱鲆细菌性疾病,保证人类健康提供重要的理论依据。
- 邢孟欣李贵阳侯战辉曲艳梅刘斌
- 关键词:大菱鲆肠道微生物RRNARFLP