袁梁
- 作品数:25 被引量:153H指数:7
- 供职机构:首都医科大学附属北京同仁医院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家科技重大专项更多>>
- 相关领域:医药卫生理学更多>>
- 18SrRNA基因序列分析在临床常见酵母样真菌鉴定中的应用被引量:7
- 2009年
- 目的 应用18SrRNA基因序列分析技术对临床分离的常见酵母样真菌进行种的分类鉴定,且与传统方法比较,分析基因序列分析法鉴定临床常见酵母样真菌的可行性。方法收集北京同仁医院微生物室菌库酵母样真菌115株,提取的DNA用18SrRNA通用引物进行PCR扩增,扩增产物直接测序,测序结果提交GenBank通过核酸序列比对对微生物种属进行鉴定,同时进行真菌显色培养基鉴定、Vitek32YBC鉴定,比较3种不同方法鉴定酵母样真菌的种鉴定准确率,阐明应用基因序列分析法鉴定临床酵母样真菌的可行性。结果18SrRNA基因序列分析法与表型鉴定法相比较,有13株酵母样真菌鉴定结果存在差异:显色培养基仅鉴定出102株,与基因序列分析鉴定的符合率为89.2%(91/102),Vitek32YBC鉴定结果与基因序列分析鉴定的符合率为91.3%(105/115);显色培养基、Vitek32YBC和18SrRNA基因序列分析鉴定到种的比例分别为88.7%(102/115)、100%(115/115)、100%(115/115)。结论18SrRNA基因序列分析法可对常见酵母样真菌进行准确分类。
- 耿佳靖袁梁鲁辛辛
- 关键词:酵母菌RNA核糖体RNA
- 新技术在微生物检验中的应用被引量:5
- 2009年
- 近年,各种生物技术和不同学科解释生命现象的手段与方法在微生物检验中得到应用。病原微生物种类多,生态学特征各异,传统方法很难对所有病原微生物进行准确鉴定。因此,采用新的微生物检验技术对提高感染性疾病诊断有重要意义。分子诊断最常用的技术是针对病原微生物特异性核酸序列,通过核酸杂交或核酸体外扩增,检测标本中是否存在某种病原微生物。蛋白质、多糖等其他大分子检测技术也将成为微生物检验的重要方法。
- 鲁辛辛袁梁
- 关键词:微生物检验病原微生物分子检测技术生态学特征生命现象生物技术
- SYBR green I实时荧光PCR结合熔解曲线检测HBV B和C基因型的研究被引量:2
- 2009年
- 国内外研究表明HBV基因型与病毒的感染途径、基因突变、疾病进程、抗病毒药物疗效有一定的关系[1-3],了解HBV基因型分布,追溯感染源对判断预后、监测抗病毒用药疗效、选择个体化治疗方案等具有重要应用价值。
- 王利君袁梁鲁辛辛
- 关键词:HBV基因型实时荧光PCRSYBRC基因型个体化治疗方案
- γ-干扰素释放试验与其他三种检测技术临床诊断能力的比较研究被引量:9
- 2015年
- 目的 分析γ-干扰素释放试验(IGRA,本研究采用IGRA-ELISA法)与齐尔-尼尔森(Ziehl-Neelsen)染色法(简称"Z-N法")、结核抗体(TB-Ab)胶体金快速检测方法(简称"TB-Ab法")和荧光探针PCR法(简称"荧光PCR法")等检测技术在北京同仁医院应用于TB辅助诊断中的作用,对IGRA-ELISA检测技术作出客观评价.方法 选取本院2012年8月至2013年7月进行TB诊断的1228例患者作研究对象,其中包括IGRA-ELISA 827例、TB-Ab法306例、Z-N法324例和荧光PCR法83例,共1540例次.采用SPSS 16.0软件统计分析和绘制受试者工作特征(ROC)曲线,计数资料采用x2检验,P<0.05为差异有统计学意义,分别计算各技术ROC曲线下的面积(AUC),比较各技术辅助诊断价值的大小.结果 IGRA-ELISA的阳性检出率为36.0% (298/827),均高于TB-Ab法(6.2%,19/306)、Z-N法(3.1%,10/324)和荧光PCR法(3.6%,3/83),差异有统计学意义(x2值分别为98.6、128.9、35.8,P值均<0.001).IGRA-ELISA的阳性诊断率10.3% (85/827),均高于TB-Ab法(1.3%,4/306)、Z-N法(2.5%,8/324)和荧光PCR法(3.6%,3/83),与TB-Ab法和Z-N法相比较差异有统计学意义(x2值分别为24.8、19.1,P值均<0.001);而与荧光PCR法相比较差异无统计学意义(x2=3.8,P>0.05).IGRA-ELISA的敏感度为97.7% (85/87),均高于TB-Ab法(17.4%,4/23)、Z-N法(28.6%,8/28)和荧光PCR法(25.0%,3/12),差异有统计学意义(x2值分别为76.0、65.4、56.4,P值均<0.001).IGRA-ELISA的特异度为71.2% (527/740),均低于TB-Ab法(94.7%,268/283)、Z-N法(99.3%,294/296)和荧光PCR法(100.0%,71/71),差异有统计学意义(x2值分别为65.1、101.6、27.7,P值均<0.001).IGRA-ELISA的阳性预测值为28.5% (85/298),均低于Z-N法(80.0%,8/10)和荧光PCR法(100.0%,3/3),差异有统计学意义(x2 =12.1,7.3,P值均<0.01);但高于TB-Ab法�
- 张桂袁梁曹晶晶隋文君鲁辛辛
- 关键词:酶联免疫吸附测定聚合酶链反应
- 16S rDNA鉴定标本中病原菌的关键技术研究
- 目的研究直接鉴定标本中病原菌16S rDNA的标本前处理和混合感染标本基因鉴定技术。方法126份标本采用碱裂解法、miniMAG核酸提取试剂盒法、和本实验室开发的两步裂解法三种标本前处理方法,通过PCR检测比较不同前处理...
- 袁梁耿佳靖鲁辛辛
- 关键词:病原菌标本前处理
- 文献传递
- 1050例鼻窦炎病原菌分析被引量:19
- 2018年
- 目的分析鼻窦炎的病原微生物分布及与鼻窦炎感染类型的关系。方法收集2013—2017年诊治的1 050例鼻窦炎患者经鼻内窥镜手术所取的窦腔内容物标本,行直接涂片镜检、普通细菌培养、真菌培养、厌氧菌培养和质谱仪菌种鉴定。统计分析急性和慢性鼻窦炎病原菌分布差异。结果 1 050例鼻窦炎患者分为急性鼻窦炎164例、慢性鼻窦炎384例和真菌性鼻窦炎502例。细菌直接涂片和培养结果一致。经培养鉴定共检出1 283株病原菌,细菌分布为金黄色葡萄球菌177株(13.8%)、铜绿假单胞菌101株(7.9%)、流感嗜血杆菌78株(6.1%)、链球菌属90株(7.0%)、克雷伯菌属54株(4.2%);厌氧菌主要为普雷沃菌14株(1.0%)和具核梭杆菌5株(0.1%);真菌以曲霉200株(15.6%)为主,多伴有细菌的混合感染。急性鼻窦炎多为一种病原菌,慢性鼻窦炎多混合2种以上病原菌。急性和慢性鼻窦炎病原菌中链球菌(χ2=13.819,P<0.01)、肠杆菌科细菌(χ2=9.849,P<0.01)和凝固酶阴性葡萄球菌(χ2=75.407,P<0.01)的分离率差异有统计学意义,其余细菌分离率差异无统计学意义。2013—2016年真菌涂片镜检和培养阳性率分别为66.5%和49.9%;2017年改进真菌培养前处理方法后培养阳性率为87.1%,涂片镜检阳性率为68.8%。结论急性和慢性鼻窦炎致病细菌以金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌和流感嗜血杆菌为主,厌氧菌多为普雷沃菌和具核梭杆菌;真菌性鼻窦炎以曲霉属为主,同时伴有细菌的混合感染。临床应根据细菌和真菌培养结果合理用药。
- 黄艳飞王丽赟王玫岳燕隋文君袁梁王向东鲁辛辛
- 关键词:鼻窦炎细菌金黄色葡萄球菌铜绿假单胞菌曲霉属
- 18S rRNA基因序列分析法鉴定临床常见酵母样真菌
- 目的:应用18S rRNA基因序列分析技术对临床分离的常见酵母样真菌共115株进行种的分类鉴定且与传统方法比较,分析基因序列分析法鉴定临床常见酵母样真菌的可行性。方法:收集北京同仁医院微生物室菌库酵母样真菌115株。提取...
- 耿佳靖鲁辛辛袁梁
- 关键词:直接测序酵母样真菌
- 16S rDNA鉴定标本中病原菌的关键技术研究被引量:3
- 2009年
- 16S rDNA鉴定在纯培养后微生物分类中广泛应用。但纯培养后再基因测序鉴定的方法,无法克服传统培养时间长与受培养条件限制的缺陷。从标本直接鉴定病原菌基因仅需12h,不受培养条件影响。但此项技术在实际临床应用却很少,存在的最大技术难点在于临床标本中含有人类蛋白质、白细胞、组织细胞、多糖等干扰因素。已有文献证明这些组织成分抑制核酸扩增反应,这种抑制作用在脓性的标本中尤为突出。如何找到有效的标本前处理方法,去除干扰因素,同时提取到足够病原菌核酸是直接基因鉴定技术瓶颈之一。
- 袁梁鲁辛辛耿佳靖
- 关键词:DNA鉴定临床标本病原菌基因测序核酸扩增
- 应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术鉴定临床常见厌氧菌
- 目的:应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术对临床分离的厌氧菌进行鉴定,且与传统Vitek32 ANI鉴定卡及16S rRNA基因序列鉴定相比较,分析MALDI-TOF MS技术鉴定临床常见...
- 袁梁顾海彤耿佳靖王玫鲁辛辛
- 关键词:厌氧菌质谱
- 甲型流感病毒抗原及核酸检测联合应用研究被引量:5
- 2021年
- 目的通过大样本流感样病例检测,明确抗原检测与核酸检测两种方法联合应用原则,从而快速明确流感诊断,控制流感暴发,减少资源浪费。方法采集2019年1月至2020年1月北京同仁医院发热门诊的4622份流感样病例咽拭子标本,其中流感季3230份,非流感季1392份,采用快速抗原法和实时荧光逆转录聚合酶链反应(qPCR)两种方法对其进行流感病毒检测。不一致结果采用第二种核酸检测试剂进行比对。比较快速抗原法对于不同年龄敏感度与特异度的差异,以及不同亚型、不同病毒载量的检出差异。结果甲型流感病毒快速抗原法的敏感度为33.7%(577/1710),特异度为93.5%(2723/2912),与qPCR的一致率为71.4%(3300/4622)。在流感季,甲型流感病毒快速抗原法阳性预测值及阴性预测值分别为84.1%(570/678)和57.4%(1464/2552)。在非流感季,其阳性预测值及阴性预测分别为8.0%(7/88)和96.5%(1259/1304)。甲型流感病毒快速抗原法与乙型流感病毒存在交叉反应,为2.3%(18/766)。儿童的敏感度比成人高[56.7%(164/289)比29.1%(413/1421)]。快速抗原法对于不同流感亚型(H1N1和H3N2)的检出率差异无统计学意义(χ2=0.131,P=0.718),其敏感度随循环阈值(Ct值)增大而降低。结论甲型流感病毒快速抗原法阳性结果可确诊。在流感季,甲型流感病毒抗原阴性应进行核酸检测,而非流感季阴性结果可排除感染。快速抗原法对儿童的敏感度比成人高,敏感度与Ct值呈负相关。
- 周倩倩赵建玉隋文君黄艳飞王玫张明新孙宇峰袁梁白婕曹晶晶张韶雅张桂岳燕鲁辛辛
- 关键词:流感病毒A型逆转录聚合酶链反应年龄