石晶
- 作品数：31 被引量：57H指数：5
- 供职机构：宁夏大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金宁夏回族自治区自然科学基金星火计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学医药卫生文化科学更多>>
- 基于压缩氨基酸和支持向量机进行膜蛋白类型识别
- 2013年
- 膜蛋白是一类结构独特的蛋白质,是细胞执行各种功能的物质基础。根据其在细胞膜上的不同存在方式,主要分为六种类型。本文利用压缩的氨基酸对原始膜蛋白序列进行信息压缩,再对压缩序列进行氨基酸组成和顺序特征的提取,最后采用支持向量机构建分类模型。通过五叠交叉验证的结果表明,该方法对于六种膜蛋白的分类预测,准确度最高可达98%以上,平均预测准确度在85%以上,可有效实现膜蛋白六种类型的划分,为进一步分析膜蛋白的结构和功能奠定基础。
- 管翠萍石晶徐惠娟
- 关键词：膜蛋白支持向量机
- 枸杞花药发育基因LbMS2的克隆及表达分析被引量：3
- 2017年
- MS2(Male sterily2)类基因编码脂肪酰基还原酶,参与了花药绒毡层中脂类代谢过程。该研究以宁夏枸杞(‘宁杞1号’)为试验材料,采用RACE方法从枸杞花药cDNA中获得枸杞LbMS2基因。结果显示,LbMS2基因开放阅读框为1 782bp,编码593个氨基酸,等电点为8.98;生物信息学分析显示,LbMS2蛋白定位于叶绿体;LbMS2蛋白序列与茄科植物矮牵牛、茸毛烟草、马铃薯、番茄以及甜辣椒中的MS2蛋白表现出较高的序列相似性;实时荧光定量PCR结果显示,LbMS2基因具有器官表达特异性,只在枸杞花器官中表达,并且在枸杞花药发育的四分体时期以及单核花粉时期表达量最高。研究表明,LbMS2基因是枸杞花器官发育过程中的重要基因。
- 石晶管翠萍郑蕊王丽娟尹颖陈亮
- 关键词：枸杞花药发育
- 枸杞LbXEGIP1基因的克隆与生物信息学分析被引量：1
- 2018年
- 内切葡聚糖酶抑制蛋白(XEGIP)在植物防御病原菌侵袭中扮演了重要角色。本研究以宁夏枸杞(Lycium barbarum L.)‘宁杞1号’为试验材料,采用RACE技术从枸杞花药cDNA中成功克隆了枸杞的XEGIP1基因,命名为LbXEGIP1,GenBank登录号为MG744343。结合生物信息学方法对LbXEGIP1基因编码的蛋白质进行理化性质、信号肽、亚细胞定位、蛋白结构以及系统进化等方面的预测分析。结果表明,该基因CDS序列全长1 290 bp,编码429个氨基酸,预测蛋白分子量为47.39 kD,等电点为8.59,是一个含有一个跨膜区和信号肽区域,脂溶性的稳定蛋白,它的亚细胞定位于细胞分泌途径中。LbXEGIP1属于天冬氨酸蛋白酶A1亚家族,在其N端和C端分别具有葡聚糖酶抑制子结构域。在其二级结构中无规则卷曲所占比例最高(35.66%),其次是延伸链(30.77%)。系统进化分析表明LbXEGIP1蛋白与甜椒中的XEGIP亲缘关系最近。枸杞XEGIP1基因的克隆及生物信息学分析,为后续研究该基因的功能以及枸杞病虫害的防治方面提供了依据。
- 管翠萍王俊文王丽娟郑蕊石晶
- 关键词：枸杞基因克隆生物信息学分析
- 不同物种支原体的比较基因组学研究
- 2014年
- 为了研究不同物种支原体在进化关系、结构组成以及致病因子三方面所存在的异同,试验采用比较基因组学的方法,分析了不同物种来源的21株支原体的进化关系,并以肺炎支原体为例,对来自三个不同物种(猪、牛、羊)的代表株在基因组的组成结构以及整体相似程度方面进行了横向比较分析,并进一步利用相似性比较对这三个物种代表株进行潜在的毒力因子挖掘。结果表明:三个不同物种的肺炎支原体差异较大;猪肺炎支原体内毒力因子的保守性和特异性都较高,牛支原体和山羊支原体中存在较多相似的毒力因子。说明以不同宿主寄生的致病型支原体结构组成上变异较大,但羊与牛的肺炎支原体在致病机理上可能更为相近。
- 管翠萍石晶徐惠娟王俊林周学章
- 关键词：支原体比较基因组学进化树毒力因子
- 分子标志物Lb14-3-3c基因及其应用
- 分子标志物Lb14‑3‑3c基因及其应用，本发明首次将外源基因Lb14‑3‑3c载入含强启动子CaMV35s的植物表达载体中，并将该基因的植物过表达载体转化马铃薯，通过表型观察与PCR阳性鉴定得到5株转基因植株，发现转基...
- 郑蕊岳思君杨立明王丽娟石晶姚新灵陈任张兴冯嘉馨
- 文献传递
- 发菜总RNA提取方法的比较与优化被引量：7
- 2015年
- 发菜是一种具有丰富胶质鞘、色素、多糖的陆生蓝藻。采用Omega RNA提取试剂盒、Trizol RNA提取法、天根试剂盒及优化后的Omega RNA提取试剂盒、Trizol法、天根试剂盒法从发菜藻体中提取RNA,并用核酸浓度测定仪和琼脂糖凝胶电泳检测提取的总RNA质量。结果表明,优化前后的Trizol法均无法提取到发菜总RNA;利用Omega试剂盒获得发菜总RNA已降解;利用天根试剂盒可获得发菜总RNA,进一步改进和优化天根试剂盒的提取程序,获得的发菜总RNA 23S、16S条带清晰,D260 nm/D280 nm、D260 nm/D230 nm分别为2.06、2.08。研究结果为深入开展发菜转录组研究奠定了基础。
- 杨佳吴诗杰王淑萍毛桂莲石晶梁文裕
- 关键词：发菜总RNA
- 浅析水中微生物对水质的影响及防治对策被引量：1
- 2010年
- 自然界的各类水中都存在着种类不同的微生物,有很多种水微生物对人体有害,会造成很疾病,工厂排放水的污水会造成严重的环境污染,所以对水微生物一定要做好检验监测及处理,才能是人们放心使用,让大型工厂的排放水也应处理后达到合格标准,不对环境造成污染做好微生物污染的防治工作。下面我们就水微生物进行探讨,加深对水微生物的认识。
- 汤云木常育石晶
- 宁夏野生花卉植物柳兰生物学特性及开发利用研究被引量：2
- 2013年
- 宁夏柳兰资源丰富,作为最具代表性的野生乡土花卉植物,具有较高的开发利用前景。我们对宁夏野生花卉植物柳兰的生物学特征与开发利用进行了探讨,旨在为其选育与开发利用提供理论依据。
- 王兵刘亚兵石晶王俊
- 关键词：生物学特性
- 枸杞LbSPL6基因的克隆及表达分析被引量：5
- 2021年
- 从实验室前期对枸杞(Lycium barbarum L.)花发育过程转录组测序结果推测,枸杞Squamosa启动子结合蛋白(Squamosa promoter binding protein-like,SPL)转录因子可能在枸杞花发育过程中发挥重要功能。该研究以宁夏特色植物资源枸杞为材料,采用RACE方法克隆LbSPL6基因,通过生物信息学及基因表达分析对该基因进行初步研究。结果表明:(1)成功克隆获得LbSPL6基因,其开放阅读框全长1524 bp,编码507个氨基酸,分子量为55.34 kD;序列分析表明LbSPL6蛋白中包含3个保守基序,且氨基酸序列与茄科植物同源蛋白的氨基酸序列高度相似。(2)qRT-PCR分析证实,LbSPL6基因在枸杞花器官中表达,并且在花药发育的四分体时期及单核花粉时期表达量较高;亚细胞定位实验证明,LbSPL6蛋白定位于细胞核中。该研究结果为进一步研究枸杞LbSPL6转录因子在花发育过程中的功能和作用机制奠定了基础。
- 张红雨梁新华石晶
- 关键词：枸杞基因克隆
- 乌氏体形成·在花粉发育中的作用及研究进展被引量：2
- 2009年
- 绒毡层在花粉发育过程中起到至关重要的作用。乌氏体是绒毡层上特有的结构,它参与绒毡层的降解、花粉外壁的形成。对于乌氏体对识别蛋白的转运作用主要表现在运输营养物质、花粉鞘物质、孢粉素、酶、识别蛋白等。综述了乌氏体的形成过程,参与花粉壁发育的过程以及目前国内外对于乌氏体的研究进展。
- 石晶
- 关键词：绒毡层花粉发育
