王治刚
- 作品数：9 被引量：62H指数：4
- 供职机构：云南大学生命科学学院云南省微生物研究所更多>>
- 发文基金：云南省自然科学基金国家自然科学基金教育部留学回国人员科研启动基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 昆明盐矿古老岩盐沉积中的原核生物多样性被引量：11
- 2007年
- 应用PCR-DGGE和rRNA分析法研究了昆明盐矿古老岩盐沉积中的原核生物多样性。样品的细菌DGGE分析得到27条带,古菌得到18条带。样品与纯培养得到的19个属菌株的DGGE图谱对比分析发现,细菌18个属菌株,只有1个属菌株与样品中的1条带迁移位置都不一致;古菌1个属的菌株不与样品中任何条带迁移位置一致。表明纯培养所得菌株并非该环境中的优势类群。同时,建立了样品细菌和古菌的16S rDNA克隆文库,从中分别挑取36个细菌克隆和20个古菌克隆进行ARDRA分析。细菌可分为10个OTUs,其中3个OTUs是优势类群,分别占38.9%,25.0%,16.7%,其余7个OTUs各含有1个克隆。古菌分为8个OTUs,没有明显的优势类群。每个OTU的代表克隆16S rDNA序列分析表明,细菌分属3大类群:α-Proteobacteria,γ-Proteobacteria和Actinobacteria,以Pseudomonas属菌为优势,含有其它岩盐沉积中没有发现的Actinobacteria。古菌主要是Halorubrum属、Haloterrigena属菌和未培养古菌。本研究表明,昆明盐矿古老岩盐沉积具有较丰富的原核生物多样性,含有大量未知的、未培养或不可培养的原核生物,但在原核生物物种组成和丰度上,免培养与此前的纯培养研究结果存在一定差异。因此,结合使用两类方法才能较全面地认识高盐极端环境微生物的多样性。
- 肖炜彭谦刘宏伟文孟良崔晓龙杨亚玲段东成陈维邓岚李沁元陈义光王治刚任禛刘继辉
- 关键词：RDNAPCR-DGGE克隆文库ARDRA原核生物多样性
- 狮子头热泉菌席样品环境总DNA提取方法的比较研究被引量：1
- 2009年
- 通过对狮子头热泉7个环境菌席样品所提取的总DNA进行纯度检测、提取得率计算和DGGE分析,比较了3种直接和1种间接DNA提取方法。结果表明:综合利用多种裂解方式比单一裂解方式更能充分释放环境DNA;其中3种方法获得的DNA片段能够进行后续16S rDNA扩增;针对同一样品,不同方法提取的环境DNA,可获得不同DGGE群落指纹图谱;间接提取法提取的总DNA,能更好地反映狮子头热采菌席的微生物多样性。
- 任禛王治刚尹敏刘继辉李沁元王永霞崔晓龙
- 关键词：DNA提取方法
- 云南盐矿古老岩盐沉积中的原核生物多样性研究
- 在盐环境这类特殊环境中,蕴藏着丰富的微生物,其所呈现的特殊生物学性质,驱使科学研究人员去探索以盐成分为主导非生物因子的不同生态系统中的生命体、生命现象,力图揭示它们的种群组成、生存适应机理、物种进化的机制与途径等科学问题...
- 刘继辉王永霞王治刚赖泳红彭谦徐丽华崔晓龙
- 文献传递
- 云南盐矿高盐环境中原核生物新类群的系统学研究
- 从云南盐矿高盐环境中分离到300多株细菌菌株,归属于4个细菌类群:变形杆菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroides)、厚壁菌门(Fimicutes)和放线菌门(Actinobacteria)的...
- 王永霞刘继辉王治刚赖泳红彭谦徐丽华崔晓龙
- 文献传递
- 云南腾冲热海狮子头热泉的原核生物多样性
- 云南腾冲热海热田位于北纬24°57′,东经98°26′,海拔高度为1120—1893m,是我国三大地热区之一。全区目前发现有64处地热活动区,气泉、温泉群共有80余处。多项研究表明腾冲地热的热泉中蕴涵着丰富的微生物多样性...
- 任禛王治刚王永霞刘继辉赖泳红彭谦崔晓龙
- 文献传递
- 云南两盐矿古老岩盐沉积中的原核生物多样性研究
- 在盐环境这类特殊环境中，蕴藏着丰富的微生物，其所呈现的特殊生物学性质，驱使科学研究人员去探索以盐成分为主导非生物因子的不同生态系统中的生命体、生命现象，力图揭示它们的种群组成、生存适应机理、物种进化的机制与途径等科学问题...
- 王治刚
- 关键词：原核微生物微生物多样性
- 文献传递
- 一平浪盐矿古老岩盐沉积中可培养细菌的系统发育多样性研究被引量：25
- 2007年
- 运用纯培养法和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析对云南省一平浪盐矿古老岩盐沉积中可培养细菌的多样性进行了研究。用补充0.5-3.5mol/L NaCl的MBA和ISP2琼脂培养基从卤水、岩盐和盐土样品中分离到38株细菌,用细菌通用引物进行16S rRNA基因扩增和序列测定,用相关软件进行序列相似性搜索、比对和系统发育分析。结果表明,38个分离菌株可分为31个物种,属于4个大的系统发育类群（Proteobacteria,Bacteroidetes,Firmicutes,Actinobacteria）、17个科、24个属。多数菌株属于Proteobacteria门（18株,47.3%;Gamma-Proteobacteria,31.5%;Alpha-Proteobacteria,15.8%）和Firmicutes门（13株,34.2%）。这些分离菌株中,至少有3个菌株可能代表3个不同属的3个新物种：Y3、Y15和Y25分别代表Idiomarina属、Salinicoccus属和Saccharospirillum属的新物种;而菌株Y21有可能代表Staphylococcaceae科的一个新属。从以上结果可以看出,一平浪盐矿古老岩盐沉积中存在较为丰富的微生物物种多样性和系统发育多样性,并且潜藏着新的微生物资源。
- 陈义光李汇明李沁元陈维崔晓龙杨亚玲彭谦文孟良徐丽华邓岚王治刚刘继辉任禛肖炜刘宏伟
- 关键词：古老岩盐沉积可培养细菌RRNA基因系统发育分析细菌多样性
- 高温环境样品总DNA直接和间接提取方法的比较被引量：8
- 2006年
- 分别采用两种环境总DNA直接提取法和一种间接提取法从6种温泉菌席样品中提取总DNA,以DNA粗产物的纯度、能否用于后续PCR扩增及PCR-DGGE(变性梯度凝胶电泳)所反映的微生物多样性为评价指标对两类方法进行比较和评价。研究发现,虽然间接提取法效率低下,但对于高温极端环境中生物量较小的样品,间接法能得到有研究价值的、纯度较高的环境样品总DNA,而直接法得到的DNA量小且不适于PCR扩增操作。在使用这2类方法都能得到可用于研究操作的DNA的情况下,间接提取法能更好的体现环境样品中微生物的多样性。
- 刘宏伟彭谦李沁元肖炜崔晓龙林连兵刘志坚姜成林徐丽华陈义光王治刚任禛邓岚文孟良
- 昆明盐矿古老岩盐沉积中可培养细菌多样性研究被引量：28
- 2006年
- 为了了解昆明盐矿古老岩盐沉积中可培养细菌的多样性，用MBA和ISP2分离和培养了昆明盐矿卤水和盐晶中的细菌44株。发现盐晶中的可培养好氧细胞数量（3．1×10^3～3．7×10^6CFU／g）远远高于卤水中的数量（1．3-6．3×10^3CFU／L）。分离所得纯培养物的16S rDNA序列系统发育分析结果表明，44株菌可分为4大类群34个不同的分类单元（16S rDNA序列相似性大于97％为同一分类单元）。24株属于厚壁菌门（Firmicutes，54．6％），2株属于变形菌门α亚群（α-Proterbacteria，4．6％），4株属于变形菌门γ亚群（γ-Proterbacteria，9．1％），14株属于放线细菌门（Actinobacteria，31．7％）。卤水和盐晶中的优势菌都是Bacillus属菌（26．1％和59．9％）。据16S rDNA序列相似性分析发现7株菌为可能的新种或属。此外，还筛选到7株抗菌活性菌株。研究表明，昆明盐矿古老岩盐沉积中，不仅含有较为丰富的微生物物种多样性，并且存在许多未被认识的新物种和生物活性菌株，为古老岩盐沉积中微生物的深入研究奠定了基础。
- 肖炜杨亚玲刘宏伟文孟良崔晓龙段东成陈维彭谦陈义光邓岚李沁元王治刚任禛徐丽华
- 关键词：可培养细菌多样性古老岩盐沉积
