李正红 作品数:135 被引量:472 H指数:12 供职机构: 中国林业科学研究院 更多>> 发文基金: 引进国际先进农业科技计划 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项 云南省科技攻关计划 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 轻工技术与工程 化学工程 更多>>
滇东南濒危植物长梗杜鹃转录组微卫星特征分析 被引量:13 2017年 [目的]全面了解滇东南特有濒危植物长梗杜鹃转录组SSR位点的分布及序列特征,为长梗杜鹃的保护和合理开发利用提供遗传学资料,为同属植物及近缘种SSR标记的开发及遗传研究提供便利。[方法]利用Illumina Hiseq 4000高通量测序平台对长梗杜鹃叶片进行转录组测序,再通过MISA软件对测序所得Unigenes进行SSR位点的发掘和分析。[结果]发现含SSR的序列17 354条,共得到23 192个SSR,出现频率为31.30%,平均每3 kb出现1个SSR。二碱基和三碱基重复为长梗杜鹃SSR主要重复单元类型,分别占SSR总数的69.25%和15.07%,187种重复基元中,所占比例最高的是(AG/CT)n(62.01%),其次是(A/T)n(12.34%)、(AC/GT)n(4.52%)和(AAG/CTT)n(4.23%)。在SSR和CDS的交集基因中,共发现15 908个SSR位点,其中2 792个位于编码区,出现频率为0.076 SSR/kb,而非编码区为0.344 SSR/kb,在基因编码区中出现频率最高的是三碱基重复(1 356,48.57%)。在不同长度重复单元中,二碱基重复SSR长度变异程度最高,其次是单碱基重复。长梗杜鹃SSR的频率和长度呈显著负相关(P<0.01),相关系数为-0.566。[结论]长梗杜鹃转录组SSR位点的出现频率高、分布密度大、基元类型丰富、重复次数较高、长片段较多,具有较高的多态性潜能,用于遗传分析的潜力很大,能满足该物种的保护遗传学研究。 李太强 刘雄芳 万友名 李正红 李钰莹 刘秀贤 马宏关键词:转录组 通过体胚发生途径建立地锦再生体系的方法 本发明涉及以地锦成熟胚为材料建立其再生体系的方法,包括三个培养阶段:(1)成熟胚切块培养诱导愈伤组织;(2)愈伤组织继代培养;(3)愈伤组织中体细胞胚的发生和体细胞胚发育成植株。在继代培养中采用分步降低2,4-二氯苯氧乙... 孙振元 李正红 江泽慧 巨关升 韩蕾 刘会超 杨学军文献传递 通过体胚发生途径建立五叶地锦高频再生体系的方法 本发明涉及以五叶地锦成熟胚为材料建立其再生体系的方法,包括三个培养阶段:(1)成熟胚剥离后培养诱导愈伤组织;(2)愈伤组织继代培养;(3)愈伤组织中体细胞胚的发生和胚状体发育成植株。在继代培养中采用分步降低2,4-二氯苯... 孙振元 李正红 江泽慧 巨关升 韩蕾 杨学军 李云文献传递 木豆新品种‘CAF3’ 被引量:1 2010年 ‘CAF3’是运用单株选择和集团选择育种手段,从引种自印度的木豆品种‘ICPH3432’F1的后代群体中选育出的木豆新品种。生育期159-162d,平均单株荚数(470.1±177.1)个,每荚粒数(3.5±0.3)粒,种子百粒质量(8.99±0.53)g,单株粒质量(104.17±25.65)g。 马宏 李正红 刘秀贤 谷勇 万友名 李立 梁宁关键词:木豆 木豆石豆率与栽培地、种皮色及浸泡方法的相关性研究 被引量:2 2002年 Pigeonpea ( Cajanus cajan (L ) Millsp) with different coat color from 8 counties of Yunnan and 2 check varieties from India were soaked in different methods The stiff seed ration was determined, and the variance analysis was used The results show that a)the stiff seed ration is markedly related to coat color , growing fields, soak time and so on; b) pigeonpea seeds with light coat color has lower stiff seed ration; c) the stiff seed ration treated by boiling water and cold water has no marked difference; d) the stiff seed ration of the pigeonpea landrace from Donchuan was the 张建云 李正红 周朝鸿 惠雅玲 刘秀贤 肖银松关键词:栽培地 木豆 浸泡处理 地涌金莲新品种‘佛喜金莲’ 被引量:6 2013年 ‘佛喜金莲’是从地涌金莲野生种群的天然变异植株中选育出的新品种。多年生大型草本,具叶鞘联合形成的假茎;株形伸展,株高(67.3±4.6)cm;叶片卵圆形,叶形指数1.49~1.62,叶片羽状侧脉凸出明显,背面中脉基部红色,至顶端约1/2处减淡为绿色;苞片卵状三角形,腹面自顶端至基部约7/10为橙红色,基部约3/10为黄橙色,背面橙红色;观赏性好。 万友名 李正红 马宏 刘秀贤关键词:地涌金莲 云南干热河谷地区余甘子转录组分析 被引量:2 2018年 [目的]对云南干热河谷地区余甘子转录组特征进行描述,旨在为余甘子微卫星标记的开发和功能基因的挖掘提供较全面的背景信息。[方法]采用Illumina Hiseq 4000测序平台对余甘子叶片进行转录组测序,对原始数据进行过滤、de novo组装及聚类去冗余等处理后,再与公共数据库进行比对,对Unigenes进行基本功能注释、CDS预测、TF编码能力预测及R-Gene预测等分析。[结果]本研究共获得10. 52 Gb的Clean reads,Q20、Q30分别为98. 47%、95. 28%。组装并去冗余后获得76 881条Unigenes,平均长度、N50分别为713、1 257 nt。通过与NR、COG、KEGG和Swiss Prot数据库进行比对,44 768条Unigenes获得功能注释。余甘子转录组Unigenes根据COG功能注释信息大致分为25类;按GO功能注释信息划分为生物学过程、细胞组分和分子功能3大类47亚类;参考KEGG注释信息,可归为6大代谢通路、21类代谢途径,其中约3/5为代谢相关通路。根据以上注释结果共检测出42 953个CDS,其余未比对上的Unigenes用ESTScan预测后得到2 058个CDS。同时,预测到56个TF家族以及18种RGene。[结论]本研究获得的余甘子转录组Unigenes序列的组装质量较高、完整性较好、基因丰富、功能多样,极大地扩充了余甘子基因信息库,为今后余甘子乃至叶下珠属植物功能基因挖掘、抗性机理分析、分子标记开发、分子辅助育种等研究提供了重要的基础数据。 刘雄芳 李太强 李正红 万友名 刘秀贤 张序 安静 马宏关键词:转录组 UNIGENE 功能注释 转录因子 抗性基因 极小种群野生植物波叶杜鹃的花部特征和繁育系统研究 被引量:3 2023年 [目的]研究极小种群野生植物波叶杜鹃(Rhododendron hemsleyanum)的花部特征和繁育系统,为其作为乡土园林树种推广提供遗传育种理论基础。[方法]对四川峨眉山波叶杜鹃野生居群资源现状进行深入调查,研究其花部形态、花粉—胚珠比、杂交指数和昆虫访花行为等,并结合人工控制授粉试验对其繁育系统展开研究。[结果]5月中旬为波叶杜鹃的盛花期;其杂交指数为5,花粉—胚珠比为640.93±65.52;自然对照结实率为56.67%,异株异花传粉结实率为86.67%;主要访花者是中华蜜蜂(Apis cerana)和排蜂(A.dorsata)。[结论]波叶杜鹃的最佳授粉时期为盛花期(开花第3~6天),其繁育系统是倾向于异交的混合交配系统,自然条件下有效传粉者为中华蜜蜂和排蜂。 谢孟 马永鹏 曹毓蓉 刘德团 李正红 马宏关键词:花部特征 访花昆虫 木豆籽实加工豆沙初步研究 被引量:3 2002年 对木豆籽实加工豆沙的生产工艺进行了初步研究 ,并研制出营养丰富、风味独特的豆沙 。 刘秀贤 李正红 张建云 惠亚玲关键词:木豆 生产工艺 豆沙 营养价值 地涌金莲野生与栽培种群遗传多样性RAPD分析 被引量:12 2007年 利用RAPD分子标记技术对采自滇川两省的12个地涌金莲野生和栽培种群进行遗传多样性分析。选择10条随机引物在12个种群中共扩增出88条带,其中多态性带85条,整个种的多态性位点百分比PPB为96.59%,遗传多样性指数日为0.2890以及Shannon信息指数,为0.4416。种群间的遗传分化系数Gst为0.5682,即43.18%的遗传变异来自于种群内,56.82%的遗传变异来自于种群间,种群问的遗传分化水平略高于种群内。种群问遗传一致度变化范围为在0.66~0.95之间。聚类结果显示:野生种群之间遗传距离较近,与地理分布基本相一致;栽培种群遗传距离较远,与地理分布不一致。 潘庆杰 李正红 王雁 田杰 谷勇 刘秀贤关键词:地涌金莲 RAPD 聚类分析