李敬瑞
- 作品数：15 被引量：102H指数：5
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- 利用DNA池对3个山羊品种CXCL10基因多态性的研究被引量：2
- 2012年
- 为了研究3个山羊品种(黔北麻羊、内蒙古绒山羊、关东奶山羊)CXCL10基因多态性,试验采用构建DNA池并直接对其测序的方法进行分析。结果表明:快速筛查到2个与繁殖性能相关的单核苷酸多态性(T-131-C,G-661-A)。进一步利用测序图中的SNP等位基因峰高的比值估算各山羊品种等位基因的频率。
- 陈志李敬瑞刘若余张依裕罗卫星蔡惠芬
- 利用DNA池和测序技术快速筛查SNPs及估算基因频率被引量：11
- 2011年
- 选取具有明显品种差异的3个猪品种(可乐猪、白香猪和大约克)构建品种DNA池,采用PCR产物直接测序法研究公猪外周致密纤维(ODFP)基因3'UTR、CDS、5'UTR序列(994 bp)的多态性,快速筛查到2个可能与精液品质相关的SNPs(C675T、C786T);其中,C675T导致天冬氨酸变成异亮氨酸。进一步利用测序图中SNPs等位基因峰高的比值估算各猪品种等位基因的频率。
- 李敬瑞丁远华张玉龙王邦荣刘若余
- 关键词：测序SNPS基因频率
- 山羊GHRH-R基因SNPs的快速筛查及基因频率估算被引量：3
- 2011年
- 为进一步开展山羊GHRH-R基因的表达调控、分子标记辅助育种及比较基因组学等的研究,采用构建DNA池并用直接测序的方法,研究了黔北麻羊、内蒙古绒山羊和关东奶山羊3个山羊品种GH-RH-R基因的多态性,并估算其等位基因频率。结果表明:在黔北麻羊GHRH-R基因中发现2个SNPs(T-640-C,G-811-T),第8内含子640bp、811bp处分别发生了T→C、C→T碱基转换;等位基因频率T-640为0.500,C-640为0.500,C-811为0.387,T-811为0.613;关中奶山羊和内蒙古白绒山羊在640bp、811bp处没有发生碱基突变。
- 陈志刘若余罗卫星蔡惠芬李敬瑞
- 关键词：SNPS基因频率
- 山羊TGFB3基因的多态性及生物学信息分析被引量：2
- 2011年
- 为了解山羊TGFB3基因的多态性,并为优秀山羊品种的选育提供理论依据,选择牛TGFB3基因组序列(NM_001101183)设计1对特异性引物,采用DNA池PCR直接测序法快速检测黔北麻羊、内蒙古白绒山羊和关中奶山羊3个山羊品种的TGFB3基因的多态性。结果表明,只在黔北麻羊TGFB3基因第1外显子212bp处发现1个多态性(SNP)位点(G-212-A)。利用生物信息学分析TGFB3基因5’侧翼调控序列,转录因子结合位点96分以上的有28个(CdxA有2个,HSF有18个,ADR1有2个,AML1a有1个,GCR11有3个,cap有1个,RY有1个),在TGFB3基因5’调控区没有发现CpG island。
- 蔡惠芬陈志罗卫星刘若余张依裕李敬瑞
- 关键词：山羊多态性
- 基于线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)序列分析贵妃鸡的遗传多样性被引量：20
- 2012年
- 采用PCR产物直接测序技术对30只贵妃鸡样品的线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)第Ⅰ高变区序列进行了分析。结果表明,在所分析的D-loop区部分序列中(520 bp),A、G、C、T平均含量分别为26.8%、13.0%、31.1%和29.1%;共发现13个核苷酸多态位点,均为转换位点,未检测到插入/缺失和颠换,核苷酸多样度(Pi)为0.0059,单倍型变异度(Hd)为0.538,中性检验Tajima’s D值为-0.67065。通过群体构建的NJ聚类图分子系统树发现,贵妃鸡起源于红原鸡。
- 吴婵李辉李敬瑞张大权谢国午孔嫣易恒洁
- 关键词：贵妃鸡线粒体DNAD-LOOP单倍型
- 山羊成纤维生长因子受体(FGFR1)基因的多态性检测被引量：1
- 2011年
- 选择与羊同源性较高的牛FGFR1基因组序列(NM_001110207)设计3对特异性引物,采用DNA池PCR直接测序法快速检测黔北麻羊FGFR1基因的多态性,并以内蒙古白绒山羊和关中奶山羊比较,结果表明:在引PCR产物中只有黔北麻羊检测到多态,分别处于外显子5和内含子5的T133C和C211T的碱基突变,而其他2个品种没有检测到多态1,33位的优势等位基因为C,频率为0.8242,11位的优势等位基因为T,频率为0.806;在引物FGF-1和FGF-3在3个品种中均未发现变异位点。
- 蔡惠芬陈志罗卫星刘若余张依裕李敬瑞
- 关键词：山羊SNPS
- 猪基质Gla蛋白基因序列多态及生物信息学分析被引量：1
- 2011年
- 选择具有明显品种差异的3个猪品种(可乐猪、白香猪和大约克)构建品种DNA池,采用PCR产物直接测序法研究公猪MGP基因5′侧翼调控区、外显子1共1 112 bp范围内可能与精液品质相关的序列多态性,快速筛查到两个SNPs(C-849T、C-895T)。进一步利用生物信息学分析MGP基因5′侧翼调控序列。预测出评分为95分以上的转录因子结合位点有31个,发现了CpG岛。C-849T和C-895T的变异则使白香猪比可乐猪和大约克多出了两个HSF可能的结合位点(85.9分)。1个TATA可能的结合位点(91.4分),1个cdxA可能的结合位点(92.9分)。研究结果为进一步研究MGP转录效率以及对猪精液品质的影响奠定基础。
- 李敬瑞向程举刘章忠张义玲刘若余
- 关键词：SNPS生物信息学
- 凯里宏大猪场妊娠母猪舍的建设规划及应用探讨被引量：3
- 2010年
- 对凯里市宏大种猪场妊娠母猪舍的建设规划、建筑妊娠所用材料、结构的科学性、合理性作了介绍,并对其舍内温度、湿度、母猪饲养方面进行了讨论。
- 余琼申学林蒲学栋李敬瑞
- 关键词：母猪舍
- 基于线粒体细胞色素b基因全序列分析贵妃鸡的遗传多样性被引量：3
- 2013年
- 为了利用线粒体细胞色素b(Cyt b)基因全序列分析贵妃鸡的遗传多样性,试验采用PCR和直接测序法分析贵妃鸡的种群遗传结构,共获得了30个样本的线粒体Cyt b基因全长(约1 143 bp)序列。结果发现:4个变异位点,界定了5种单倍型,无插入、缺失和颠换,并且变异位点多发生在密码子的第2位点;贵妃鸡群体核苷酸多样度(Pi)为0.000 45,单倍型变异度(Hd)为0.386±0.020,群体平均核苷酸差异数(K)为0.515;由邻接法(NJ)分子系统树可知,贵妃鸡所有个体均起源于红色原鸡。
- 吴婵李辉李敬瑞张大权易恒洁
- 关键词：贵妃鸡单倍型
- 猪DAZ基因的DNA池测序分析被引量：18
- 2011年
- 选取大约克猪、白香猪、可乐猪3个猪种的公猪构建品种DNA池。对DAZ基因的部分CDS区和3′UTR进行PCR扩增,并对PCR产物进行测序。结果表明,3个猪种中,DAZ基因的该序列未发现任何突变。同源性分析结果表明,猪与人、猩猩、猴、鼠、牛的DAZ基因该序列核苷酸同源性分别为97.0%、95.2%、96.1%、92.9%、97.0%。说明在哺乳动物中,其DAZ基因CDS部分序列和3′UTR是高度保守的。系统进化分析结果表明,猪和牛在一个进化支上。蛋白疏水性分析表明,在17-20位有个强疏水区。
- 李敬瑞丁远华向程举刘若余
- 关键词：DAZ基因测序
