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朱波: 作品数：64 被引量：162H指数：8; 供职机构：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所更多>>; 发文基金：国家自然科学基金国家肉牛牦牛产业技术体系项目中国农业科学院北京畜牧兽医研究所基本科研业务费更多>>; 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>

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华西牛亲缘关系鉴定的SNP分子标记组合和应用及鉴定方法: 本发明公开了华西牛亲缘关系鉴定的SNP分子标记组合和应用及鉴定方法，属于基因分型技术领域。本发明提供了一种用于华西牛亲缘关系鉴定的SNP分子标记组合，利用1,000个位点中的至少70个即可完成华西牛亲缘关系的鉴定。本发明...; 高雪朱波李俊雅王元清高会江陈燕张路培王泽昭

机器学习全基因组选择研究进展: 2024年; 机器学习方法是全基因组选择研究的重要分支,深度学习是近年来机器学习领域新的研究热点。本文介绍了机器学习以及深度学习全基因组选择研究的原理和应用发展,分别从模型框架、模型参数、特征选择等方面对深度学习全基因组育种值估计研究进展进行了阐述,探讨了深度学习全基因组选择研究中面临的一些的问题,并对未来进行了展望。; 李竟张元旭王泽昭陈燕徐凌洋张路培高雪高会江李俊雅朱波郭鹏; 关键词：全基因组选择

大动物颈静脉专用采血针: 本实用新型公开了大动物颈静脉专用采血针，包括针头和调节机构，所述针头的底部设置有连接管，且连接管的外壁左侧设置有防护机构，所述调节机构安置于连接管的外壁右侧，且连接管的底部连接有竖管，所述竖管的外壁活动设置有软管，且软管...; 徐凌洋朱波张路培高会江李俊雅; 文献传递

基于单倍型肉牛屠宰性状全基因组关联分析研究被引量：1: 2022年; 单倍型标记与数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL)之间具有较强的连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)关系,在基因定位和因果突变鉴定方面具有较高的应用价值。为了评估单倍型标记在基因组研究中的作用,本研究在华西牛资源群体中,选取该群体于2008—2021年间屠宰的共计1478头平均月龄为24个月的个体进行研究,其中公牛1333头,母牛145头。利用770K高密度芯片数据,基于LD阈值(r^(2)>0.3)及固定单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)个数(5个连续SNP)两种方法进行单倍型构建,分别采用单位点SNP标记和两种单倍型标记共3种标记,基于GCTA的混合线性模型(mixed linear model,MLM),开展宰前活重(LW)和屠宰率(DP)等屠宰性状的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),定位影响屠宰性状的显著(P<0.05)SNPs、单倍型块和候选基因,同时比较3种标记的GWAS结果,评估3种标记的优劣。结果显示,3种标记在全基因组范围内共找到16个的显著SNPs及单倍型区域,主要分布于1、5、6、14、16、17和28号染色体上,同时鉴定到FAM184B、PPM1K、LCORL、RIMS2等10个与屠宰性状相关的候选基因,其中,基于SNP标记方法鉴定到的3个候选基因,在利用基于单倍型标记的方法中也鉴定到,且单倍型鉴定到的显著性位点或区域大多位于基因内部。在两种单倍型构建方法中,与基于固定SNP个数构建单倍型进行GWAS相比,基于LD阈值的构建方法鉴定到了更多候选基因。本研究结果表明,以单倍型开展GWAS可以综合考虑SNP位点间连锁关系,能较好地揭示复杂性状的遗传结构。; 李宏伟徐凌洋王泽昭蔡文涛朱波陈燕高雪张路培高会江李俊雅; 关键词：肉牛单倍型单核苷酸多态性全基因组关联分析

华西牛基因组选择方法: 本发明公开了华西牛基因组选择方法，要解决的是现有肉牛育种群制种供种能力不足的问题。本发明的具体步骤如下：步骤一，构建参考群体并且测定经济性状；步骤二，对参考群体进行基因分型并且对数据进行处理和质量控制；步骤三，进行基因型...; 李俊雅朱波高会江高雪张路培徐凌洋陈燕蔡文涛; 文献传递

利用混合线性模型和BayesCPi进行QTL-MAS2011公共数据集的全基因组关联分析被引量：1: 2014年; 本研究利用MTDFREML对QTL-MAS2011公共数据集的模拟性状进行方差组分估计,遗传力估计约为0.29。主成分分析显示,群体内不存在显著的群体分层现象,然后用2种模型进行全基因组关联分析研究。利用GAPIT程序包中的混合线性模型对QTL-MAS2011公共数据进行全基因组关联分析,共得到10个显著的单核苷酸(SNP)位点(P<0.05),其中,4个显著的SNPs在1号染色体上,4个显著的SNPs在3号染色体上,2个显著的SNPs在5号染色体上。使用HAPLOVIEW软件对1~3号染色体上88个SNPs进行连锁不平衡(Linkage disequilibrium,LD)分析,确定2个QTLs(QTL1和QTL5)分别在1号和3号染色体上,2、4、5号染色体没有检测到QTL。利用BayesCPi模型进行全基因组关联分析研究,通过基因组窗口效应方差图谱确定1个QTL在1号染色体上,2个QTL在2号染色体上,1个QTL在3号染色体上。; 朱波吴洋齐欣牛红张静静王延晖陈燕张路培高会江高雪李俊雅孙少华; 关键词：混合线性模型贝叶斯模型全基因组关联分析单核苷酸多态性

全基因组选择在畜禽育种中的应用进展: 梁永虎朱波高会江徐凌洋常天鹏张文刚夏江威牛红李俊雅

华西牛新品种培育及对我国肉牛育种的启示被引量：2: 2023年; 良种是肉牛业发展的关键和核心竞争力,而我国肉牛育种起步较晚,品种开发利用率低,繁育体系不完善,核心种源对外依存度高,产业可持续发展受到制约。以专用化肉牛新品种——华西牛培育为例,从华西牛培育历程,到华西牛繁育体系建设以及种牛推广模式进行了详细概述和分析,期望为建立符合我国国情的肉牛育种体系提供参考和借鉴。; 张天留王泽昭朱波陈燕张路培徐凌洋高会江高雪李俊雅; 关键词：新品种培育育种体系

肉用西门塔尔牛群体生长曲线拟合及体重与体尺相关性分析的研究被引量：37: 2018年; 旨在对内蒙古乌拉盖地区肉用西门塔尔牛群体的体重和体尺等性状进行分析,研究其生长发育规律并构建通过体尺预测体重的回归方程。本研究测定了2 162头肉用西门塔尔牛从出生到20月龄的体重、体高、十字部高、体斜长、胸围和腹围,利用Logistic、Brody、Gompertz和Bertallanffy 4种模型拟合其生长曲线,分别估算出4种曲线方程中的相关参数,并进行体重与体尺的相关性与回归分析。结果表明,4种曲线模型对肉用西门塔尔牛体重和体尺生长过程均有较好的拟合度(R^2>0.98),但对于不同的性状,最佳拟合模型不同。体重与体尺相关关系表明,体重与体斜长、胸围、腹围的相关性较高,其中体重与胸围的相关系数最高(0.958 55)。其体尺与体重之间呈极显著正相关关系。预测体重回归方程为Y=-366.485 70+1.307 37 X_3+3.896 12 X_4-0.417 50 X_5。研究表明,Gompertz和Bertallanffy两种模型对体重的拟合优于其他两种模型,Brody模型对体高、体斜长、胸围、腹围和十字部高的拟合效果均是最优。体重预测回归方程具有统计学意义,为肉用西门塔尔牛群体的进一步选育提供数据基础。; 梁永虎朱波金生云宝金山徐凌洋陈燕高雪张路培高会江李俊雅

肉用西门塔尔牛6号染色体上与脾脏重相关的SNP位点及应用: 本发明提供了肉用西门塔尔牛6号染色体上与脾脏重相关的SNP位点及应用，所述SNP标记的位点为国际牛参考基因组UMD3.1版本6号染色体上第38852378个核苷酸位点，该位点的碱基是G或A。本发明通过优选该SNP的优势等...; 刘影朱波李俊雅徐玲庄站伟徐凌洋张路培高会江高雪陈燕蔡文涛; 文献传递

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