文奇
- 作品数：16 被引量：46H指数：4
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- 荧光PCR、常规PCR和细胞培养在流感检测中的对比分析被引量：5
- 2014年
- 目的比较当地已有的3种流感病毒检测方法的差异,以确定它们在不同情形下的适用方向。方法通过荧光PCR(聚合酶链反应)、常规PCR和细胞培养3种方法同时检测413份流感样病例(ILI)咽拭子样本,计算出它们的灵敏度和特异度,并进行统计分析。结果荧光PCR、常规PCR和细胞培养的阳性检测率分别为20.34%、15.25%、11.86%;相对于荧光PCR,常规PCR的灵敏度和特异度分别为75%、100%,细胞培养的灵敏度和特异度分别为56%、99.39%;与常规PCR相比,细胞培养的灵敏度为75%,特异度为99.43%。结论 3种方法在灵敏度方面相差很大,但在特异性上几乎没有差异。由于荧光PCR和常规PCR具有很高的灵敏度,并且检测速度快,适用于暴发疫情的应急诊断;细胞培养作为一种经典的病原学检测方法,可以获得流感毒株,用来开展抗原性、基因特性和耐药性等深入研究。
- 文奇付倩潘虹刘琴
- 关键词：荧光PCR常规PCR细胞培养流感病毒
- 2011年-2015年新余市手足口病流行特征分析
- 2016年
- 目的分析新余市手足口病的流行特征,为手足口病的防控提供科学依据。方法采用实时荧光定量PCR对2011年-2015年手足口病咽拭子、疱疹液监测样本进行肠道病毒通用核酸、肠道病毒71型（EV71）、柯萨奇病毒A组16型（Cox A16）扩增,用描述性方法进行流行病学分析。结果 2011年-2015年新余市共监测手足口病811例,总阳性率为46.12%,其中EV71型109例（13.44%）,Cox A16型94例（11.59%）,其他肠道病毒171例（21.09%）。2015年3月-5月为流行高峰,2013年在冬季出现小高峰。不同性别的EV71型和Cox A16型手足口病阳性率差异无统计学意义（χ~2=0.92,P〉0.05）。病例主要集中在0岁~4岁儿童,共757例,占93.3%,1岁~5岁病例的手足口病阳性率较高。结论 EV71和Cox A16型手足口病在新余市交替流行,仍应加强其他型别肠道病毒病例的监测。手足口病发病呈现明显的季节性和人群特征,提示要加强春夏之交及气温反常时5岁以下儿童的手足口病防控。
- 潘虹胡志勇毛尚根周银古文奇刘琴
- 关键词：手足口病肠道病毒71型柯萨奇病毒A组16型
- 甲型H1N1流感监测及其HA1基因特性分析,以2013~2014年新余市为例被引量：2
- 2015年
- 因HA基因的头部重链区（HA1）是流感病毒的抗原位点和受体结合位点,所以了解流感病毒的HA1基因特性可以评估当前WHO推荐的疫苗株的预防效果。本文选取新余市2013-2014年通过狗肾传代细胞（MDCK）培养分离到的H1N1流感毒株12株,提取病毒RNA,反转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增HA1基因片段。对序列分析发现2013-2014年新余市甲型H1N1流感病毒HA1基因序列与疫苗推荐株有较高的同源性,核苷酸同源性97.9%-98.5%。2013年的6株毒株HA1区与疫苗株比较,氨基酸变异位点7-11个,其中3株有2个变异位点在不同的抗原决定簇区。而2014年毒株单独集中在进化树的一支。以上提示,目前流感疫苗对2014年的流感人群仍有保护作用,对2013年的部分流行的H1N1预防效果有限;甲型H1N1爆发流行的可能性很大,应加强防控。
- 潘虹刘瑞弘文奇刘琴周银古熊英
- 关键词：血凝素基因进化分析
- 新余市流感监测标本质量评估分析被引量：2
- 2014年
- 目的探讨和评估新余市流感监测哨点医院在流感样病例(ILC)选择、标本采集和保存环节中可能存在的问题,以便采取恰当的措施提高本地区流感监测效果。方法对哨点组和非哨点组在2013年2月-4月时期内所采集的咽拭子标本进行荧光PCR(聚合酶链反应)检测和病毒培养,分别计算出2组标本荧光PCR检测的阳性率、荧光PCR检测与病毒分离的阳性一致率,并进行统计学分析。结果经χ2检验,哨点组和非哨点组的荧光PCR检测阳性率之间有差异,但阳性一致率之间并无差异。另外,当标本荧光PCR检测的Ct(域值循环数)值>30时病毒分离阳性率大为下降。结论新余市流感监测哨点医院的标本质量不高。
- 文奇潘虹刘瑞弘付倩宋利军
- 关键词：流感监测标本
- 新余市甲型流感病毒M基因进化及金刚烷胺类耐药性分析被引量：6
- 2017年
- 目的分析新余市2013年-2015年甲型流感病毒M基因进化及金刚烷胺类耐药情况,为临床治疗和疾病防控提供依据。方法随机选择30株甲型流感病毒,经核酸提取、one-step RT-PCR扩增M基因片段和双向序列测定,通过DNAStar5.0和Mage5.0序列分析软件获得有关数据。结果在M基因上,16株H3N2毒株、14株新型H1N1毒株核苷酸序列的同源性分别>99.2%、>98.8%,且与相应的疫苗推荐株高度同源,H3N2毒株与新型H1N1毒株与相应的疫苗推荐株相比较,大部分(13/16)H3N2毒株未发生变异,所有新H1N1毒株均发生1~2个氨基酸替换;30株新余市甲型流感毒株M2蛋白第31位氨基酸位点均由丝氨酸(S)突变为天冬酰胺(N)。结论新余市2013年至2015年甲型流感毒株相同亚型间M基因同源性较高,30株甲型流感毒株均具有金刚烷胺类药物抗性,对流感病毒耐药性问题应该给予重视。
- 付倩文奇周银古刘琴宋利军熊英李建雄
- 关键词：流感病毒M基因进化同源性
- 2013年-2014年新余市甲型H3N2流感病毒HA1基因特性分析被引量：5
- 2015年
- 目的了解新余市流行的H3N2亚型流感病毒的HA1基因变异特征与规律、进化趋势和当前疫苗对其的预防效果。方法选取新余市2013年-2014年通过狗肾传代细胞（MDCK）培养分离到的甲型H3N2流感毒株12株,提取病毒RNA,反转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增HA1基因片段,用DNAStar 5.0、Mega 6.0生物软件对序列进行处理和特性分析。结果 2013年-2014年新余市甲型H3N2出现活跃,共分离出132株。分析12株毒株的HA1基因,与疫苗株A/Perth/16/2009（H3N2）的核苷酸同源性为97.2%～97.5%,氨基酸替换数为14个～17个,涉及B区、E区2个抗原决定簇。与疫苗株A/Victoria/361/2011（H3N2）比较,核苷酸同源性为98.5%～98.9%,氨基酸替换数为9个～12个,除A/Jiangxi Yushui/137/2014和A/Jiangxi Yushui/1142/2014外,均发生了144位A区和158位B区抗原决定簇区的变异。毒株间同源性为99%～100%。结论 2013年-2014年新余市流行的甲型H3N2流感病毒的抗原性和基因特性发生了改变,近期的2株疫苗株对其的保护效果均较差,有必要更换疫苗株。
- 刘瑞弘潘虹文奇刘琴熊英
- 关键词：血凝素基因
- 新余市2013年-2014年B型Yamagata系流感病毒HA1基因特性分析被引量：3
- 2015年
- 目的了解2013年-2014年新余市Yamagata系乙型流感病毒的序列特性和变异特点,分析WHO推荐流感疫苗株对人体的保护情况。方法选取新余市2013年-2014年通过狗肾传代细胞（MDCK）培养分离到的Yamagata系乙型流感毒株9株,提取病毒RNA,反转录-聚合酶链式反应（RT-PCR）扩增HA1基因片段,对序列进行处理和特性分析。结果 2013年-2014年的乙型流感病毒均为B型Yamagata系。9株流感毒株HA1区与疫苗推荐株B/Wisconsin/01/2010的核苷酸同源性为97.8%～99.4%,氨基酸替换数为3个～4个,其中8株均在3个相同的氨基酸位点发生变异;与代表株B/Yamagata/16/1988的核苷酸同源性为94.4%～96.2%。B/Jiangxi Yushui/1221/2014与疫苗株B/Massachusetts/02/2012的核苷酸同源性为99.3%,氨基酸替换数为3个。结论新余市2013年-2014年B型Yamagata系流感病毒都发生了抗原性变化,WHO推荐的2011年-2012年疫苗对88.89%的B型Yamagata系流感仍有预防效果,当年度的疫苗株能很好地预防另外11.11%流感的流行。
- 潘虹刘瑞弘文奇刘琴周银古熊英
- 关键词：乙型流感病毒血凝素基因进化分析
- 新余市新发现HIV感染者CD_4^+T淋巴细胞检测结果分析被引量：1
- 2014年
- 艾滋病病毒（Human immunodeficiency virus,HIV）侵入人体后不断复制,造成CD＋4T淋巴细胞（简称CD4细胞）数量持续减少,产生细胞免疫缺陷,从而增加各种机会性感染。新余市通过对CD4细胞计数统计分析,评价该地区新发现HIV感染者的机体免疫功能情况,判断疾病进程,以便及时开展治疗工作。
- 潘虹毛尚根刘芳宇文奇晏火兰周银古
- 关键词：艾滋病病毒感染者新发病例
- 应用RT-PCR-RFLP鉴别2014年新余市麻疹病毒感染病例被引量：1
- 2019年
- 目的引进一种区别麻疹病毒疫苗株与野生株的简单方法,用以检测新余市麻疹病毒感染病例标本。方法新余市8份麻疹病毒感染病例标本和1株S191麻疹疫苗株经逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒H基因部分片段,应用限制性内切酶片段长度多态性分析(RFLP)方法进行酶切分析。结果 S191麻疹疫苗株被AflII限制性酶酶切成2个片段,8份麻疹病毒感染病例标本均未酶切消化。结论新余8例麻疹病例全部为麻疹野病毒所感染;RT-PCR-RFLP方法简单、有效,非常适合条件受限的实验室使用。
- 文奇廖秀海潘虹胡传琛龚甜李健雄
- 关键词：麻疹病毒疫苗株野生株
- 新余市2012年-2013年流感流行特征及监测被引量：1
- 2015年
- 目的了解新余市流感的流行规律,病毒型别及其活动水平,为流感监测预警提供科学依据。方法对流感监测哨点医院采集的流感样病例(ILI)的咽拭子标本进行流感核酸荧光RT-PCR检测,将检测阳性的标本接种于犬肾传代细胞(MDCK)进行病毒分离和鉴定,采用统计学方法分析结果。结果荧光RT-PCR阳性率、病毒分离阳性率在2012年分别是13.7%、16.9%,2013年分别是5.3%、51.9%;流感主要型别在2012年是B和季H3,在2013年是新H1和季H3;荧光RT-PCR阳性率在不同年龄组差异有统计学意义,但在不同性别、地区差异无统计学意义。结论新余市流感主要集中在每年冬、春季节;优势型别在A型、B型、A的亚型新H1、季H3之间转换;在不同年龄ILC中,中小学生和青壮年的流感阳性率最高。
- 文奇付倩丁勇宋利军刘琴潘虹
- 关键词：流感监测病毒分离
